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長(zhǎng)鏈非編碼RNA同源盒基因 A11反義RNA在急性淋巴細(xì)胞白血病患兒骨髓中的表達(dá)及意義

2021-12-20 03:10:54白東琴白玉田富香
癌癥進(jìn)展 2021年20期

白東琴,白玉,田富香

延安市人民醫(yī)院兒內(nèi)科,陜西 延安 716000

急性淋巴細(xì)胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)是血液系統(tǒng)常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,起源于造血干細(xì)胞和造血祖細(xì)胞,其特征為未成熟的白細(xì)胞大量聚集在血液、骨髓、淋巴結(jié)、脾臟及其他器官。人

ABL

基因位于9號(hào)染色體長(zhǎng)臂,9號(hào)染色體長(zhǎng)臂上

C-ABL

原癌基因易位至22號(hào)染色體長(zhǎng)臂的斷裂點(diǎn)集中區(qū)(BCR),形成

BCR/ABL

融合基因。兒童ALL約占兒童急性白血病的80%,一般經(jīng)過(guò)規(guī)范化治療,患兒的長(zhǎng)期生存率為70%~80%,但ALL的復(fù)發(fā)率高,且一旦復(fù)發(fā)疾病進(jìn)展快,病死率高。目前普遍認(rèn)為,遺傳因素、環(huán)境影響、基因改變可能是導(dǎo)致ALL發(fā)生的危險(xiǎn)因素,但尚不清楚ALL的確切病因及發(fā)病機(jī)制。因此,尋找潛在的治療靶點(diǎn)成為當(dāng)前ALL的研究熱點(diǎn)。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一類(lèi)不編碼蛋白質(zhì)RNA,其長(zhǎng)度超過(guò)200個(gè)核苷酸。研究發(fā)現(xiàn),lncRNA的異常表達(dá)不僅可導(dǎo)致多種實(shí)體瘤,還也與白血病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。lncRNA同源盒基因A11反義RNA(lncRNA homeobox A11 antisense RNA,HOXA11-AS)是一種位于染色體7p15.2上的新型lncRNA。研究顯示,lncRNA HOXA11-AS與多種惡性腫瘤有關(guān),但尚無(wú)與急性淋巴細(xì)胞白血病的研究報(bào)道。本研究探討HOXA11-AS在ALL患兒骨髓中的表達(dá)及意義,現(xiàn)報(bào)道如下。

1 資料與方法

1.1 一般資料

選取2017年3月至2021年3月延安市人民醫(yī)院收治的初治ALL患兒。納入標(biāo)準(zhǔn):均經(jīng)骨髓細(xì)胞學(xué)、免疫分型檢查、分子生物學(xué)及遺傳學(xué)檢查確診。排除標(biāo)準(zhǔn):初診前接受過(guò)化療或ALL相關(guān)治療。依據(jù)納入和排除標(biāo)準(zhǔn),本研究共納入108例初治ALL患兒,其中男66例,女42例;年齡3~12歲,平均(6.27±1.95)歲;病理類(lèi)型:B淋巴細(xì)胞型(BALL)67例,T淋巴細(xì)胞型(T-ALL)41例。同期選取本院收治的57例非腫瘤性疾病(血友病、免疫性血小板減少癥等)患兒,其中男34例,女23例;年齡4~12歲,平均(7.01±1.62)歲。三組患兒性別、年齡比較,差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(

P

>0.05)。取108例初治ALL患兒的骨髓標(biāo)本和57例非腫瘤性疾病患兒的骨髓標(biāo)本。

1.2 治療方法

所有初治ALL患兒均依據(jù)《兒童急性淋巴細(xì)胞白血病診療建議(第四次修訂)》中的治療方案進(jìn)行治療(以化療為主),均接受2個(gè)療程的治療,治療結(jié)束后評(píng)價(jià)患兒的治療效果。

1.3 實(shí)驗(yàn)方法

1.3.1 主要試劑和儀器人淋巴細(xì)胞分離液購(gòu)自北京索萊寶科技有限公司,Trizol試劑購(gòu)自美國(guó)Invitrogen公司,HOXA11-AS引物購(gòu)自上海生工生物工程股份有限公司,Prime Script逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)試劑盒和SYBR Premix Ex-Taq Ⅱ試劑盒購(gòu)自日本Takara公司。NanoDrop 2000C超微量分光光度計(jì)購(gòu)自美國(guó)Thermo公司,7300型實(shí)時(shí)聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增儀購(gòu)自美國(guó)ABI公司。

