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結腸直腸癌B7S1表達與免疫浸潤的關系

2021-09-07 03:31:30王常剛馮浩然蔣奕玫施毅卿陳獻則宋子甲蔡東莉
外科理論與實踐 2021年4期
關鍵詞:結腸癌數據庫差異

王常剛, 劉 坤, 馮浩然, 蔣奕玫, 施毅卿, 陳獻則,宋子甲, 李 軍, 李 佑, 蔡東莉,趙 任,2

[1.上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院(北部院區)普外科,上海 201800;2.上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院外科,上海 200025;3.同濟大學附屬上海市第一婦嬰保健院臨床轉化醫學研究中心,上海 200011]

據《全球癌癥統計報告》統計,2018年全球新增結腸直腸癌 (colorectal cancer,CRC)病例超過180萬例,死亡88.1萬例[1]。其死亡率分別列于中國和美國惡性腫瘤死亡率第5位和第2位[2]。得益于術后輔助化療/新輔助治療和手術技術的改進,CRC病人的預后在過去幾十年中有所改善,但生存率仍不高。轉移性CRC病人的5年生存率僅為14%[3]。

B7S1是B7超家族成員之一,B7S1 mRNA(又稱VTCN1)在絕大多數人惡性腫瘤中異常表達。多種實體腫瘤中B7S1表達與腫瘤表型相關,如淋巴結轉移、腫瘤分期、腫瘤分化程度、復發轉移,并與腫瘤浸潤淋巴細胞(tumor-infiltrating lymphocyte,TIL)浸潤強度相關。利用公共數據庫分析VTCN1在CRC的表達及其與CRC臨床特征、免疫細胞浸潤以及預后的相關性,通過免疫熒光技術檢測B7S1在CRC的表達特征,為CRC免疫治療靶點選擇提供依據。

資料與方法

一、公共數據庫檢索

本研究在6個數據庫:①Oncomine腫瘤芯片數 據 庫 (https://www.oncomine.org/resource/login.html,查詢參數為:P<0.05,fold-change>2以及gene ranking in ALL); ②TIMER 數據庫(https://cistrome.shinyapps.io/timer/,腫瘤浸潤免疫細胞綜合分析);③Kaplan-Meier Plotter 數 據 庫 (https://kmplot.com/analysis/,基于薈萃分析的生存生物標志物的發現和驗證);④UALCAN 數據庫(http://ualcan.path.uab.edu/index.html,利用交互式網絡資源用于分析癌癥組學數據);⑤LinkedOmics數據庫(http://www.linkedomics.org/login.php,來自32種癌癥類型和10個臨床蛋白質組學腫瘤分析聯盟癌癥隊列的多組學數據);⑥人類蛋白質圖譜數據庫(https://www.proteinatlas.org/,human protein atlas database,利用各種組學技術繪制細胞、組織和器官中的所有人類蛋白質圖譜),篩選評估VTCN1表達水平及其與CRC臨床病理特征和病人預后的關系。

二、標本收集

收集2019年1月至12月間,在上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院 (北部院區)CRC根治手術病人的腫瘤組織和距腫瘤組織邊緣>5 cm正常組織標本,共24例,其中男14例(結腸癌9例,直腸癌5例),平均年齡(61.4±4.0)歲,女 10例(結腸癌5例,直腸癌 5例),平均年齡(66.6±2.9)歲,術后病理診斷均為腺癌。標本于4%多聚甲醛固定保存。病人為首次確診、未行放化療以及無遠處轉移。……

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