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紅藤中sargentol對PC12細胞的神經保護作用和分子對接研究

2022-01-05 08:11:18孫惠芳張騰騰安鳳霞耿春葉聞崇煒
天然產物研究與開發 2021年12期
關鍵詞:模型

湯 建,孫惠芳,張騰騰,安鳳霞,耿春葉,聞崇煒*

1亳州學院中藥學院,亳州 236800;2江蘇大學藥學院,鎮江 212013

神經元的損傷及死亡涉及的環節廣泛,主要有氧化應激、神經炎癥、興奮性神經毒性、鈣離子(Ca2+)超載、線粒體損傷、凋亡蛋白、自噬等[1,2]。神經保護是神經系統疾病防治的關鍵環節,姜黃素、白藜蘆醇、人參皂苷等天然產物通過調節ROS、抗炎、抑制興奮性神經毒性等機制發揮了良好的神經保護作用,在抗缺血性腦損傷、提高學習認知能力等方面有著良好的應用前景[2,3]。

紅藤(Sargentodoxacuneata(Oliv.) Rehd.et Wils.)是我國特有的一種植物,具有解毒消癰,活血止痛,祛風除濕等功效[4]。紅藤中的化學成分主要有酚酸類、苯丙素、木脂素等,其提取物具有抗炎、抗氧化、神經保護等藥理活性[5]。本實驗室在前期研究中從野生紅藤中分離到苯丙醇苷類化合物sargentol(6 kg的植物藤莖中分離得到190 mg),但關于該化合物藥理活性的報道較少[6]。本文擬評價sargentol對PC12細胞損傷模型的保護作用,并基于分子對接技術對可能的作用機制進行討論,以期為發現中藥來源的神經保護活性成分提供科學依據。

1 材料與方法

1.1 材料與試劑

Sargentol(見圖1)由本實驗室自制,純度≥95%;1640完全培養基和新生牛血清購于維森特生物技術(南京)有限公司;ROS檢測試劑盒購于上海碧云天生物技術有限公司;PC12低分化細胞由江蘇大學藥學院高靜教授實驗室提供;其他化學試劑均為分析純;AutoDock Tools 1.5.6和AutoDock Vina(美國The Scripps Research Institute);PyMOL(TM) 1.7.4.5 Edu(美國Schrodinger,LLC公司)和Discovery Studio 2016 client(美國BIOVIA公司)。

圖1 Sargentol化學結構Fig.1 The chemical structure of sargentol

1.2 Sargentol對PC12細胞增殖的影響

生長期PC12細胞用1640培養基懸浮,接種至96孔板,每孔2×105個,37 ℃,5% CO2培養箱中培養24 h。吸去上清,加入sargentol(培養基溶解,含0.2% DMSO,終濃度均為0.1、1、10 μmol/L),繼續孵育24 h。加20 μL的MTT(5 mg/mL)再孵育3 h。吸去上清,每孔加入100 μL的DMSO溶解,得紫色溶液,采用酶標儀(570 nm)檢測吸光度(A),計算細胞存活率,每組設立3個復孔。

1.3 MTT法測定損傷PC12細胞的存活率

生長期PC12細胞接種至96孔板,細胞密度6×103個/孔,37 ℃,5% CO2細胞培養箱中培養24 h。吸去上清,加入sargentol溶液,終濃度均為0.1、1、10 μmol/L,繼續孵育5 h。加入不同的化學試劑(正常組只加培養基),繼續孵育24 h。加20 μL的MTT(5 mg/mL)再孵育3 h。吸去上清,每孔加入100 μL的DMSO溶解產生的固體至紫色溶液,酶標儀570 nm處檢測吸光度(A),計算細胞存活率,每組設立3個復孔。所加的化學試劑分別是H2O2(0.5 mmol/L)、魚藤酮(rotenone,10 μmol/L)、NaN3(50 μmol/L)。

1.4 DCFH-DA探針檢測細胞內ROS水平

參照文獻[7],PC12細胞接種至24孔板中,4×104個/孔,37 ℃,5% CO2條件下培養12 h。Sargentol(0.1、1、10 μmol/L)預處理5 h后再加入H2O2(0.5 mmol/L)損傷1 h。PBS洗滌2次,每孔加入終濃度為10 μmol/L含DCFH-DA的無血清培養基20 μL。培養箱中黑暗條件下孵育20 min,PBS洗滌細胞3次,熒光酶標儀激發波長488 nm,發射波長525 nm測定DCF熒光強度。計數細胞后根據細胞數及各實驗組熒光OD值計算每組細胞的DCF熒光強度/104細胞。

