高爽(遼寧省盤錦檢驗檢測中心,遼寧 盤錦 124080)
由于碳青霉烯類抗菌藥物的過度使用,耐藥腸桿菌科細菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)菌株的檢出率呈上升趨勢,產碳青霉烯酶菌株對碳青霉烯類抗菌藥物具有耐藥性,對幾乎所有的β-內酰胺類抗菌藥物都存在耐藥,CRE對全球的公共衛生安全都造成了威脅[1]。因此,快速、準確地檢測耐碳青霉烯類腸桿菌科細菌十分必要。目前,主要采用Carba NP試驗及碳青霉烯類失活試驗法檢測腸桿菌科細菌碳青霉烯酶,但以上檢測方法只能檢測碳青霉烯酶的活性,不能區分碳青霉烯酶的類型,因此,亟需找到一種能快速、準確對碳青霉烯酶類型進行區分的檢測方法[2]。Carba plus紙片法通過酶抑制劑原理,通過讀取抑菌圈直徑區分碳青霉烯酶的類型[3]。碳青霉烯類抗生素是一種常見的廣譜抗菌藥物,由于廣泛應用,耐碳青霉烯類抗生素的細菌不斷增加,耐藥機制主要為可水解的碳青霉烯類抗生素β-內酰胺酶-碳青霉烯酶產生[4]。為了進一步研究耐碳青霉烯類菌株的耐藥原因,本研究旨在探討Carba plus紙片法檢測耐藥腸桿菌科細菌的碳青霉烯酶類型的評估能力及與β-內酰胺酶耐藥基因的關系。
1.1 研究對象 收集醫院2018年6月-2020年6月臨床分離非重復的65株耐碳青霉烯類腸桿菌科細菌為研究組,另選取同期分離的68株碳青霉烯類敏感腸桿菌科細菌為對照組。
1.2 儀器與試劑 儀器:VITEK-MS質譜儀和VITEK-2 Compact全自動微生物鑒定藥敏儀、CFX96熒光定量PCR擴增儀、Bio-Rad ChemiDoc XRS凝膠成像系統、GNP29270型恒溫孵育箱、BG-subMIDI(v)可見光電泳透射儀。
試劑:VITEK-MS CHCA基質液、血瓊脂平皿和亞胺培南藥敏紙、M-H藥敏瓊脂平皿、Mastdiscs combi Carba plus試劑盒、Premix TaqTM酶、DLl000 DNA Marker和DL2000 DNA Marker、PCR 擴增試劑、培養基。
1.3 方法
1.3.1 Carba plus紙片法檢測 根據紙片擴散法的藥敏試驗操作步驟,配制0.5麥氏濁度新鮮菌懸液,在MH藥敏平皿均勻涂布上,將Carba plus紙片(A-E)、亞胺培南紙片均貼在藥敏平板上,使各紙片間保持足夠的距離,以便出現清晰的抑制區。于35℃條件下孵育18-24h,對每張紙片的抑菌圈直徑進行測量。
1.3.2 耐藥基因檢測 通過煮沸法對細菌DNA模板進行提取,用特異性引物對碳青霉烯酶基因、β-內酰胺酶耐藥基因進行擴增。
1.3.3 PCR檢測 PCR體系:Taq PCR Master Mix體系12.5tA,ddH2O 9.5pL,上游引物和下游引物各1弘L,模板DNA1 td。
PCR反應條件:于94℃條件下進行預變性5min;于94℃條件下變性30s,退火30s;于72℃條件下進行延伸;重復變性、退火、延伸,30個循環;于72℃條件下繼續延伸7min。將擴增產物行瓊脂糖凝膠電泳,再放凝膠成像上進行觀察。
1.4 Carba plus紙片法檢測碳青霉烯酶的評價 以PCR耐藥基因序列分析作為診斷金標準[5],比較Carba plus紙片法檢測碳青霉烯酶的診斷效能。
診斷敏感度=真陽性例數/(真陽性例數+假陰性例數)×100%,診斷特異度=真陰性例數/(真陰性例數+假陽性例數)×100%,診斷準確度=(真陽性例數+真陰性例數)/總例數×100%。陽性預測值(%)=真陽性/(真陽性+假陽性)×100%。陰性預測值(%)=真陰性/(真陰性+假陰性)×100%。
1.5 統計學分析 以SPSS20.0軟件行數據分析,計數資料以[n(%)]形式顯示,行χ2檢驗。
2.1 Carba plus紙片法檢測結果與耐藥基因序列分析結果對比 65株耐碳青霉烯類腸桿菌科細菌菌株Carba plus紙片法檢測結果:KPC陽性37株,MBL陽性21株,OXA-48陽性4株,未檢測出產酶類型3株;68株碳青霉烯類敏感腸桿菌科細菌菌株均未檢測出產酶類型。見表1。

