綿羊不同妊娠時期卵巢轉錄組差異表達比較分析

史靜茹，郭麗麗，劉在霞，劉永斌，張家新，張文廣

（1.內蒙古農業大學動物科學學院，內蒙古 呼和浩特 010018；2.動物遺傳育種與繁殖內蒙古自治區重點實驗室，內蒙古 呼和浩特 010018；3.內蒙古自治區農牧業科學院，內蒙古 呼和浩特 010031）

綿羊作為重要的經濟動物，遍布世界，皮毛和羊肉為人類提供了生活用品和食物， 綿羊養殖業已經成為畜牧業發展和農牧民增收的重點產業，我國綿羊存欄數趨于世界前列。 綿羊的繁殖性狀是一種經濟性狀，與經濟收益息息相關。綿羊的繁殖性狀與經濟的關系促使學者對綿羊繁殖性狀進行更深入的研究與探索。伴隨大數據時代的來臨，利用高通量測序技術探究復雜的有機體調控網絡成為趨勢， 最早被研發并應用的轉錄組測序技術為微陣列技術（microarray technology），該技術較為成熟，花費成本適中、數據分析軟件較多。 基因芯片技術是微陣列技術的基礎， 此技術只可檢測已知基因序列，不能檢測未知的基因序列?；蛐酒夹g靈敏度低并缺乏廣泛性， 使用該方法檢測豐度較低的序列和重復序列有一定難度， 異常轉錄產物也很難被檢測到。相比基因芯片技術，基因表達系列分析技術（serial analysis of gene expression，SAGE）無需依托基因序列信息，卻可以獲得所有基因的表達量。SAGE 技術不僅能夠顯示差異基因表達譜， 還可以探索低豐度基因和未知基因。SAGE 技術優化后的大規模平行測序技術（massively parallel signatur sequencing，MPSS）， 測序步驟被簡化，但測序精確性有所提高。這兩項技術都是建立在費用較高的Sanger 測序基礎上， 測序工作量大是操作過程中存在的問題，沒有被推廣。……