1.5 靶標蛋白結構的獲取和預處理

通過檢索文獻[1-3,7-9],選定14個蛋白(見表1)為對接受體,并從PDB數據庫(http://www.rcsb.org)下載其PDB文件。將蛋白結構導入AutoDock Tools 1.5.6中,刪除原配體,水分子,加氫,保存為pdbqt格式,以備分子對接。

表1 神經保護相關蛋白靶點

1.6 Sargentol與受體的分子對接

Sargentol化學結構經能量最小化處理后,保存為pdbqt格式,用AutoDock Vina與14種選定的靶點蛋白(受體)進行半柔性對接,根據對接打分值來確定潛在的作用靶點。原配體與受體重新對接,其結合能打分值為閾值。通常認為均方根偏差(RMSD)在2 ?范圍內。

2 結果

2.1 Sargentol對PC12細胞增殖的影響

如圖2所示,sargentol在0.1和1 μmol/L濃度時明顯促進PC12細胞增殖,細胞存活率與正常組(Ctrl,以100%計)分別增加21.6%和11.5%。而采用較高濃度(10 μmol/L)sargentol干預PC12細胞時,其細胞存活率反而較正常組低4.7%。但三個濃度下細胞存活率都高于95%,所以后續的研究中均選用0.1、1、10 μmol/L三個濃度。

圖2 Sargentol對PC12細胞存活率的影響Fig.2 Effect of sargentol on PC12

2.2 Sargentol對H2O2致PC12細胞損傷的保護作用

如圖3所示,H2O2(0.5 mmol/L,模型組)對PC12細胞具有顯著的損傷作用,與正常組相比,PC12細胞存活率下降至42.5%(P< 0.01)。Sargentol(0.1、1、10 μmol/L)預處理后,PC12細胞存活率分別增加至正常組的73.8%、76.7%和57.9%(Ctrl組以100%計)。10 μmol/L的sargentol組的存活率反而低于1 μmol/L組,這與“2.1”項下數據一致,可能是較高濃度的sargentol反而對PC12細胞增殖具有一定的抑制作用。

圖3 Sargentol對H2O2損傷PC12細胞存活率的影響Fig.3 Effect of sargentol on the survival rate of PC12 cells injured by = 3)注:與正常組比較,##P < 0.01;與模型組比較,*P < 0.05,**P < 0.01。Note: Compared with Ctrl,##P < 0.01;Compared with model group,*P < 0.05,**P < 0.01.

2.3 Sargentol對魚藤酮致PC12細胞損傷的保護作用

如圖4所示,10 μmol/L的魚藤酮對PC12細胞有顯著損傷,與正常組比較,細胞存活率下降至48.4%(P< 0.01)。而sargentol(0.1、1、10 μmol/L)預處理后,PC12細胞存活率分別增加至正常組的51.9%、65.2%和72.9%。

圖4 Sargentol對魚藤酮損傷PC12細胞存活率的影響Fig.4 Effect of sargentol on the survival rate of PC12 cells injured by = 3)注:與正常組比較,##P < 0.01。Note: Compared with Ctrl,##P < 0.01.

2.4 Sargentol對NaN3致PC12細胞損傷的保護作用

如圖5所示,50 μmol/L的NaN3對PC12細胞有顯著損傷,與正常組比較,細胞存活率下降至44.9%(P< 0.01)。而sargentol(0.1、1、10 μmol/L)預處理后,PC12細胞存活率分別增加至正常組的61.2%、69.1%和73.6%。

圖5 Sargentol對NaN3損傷PC12細胞存活率的影響Fig.5 Effect of sargentol on the survival rate of PC12 cells injured by = 3)注:與正常組比較,#P < 0.05。Note: Compared with Ctrl,#P < 0.05.

2.5 Sargentol對H2O2損傷PC12細胞內ROS水平的影響

氧化應激(ROS)效應是細胞損傷或凋亡常見的原因[7-9],本實驗中以H2O2致PC12細胞損傷模型為例,采用DCFH-DA染料法檢測sargentol對細胞內ROS水平的影響。如圖6所示,PC12細胞與H2O2共同孵育1 h后,細胞內ROS水平(以1×104個細胞的DCF熒光密度值計)顯著增加至正常組的3.5倍(P< 0.01)。與H2O2組相比,0.1、1、10 μmol/L濃度的sargentol分別降低ROS水平6.5%、10.7%、27.2%。Sargentol能劑量依賴性地降低細胞內ROS水平。Sargentol對ROS效應的抑制是保護H2O2致PC12細胞損傷的重要機制之一。

圖6 Sargentol對H2O2損傷PC12細胞內ROS水平的影響Fig.6 Effect of sargentol on ROS level in PC12 cells injured by H2O2 = 3)注:與正常組比較,##P < 0.01;與模型組比較,**P < 0.01。Note: Compared with Ctrl,##P < 0.01;Compared with model group,**P < 0.01.