1.3.2 實(shí)時(shí)RT-PCR法檢測(cè)骨髓標(biāo)本HOXA11-AS的相對(duì)表達(dá)量 取108例初治ALL和57例非腫瘤性疾病患兒治療前的骨髓液2 ml,乙二胺四乙酸(ethylenediaminetetraacetic acid,EDTA)抗凝處理,加入等量磷酸鹽緩沖液(phosphate buffered solution,PBS)充分混勻,再加入等量人淋巴細(xì)胞分離液,3000 r/min離心10 min,吸取中間層的單個(gè)核細(xì)胞,轉(zhuǎn)移至新的離心管中,加入PBS洗滌1次后,使用Trizol試劑提取總RNA,應(yīng)用NanoDrop 2000C超微量分光光度計(jì)檢測(cè)RNA濃度和質(zhì)量。根據(jù)Prime ScriptRT-PCR試劑盒說(shuō)明書(shū)將RNA逆轉(zhuǎn)錄成互補(bǔ)DNA(complementary DNA,cDNA),反應(yīng)過(guò)程:42℃15 min,85℃10 s,然后參照SYBR Premix Ex-Taq Ⅱ試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行RT-PCR反應(yīng),反應(yīng)總體積為20μl,其中包含3μl稀釋和預(yù)擴(kuò)增的cDNA、上下游引物各0.25 μl,10 μl SYBR預(yù)混料ExTaq和1μl熒光探針、5.5μl無(wú)RNA酶水,反應(yīng)條件:95℃預(yù)反應(yīng)10 min,然后95 ℃ 15 s、60 ℃ 1 min,共40次循環(huán)。所有樣本均設(shè)3個(gè)復(fù)孔,并計(jì)算每個(gè)樣本的平均值,以3-磷酸甘油醛脫氫酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)為內(nèi)參,使用生物系統(tǒng)軟件RQ Manager v1.2.1處理數(shù)據(jù),采用2方法計(jì)算HOXA11-AS的相對(duì)表達(dá)量。HOXA11-AS上游引物:5'-GCCACAUGCACCCGCCUGCUGAA-3',下游引物 :5'-CAUCAGACACAGUCCACUAUGCG-3';

GAPDH

上 游引物:5'-GGAGCGAGATCCCTCCAAAAT-3';下游引物:5'-GGCTGTTGTCATACTTCTCATGG-3'。

1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

2 結(jié)果

2.1 HOXA11-AS相對(duì)表達(dá)量的比較

108例初治ALL患兒骨髓HOXA11-AS的相對(duì)表達(dá)量為(4.79±1.08),明顯高于非腫瘤性疾病患兒的(1.13±0.38),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(

t

=24.759,

P

=0.000),其中B-ALL型初治ALL患兒骨髓HOXA11-AS的相對(duì)表達(dá)量為(4.26±0.93),明顯低于T-ALL型患兒的(5.66±1.33),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(

t

=6.429,

P

=0.000)。108例初治ALL患兒經(jīng)2個(gè)周期的化療后完全緩解46例,未完全緩解62例,完全緩解患兒HOXA11-AS的相對(duì)表達(dá)量為(1.46±0.35),明顯低于未完全緩解患兒的(3.28±0.94),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(

t

=3.262,

P

=0.000),且完全緩解和未完全緩解患兒骨髓HOXA11-AS的相對(duì)表達(dá)量均明顯低于初治ALL患兒的(4.79±1.08),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(

F

=7.203,

P

=0.000)。

2.2 不同臨床特征初治ALL患兒骨髓HOXA11-AS相對(duì)表達(dá)量的比較

不同性別、年齡、染色體核型、原始細(xì)胞比例、白細(xì)胞計(jì)數(shù)、血紅蛋白水平、血小板計(jì)數(shù)、

WT1

基因表達(dá)情況初治ALL患兒骨髓HOXA11-AS相對(duì)表達(dá)量的比較,差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(

P

>0.05);

BCR/ABL

融合基因陽(yáng)性表達(dá)初治ALL患兒骨髓HOXA11-AS的相對(duì)表達(dá)量,明顯高于

BCR/ABL

融合基因陰性表達(dá)患兒,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(

P

<0.01)。(表1)