表1 Carba plus紙片法檢測結果與耐藥基因序列分析結果對比
2.2 Carba plus紙片法與PCR耐藥基因序列分析檢測KPC酶的結果比較 以耐藥基因檢測作為檢測碳青霉烯酶類型的金標準,得到Carba plus紙片法預測腸桿菌科細菌產KPC酶的準確度為94.74%,敏感度為84.44%,特異度為100.00%,陽性預測值為84.44%,陰性預測值為100.00%。見表2。

表2 Carba plus紙片法與PCR耐藥基因序列分析檢測KPC酶的結果比較
2.3 Carba plus紙片法與PCR耐藥基因序列分析檢測MBL酶的結果比較 以耐藥基因檢測作為檢測碳青霉烯酶類型的金標準,得到Carba plus紙片法預測產MBL酶的準確度為97.74%,敏感度為100.00%,特異度為97.37%,陽性預測值為86.36%,陰性預測值為100.00%。見表3。

表3 Carba plus紙片法與PCR耐藥基因序列分析檢測MBL酶的結果比較
2.4 Carba plus紙片法與PCR耐藥基因序列分析檢測OXA-48酶的結果比較 以耐藥基因檢測作為檢測碳青霉烯酶類型的金標準,得到Carba plus紙片法預測產OXA-48酶的準確度為99.25%,敏感度為100.00%,特異度為99.23%,陽性預測值為100.00%,陰性預測值為100.00%。見表4。

表4 Carba plus紙片法與PCR耐藥基因序列分析檢測OXA-48酶的結果比較
2.5 耐藥基因擴增結果 65株CRE中有24株菌產碳青霉烯酶,其中18株CRE同時攜帶其他β-內酰胺酶耐藥基因;65株CRE中有39株產CTX-M型ESBL酶,3株CRE產DHA-1型質粒介導的AmpC酶。
碳青霉烯類抗生素是抗菌譜最廣、抗菌活性最強的非典型β-內酰胺抗生素,對產超廣譜β-內酰胺酶及AmpC酶的細菌具有較強的抗菌作用[6-8]。由于CRE的耐藥形勢十分嚴峻,且耐藥機制較多樣,發生CRE感染會導致嚴重的后果,對CRE菌株進行快速、正確的診斷,有助于區別產酶類型,有助于明確感染暴發的流行本質[9]。Carba plus紙片法是一種鑒定產碳青霉烯酶類型的新方法,通過酶抑制劑原理,讀取抑菌圈直徑,以對KPC型、MBLs型、OAX-48型碳青霉烯酶進行區別,在鑒定產酶時還能夠分析菌株的產酶類型,為控制醫院感染提供實驗室依據[10-11]。隨著碳青霉烯類抗生素的廣泛應用,耐藥的細菌不斷增加,認為其耐藥機制與碳青霉烯酶的產生有關[12]。
本研究結果顯示,Carba plus紙片法預測產KPC酶的敏感度僅為84.44%。考慮原因可能與KPC基因的編碼質粒出現轉移有關[13]。Carba plus紙片法預測產MBL酶的敏感度、陰性預測值均為100.00%,但陽性預測值僅為86.36%。考慮原因與選取的產MBL酶菌株的基因型種類不全有一定的關系[14]。Carba plus紙片法預測產OXA-48酶的特異度為99.23%,沒有達到100.00%。考慮原因可能為Carba plus紙片中有替莫西林,替莫西林使肺炎克雷伯桿菌產生耐藥,出現假陽性,使產OXA-48酶的特異度變低[15]。
綜上所述,Carba plus紙片法可準確區別CRE菌株的產酶類型;CRE的碳青霉烯酶的耐藥機制為攜帶KPC型的碳青霉烯酶基因,與β-內酰胺酶耐藥基因有關。