2.6 分子對接結果

本研究將原配體、sargentol分別與14個蛋白進行對接,均選擇第一行(即dist from rmsd l.b.值和best mode rmsd u.b.值均為0)的打分值。具體結果見表2。

表2 Sargentol與14種蛋白受體的結合能

根據結合能和比值R(見表2)可知,排名前五的受體分別是TLR2(5D3I)、iNOS(2Y37)、PI3K(1E7V)、Keap1(4L7B)和IKKβ(3RZF),這也是sargentol潛在的作用靶點。雖然Caspase-1(1RWN)與化合物的結合能僅有-5.9 kcal/mol,但與其閾值相同,后續的研究中也值得關注。Sargentol與5D3I、2Y37的結合能力最強,其打分值均為-7.7 kcal/mol。3D圖顯示sargentol的分子剛好卡在蛋白5D3I和2Y37的凹槽內(見圖7A和7B)。圖7C顯示,sargentol與VAL348等10余種氨基酸殘基之間存在范德華力;其苯環與LEU160形成Pi-Alkyl鍵,與PHE322、PHE349形成Pi-Pi鍵;糖的3-OH的O與LYS347形成氫鍵,但糖4-OH的H與ILE319以及6-OH的O與LEU317之間存在斥力。圖7D顯示,sargentol與SER236等10種氨基酸殘基之間存在范德華力;三元環的O與ASN364、醇羥基的H與TYR483、糖3-OH的H與TRP366之間形成氫鍵;苯環與TRP188形成Pi-Pi鍵,與CYS194形成Pi-Donor氫鍵;但糖3-OH的H與MET368之間存在斥力。化合物sargentol與周圍的氨基酸殘基結合緊密,存在著作用明顯的作用力,有助于與靶點蛋白的結合。

圖7 Sargentol與5D3I(A、C)和2Y37(B、D)的分子對接圖Fig.7 Docking of sargentol with proteins 5D3I (A,C) and 2Y37 (B,D)

3 討論與結論

魚藤酮損傷PC12細胞常用于建立帕金森病的細胞模型,而NaN3損傷PC12細胞模型常用于抗阿爾茨海默病化合物的初步篩選[9,10]。本文中sargentol對魚藤酮和NaN3引起的PC12細胞損傷無明顯抑制(P> 0.05),而對H2O2損傷模型最為敏感,對H2O2引起的PC12細胞內ROS亦有顯著抑制作用。

為了進一步研究sargentol的神經保護作用機制,本文中采用AutoDock Vina軟件虛擬篩選其結合靶點蛋白。考慮到H2O2損傷的細胞模型中,ROS效應是細胞損傷或凋亡常見的原因[9],因此,我們選定了ROS效應以及炎癥相關蛋白為主的14種蛋白進行分子對接。

根據結合能和比值R確定了sargentol潛在的作用靶點TLR2(5D3I)、iNOS(2Y37)、PI3K(1E7V)、Keap1(4L7B)和IKKβ(3RZF)。其中Keap1-Nrf2-ARE信號通路是細胞防御ROS損傷的最重要機制之一[8],Keap1(4L7B)與sargentol的結合能為-7.2 kcal/mol,提示sargentol對蛋白Keap1可能存在較強的激活能力,具有潛在的基于Keap1-Nrf2-ARE信號通路的抗ROS作用,這一推測與實驗“2.2”項下數據一致。TLR2(5D3I)、iNOS(2Y37)和PI3K(1E7V)是ROS和炎癥的重要調節蛋白[11,12],本次分子對接中與sargentol的結合能分別是-7.7、-7.7和-7.3 kcal/mol,特別是前者,結合強度超過原配體的結合能(-7.5 kcal/mol)。提示sargentol可能是通過抑制氧化應激—炎癥—氧化應激循環發揮神經保護作用。前期研究中發現sargentol能顯著抑制小鼠耳腫脹[6],其抗炎活性與本次分子對接預測一致。根據結合能,sargentol在抑制興奮性神經毒性、凋亡基因調節方面的能力較弱,以后的研究中將會關注sargentol的抗炎方面的活性與機制研究。

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