廣東省東莞地區漢族人群20個STR基因座多態性及與22個群體FST遺傳距離的分析

李雪蕾 袁健彪 林漢光

1.廣東正航司法鑒定中心，廣東 東莞 523000；2.東莞市公安局大嶺山分局，廣東 東莞 523000；3.廣東醫科大學 ，廣東 東莞 523000

人類的遺傳與變異使每一個體的遺傳信息與他的親代、子代具有相似性，但每一個體又具備自身的遺傳特征。將這些遺傳學參數進行調查、統計、分析，為該地區的漢族人群的相關研究和司法鑒定提供基礎數據。

1 材料與方法

1.1樣本 1681例無關個體的樣本為廣東正航司法鑒定中心的2019-2020年案件的樣本，已征得當事人的同意，樣本類型為血樣或口腔拭子。

1.2設備與方法 所有樣本均采用Chelex法進行DNA提取。樣本中加入10% Chelex-100的混懸液 200μL， 置于eppendorf恒溫混勻儀上設置56℃恒溫震蕩孵育30min；劇烈振蕩5-10sec，98℃加熱8min； 12,000r/min離心3 min。取上清液用PowerPlex? 21 System人類熒光標記STR復合擴增檢測試劑(Promega公司)進行復合PCR擴增。用ABI3100遺傳分析儀(ABI公司)進行毛細管電泳和基因型分析。

1.3統計學分析 采用Arlequin v3.5、Powerstates軟件計算各基因座的隨機匹配概率(Pm)、個體識別率(DP)、多態性信息含量(PIC)、非父排除率(PE)、雜合度(He)、哈溫平衡P值(HWE-P)、遺傳距離矩陣。

2 結 果

2.1東莞地區漢族人群的STR基因座遺傳多態性及法醫遺傳學參數 用上述方法對1681位來自廣東東莞地區的漢族無關個體，進行20個常染色體STR基因座分析(含D3S1358、D1S1656、D6S1043、D13S317、Penta E、D16S539、D18S51、D2S1338、CSF1PO、Penta D、TH01、vWA、D21S11、D7S820、D5S818、TPOX、D8S1179、D12S391、D19S433、FGA)，獲得等位基因頻率分布、隨機匹配概率(Pm)、個體識別率(DP)、多態性信息含量(PIC)、非父排除率(PE)、雜合度(He)、哈溫平衡P值(HWE-P)、FST遺傳距離矩陣等參數(表1)。

表1 東莞地區漢族人群20個STR基因座的法醫遺傳學參數

2.2東莞地區漢族人群與22個群體FST遺傳距離分析(表2)

表2 本群體與22個群體FST遺傳距離矩陣各群體FST遺傳距離

3 結果討論

STR是人類基因組中存在的一類具有長度多態性的DNA序列，其具有信息量大、可選擇性強等特點，在法醫學的的個體識別與親子鑒定中應用價值十分高。本文研究了廣東省東莞地區1681例無關個體的20個STR基因座的多態性分布情況，經計算，此群體中的各基因座的基因型分布符合哈溫平衡定律(p>0.05)；本研究的20個基因座中，DP>0.8，而除D3S1358、TH01、TPOX外，其余17個基因座均具有高度多態性，具有較高的應用價值。

由于STR具有高度的多態性及穩定性，在進行不同民族或種族間的群體遺傳結構分析時，認為DP>0.8，PE>0.5時則具有較高的應用價值，而遺傳距離是評價群體間或者物種間的遺傳差異或者遺傳分化的最重要參數。表3清晰地列明東莞地區漢族人群與22個群體FST遺傳距離，從中可以看出不同的民族和地區相同的基因座的等位基因分布具有一定的差異性，因此，在日常鑒定工作中不同的人群之間的基因頻率數據不建議混用。