表1 不同臨床特征初治ALL患兒骨髓HOXA11-AS相對(duì)表達(dá)量的比較( n=108)

3 討論

ALL是由于造血干細(xì)胞惡性增殖、凋亡受阻導(dǎo)致的原始與幼稚淋巴細(xì)胞分化受阻,抑制正常的造血功能,侵犯髓外器官的血液系統(tǒng)常見(jiàn)惡性疾病之一。雖然經(jīng)過(guò)規(guī)范化治療,ALL的緩解率較高,但復(fù)發(fā)率也較高,且疾病一旦復(fù)發(fā),進(jìn)展快、病死率極高。因此,探討ALL的發(fā)病機(jī)制和耐藥機(jī)制對(duì)改善ALL的治療效果具有重要意義。

lncRNA曾被認(rèn)為是“暗物質(zhì)”,但隨著研究的不斷深入,越來(lái)越多的證據(jù)表明這些“暗物質(zhì)”具有極為重要的生物學(xué)功能。研究顯示,lncRNA的異常表達(dá)可導(dǎo)致多種實(shí)體瘤,如肺癌、肝癌、乳腺癌、胃癌、胰腺癌等,且lncRNA的異常表達(dá)也與白血病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。有研究報(bào)道,ALL患者骨髓細(xì)胞中存在lncRNA的異常表達(dá),甚至可能導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞耐藥。有研究發(fā)現(xiàn),lncRNA鋅指E-盒結(jié)合同源異形盒1-反義鏈1(zinc finger E-box binding homeobox 1 antisense 1,ZEB1-AS1)在B-ALL型患者骨髓中的表達(dá)明顯高于對(duì)照組,可與白細(xì)胞介素-11結(jié)合,并促進(jìn)其表達(dá),且高表達(dá)ZEB1-AS1的B-ALL型患者的預(yù)后更差。另有研究發(fā)現(xiàn),lncRNA RP11-137H2.4在ALL患兒中明顯高表達(dá),主要通過(guò)促分裂原活化的蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)級(jí)聯(lián)與細(xì)胞周期通路導(dǎo)致糖皮質(zhì)激素耐藥的發(fā)生。

HOXA11-AS是一種位于染色體7p15.2上的新型lncRNA。研究顯示,HOXA11-AS與多種惡性腫瘤有關(guān),但目前與ALL相關(guān)的研究報(bào)道較少。本研究結(jié)果顯示,初治ALL患兒骨髓HOXA11-AS的相對(duì)表達(dá)量明顯高于非腫瘤性疾病患兒,提示HOXA11-AS過(guò)表達(dá)可能與ALL的發(fā)生有關(guān)。本研究結(jié)果還顯示,B-ALL型初治ALL患兒骨髓HOXA11-AS的相對(duì)表達(dá)量明顯低于T-ALL型患兒,提示HOXA11-AS在不同類(lèi)型的ALL中的表達(dá)存在差異。進(jìn)一步結(jié)合初治ALL患兒的臨床資料分析發(fā)現(xiàn),不同性別、年齡、染色體核型、原始細(xì)胞比例、白細(xì)胞計(jì)數(shù)、血紅蛋白水平、血小板計(jì)數(shù)、

WT1

基因表達(dá)情況的初治ALL患兒骨髓HOXA11-AS的相對(duì)表達(dá)量均無(wú)明顯差異(

P

>0.05),但

BCR/ABL

融合基因陽(yáng)性表達(dá)初治ALL患兒骨髓HOXA11-AS的相對(duì)表達(dá)量,明顯高于

BCR/ABL

融合基因陰性表達(dá)患兒(

P

<0.01)。本研究結(jié)果還顯示,完全緩解患兒HOXA11-AS的相對(duì)表達(dá)量,明顯低于未完全緩解組和初治ALL患兒,提示HOXA11-AS的高表達(dá)可能與ALL患兒的不良預(yù)后有關(guān),但仍有待進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量再次證實(shí)。綜上所述,HOXA11-AS在初治ALL患兒骨髓中高表達(dá),且在T-ALL型患兒中高表達(dá),化療后完全緩解和

BCR/ABL

融合基因陰性表達(dá)的ALL患兒骨髓中HOXA11-AS的相對(duì)表達(dá)量更低,提示HOXA11-AS可能參與ALL的發(fā)生發(fā)展過(guò)程,并與ALL患兒的預(yù)后有一定關(guān)系。

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