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利用二硫化鎢對單鏈DNA的特異性吸附實現(xiàn)microRNA的雙組份檢測

2021-11-18 09:30:08
廣州化工 2021年21期
關(guān)鍵詞:信號檢測

馮 程

(常德職業(yè)技術(shù)學(xué)院,湖南 常德 415000)

MicroRNA是一類由內(nèi)源基因編碼的長度約為22個核苷酸的非編碼單鏈RNA分子,它們在動植物中參與轉(zhuǎn)錄后基因表達(dá)調(diào)控,對人體生長、發(fā)育、生理和病理等過程具有重要作用。因此microRNA的特異性識別和定量檢測對于基礎(chǔ)性研究和臨床診斷都是極其有意義的。本實驗根據(jù)魯米諾及石墨烯量子點的ECL反應(yīng)機(jī)理,設(shè)計了以二硫化鎢納米片為感應(yīng)平臺的生物傳感器,實現(xiàn)了對microRNA的雙組份檢測。首先利用二硫化鎢納米片對堿基數(shù)約為22的DNA單鏈的特異性吸附作用將標(biāo)記了魯米諾與石墨烯量子點的單鏈DNA吸附在滴有二硫化鎢的電極表面,該兩種單鏈DNA便吸附在了電極表面。此時由于WS2對魯米諾和石墨烯量子點具有ECL增強(qiáng)作用,得到了一個較高的ECL信號。當(dāng)加入目標(biāo)物microRNA時,microRNA與單鏈DNA雜交形成雙鏈離開電極表面,WS2不能增強(qiáng)其發(fā)光,得到了一個較低的ECL信號[1-3]。根據(jù)以上原理得到的ECL信號變化與兩種目標(biāo)物的濃度成一定的線性關(guān)系從而達(dá)到了同時檢測兩種microRNA的目的。隨著對microRNA的深入研究以及microRNA在疾病診斷的生物學(xué)標(biāo)記和藥靶中作用的日益突出,該生物傳感器可能會給人類疾病的治療提供一個新的發(fā)展平臺[4-5]。

1 實 驗

1.1 儀器與試劑

MPI-A型毛細(xì)管電泳電化學(xué)發(fā)光檢測儀;CHI610A型電化學(xué)工作站;FA-2004A FA/JA系列電子天平;SB-80超聲清洗機(jī);TGL-20M高速臺式冷凍離心機(jī);移液槍;三電極體系:玻碳電極(GCE,Φ=4 mm)及其修飾電極為工作電極,飽和甘汞電極為參比電極,鉑電極為對電極;JBZ-12H磁力攪拌器用于石墨烯量子點的制備過程的攪拌。

氧化石墨烯;濃硝酸(分析純AR);濃硫酸(分析純AR);二硫化鎢;過硫酸鉀(分析純AR);魯米諾;磷酸緩沖溶液(PBS,0.1 mol/L,pH 7.4)。所用其它試劑均為分析純,實驗用水均為二次去離子水。

本實驗當(dāng)中用到的所有寡核苷酸序列均合成于大連寶生物公司,并保存在4 ℃待用。

1.2 microRNA生物傳感器的構(gòu)建

玻碳電極的預(yù)處理:玻碳電極(Φ=4 mm)經(jīng)0.3、0.05 μm的Al2O3糊拋光2 min后用蒸餾水沖洗干凈,再在二次去離子水中超聲洗滌3 min,清洗后的電極置于室溫下晾干備用。

電極的自組裝過程:用移液槍吸取15 μL WS2溶液滴于預(yù)處理后的玻碳電極表面,于烘箱中烘干成膜。在得到的修飾電極表面分別滴上10 μL DNA-LUMINOL 和5 μL DNA-GQDs,使其在36 ℃烘箱中孵育2 h后,將目標(biāo)物microRNA-141和microRNA-155各5 μL滴于該電極表面上,在36 ℃烘箱中孵育2 h。

1.3 測試方法與檢測原理

本實驗中循環(huán)伏安法(Cyclic Voltammetry or CV)檢測及ECL檢測均采用三電極體系:經(jīng)修飾的玻碳電極(Φ=4 mm)作為工作電極,飽和甘汞電極(SCE)作為參比電極,鉑電極為對電極。采用MPI-E型電致化學(xué)發(fā)光分析系統(tǒng)對修飾電極的電致化學(xué)發(fā)光行為進(jìn)行研究,在2 mL的0.1 mol/L PBS(pH=7.4)溶液中,掃描電位為-1.6~0.8 V,均以200 mV/s電位掃描速度施加循環(huán)伏安(CV)掃描模式,溫度均為室溫。

2 結(jié)果與討論

2.1 傳感器制備過程ECL表征

a.miRNA-141/miRNA-155/DNA-LUMINOL/DNA-GQDs/WS2/裸電極;b.DNA-LUMINOL/DNA-GQDs/WS2/裸電極圖1 傳感器制備過程ECL表征Fig.1 ECL characterization of the proposed biosensor

2.2 傳感器制備過程CV表征

通過測定修飾電極在5 mmol/LK3[Fe(CN)6]溶液中CV強(qiáng)度變化來表征傳感器的制備過程,如圖2所示:a曲線是裸電極的CV表征曲線,當(dāng)WS2孵育在電極表面時CV信號有所降低(曲線b),原因可能是由于WS2阻礙了電子傳遞。當(dāng)DNA-LUMINOL和DNA-GQDs孵育在電極表面時,由于DNA大分子會阻礙電子傳遞,因此電流值減小得到了c曲線。當(dāng)目標(biāo)物miRNA-141和miRNA-155孵育在電極表面時,由于RNA鏈阻礙了電子傳輸,使CV信號再次降低,得d曲線。

a.裸電極,b.WS2/裸電極,c.DNA-LUMINOL/DNA-GQDs/WS2/裸電極,d.miRNA-141/miRNA-155/DNA-LUMINOL/DNA-GQDs/WS2/裸電極圖2 傳感器制備過程CV表征Fig.2 CV characterization of biosensor preparation process

2.3 ECL生物傳感器的性能

2.3.1 ECL生物傳感器的ECL信號響應(yīng)特性

本實驗研究了在最優(yōu)條件下,ECL生物傳感器孵育了濃度為1×10-15、5×10-15、1×10-14、1×10-13、5×10-12、5×10-11mol/L的microRNA-141標(biāo)準(zhǔn)溶液,其ECL信號如圖8所示,電位在-1.6 V處的峰為141/GQDs的峰。實驗結(jié)果表明,對于microRNA-141來說,其檢測范圍在1×10-15-5×10-11mol/L時線性回歸方程為:y=2166.81 lgc+8400.14(c為microRNA-141的濃度),相關(guān)系數(shù)R2=0.9953,檢出限為1.7×10-16mol/L(S/N=3)。

在最優(yōu)條件下,該ECL生物傳感器孵育了濃度分別為5×10-16、5×10-15、1×10-14、1×10-13、5×10-12、5×10-11mol/L的microRNA-155標(biāo)準(zhǔn)溶液,其ECL信號如圖3所示,電位在0.8 V處的峰為155/luminol的峰。實驗結(jié)果表明,對于microRNA-155來說,其檢測范圍在5×10-16-5×10-11mol/L時線性回歸方程為:y=2203.01 lgc+8676.00(c為microRNA-155的濃度),相關(guān)系數(shù)R2=0.9963,檢出限為3.3×10-16mol/L(S/N=3)。

圖3 線性ECL圖Fig.3 Sensitivity of the proposed biosensor

2.3.2 實際樣品的檢測

為了進(jìn)一步證明microRNA在實際樣品中的應(yīng)用性,我們將從不同癌細(xì)胞中提取出的microRNA應(yīng)用于本傳感器中進(jìn)行雙組份檢測。我們選用了Hela細(xì)胞(子宮頸癌細(xì)胞)與22RV1(人類前列腺癌細(xì)胞)兩種細(xì)胞作為實際樣品檢測。結(jié)果如圖4所示,我們可以看出當(dāng)該生物傳感器孵育了Hela裂解液之后,由于microRNA-141在Hela中的低表達(dá),相對于空白樣品來說,得到了較高的ECL響應(yīng);而microRNA-155在Hela細(xì)胞中的高表達(dá),帶走了電極表面的DNA-luminol,因此得到了較低的ECL響應(yīng)。同理,由于microRNA-141在22RV1細(xì)胞中的高表達(dá),我們得到了較低的ECL響應(yīng),而microRNA-155在22RV1細(xì)胞中相對較低的表達(dá),得到了一個相對較高的ECL響應(yīng)值。由此證明我們設(shè)計的生物傳感器可以應(yīng)用于實際樣品的檢測。

圖4 在癌細(xì)胞裂解液中雙組份檢測miRNAFig.4 Multiplexed detection of miRNAs from different cancer cell Lysates

3 結(jié) 論

以ECL為基本檢測手段,我們進(jìn)行了microRNA雙組份檢測。本實驗以二硫化鎢納米片為感應(yīng)平臺,利用二硫化鎢納米片對單鏈DNA的特異性吸附作用將其吸附在滴有二硫化鎢的電極表面,其中單鏈DNA 1修飾有魯米諾,單鏈DNA 2修飾有石墨烯量子點。由于WS2對魯米諾和石墨烯量子點分別具有ECL增強(qiáng)效果,能得到一個較高的ECL信號。而當(dāng)加入目標(biāo)物時,microRNA-141和microRNA-155分別與單鏈DNA-LUMINOL和DNA-GQDs雜交形成雙鏈離開電極表面,WS2不能增強(qiáng)其發(fā)光,得到一個較低的ECL信號,且隨著目標(biāo)物的濃度變化,ECL信號與其呈現(xiàn)線性關(guān)系。該生物傳感器的響應(yīng)原理和制備方法簡單,并首次使用魯米諾和石墨烯量子點實現(xiàn)了microRNA的雙組份檢測,具有良好的選擇性和實際應(yīng)用性。

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