馬貫中 劉婕妤 王利云 張韜



摘要 從有腹瀉癥狀的免疫缺陷小鼠體內分離出1株病原菌。對該分離菌株進行生化鑒定、16S rDNA測序和遷徙行為觀察。經遷徙行為觀察發現,該菌在1.5%LB上呈現彌漫性生長,在0.5%、1.0%的LB平板上的未見遷徙現象。該菌在DHL平板上的菌落特點與沙門氏菌相似,通過沙門氏菌手工生化鑒定、ATB細菌鑒定及16S rDNA分子測序比對證實該菌為奇異變形桿菌。通過藥敏試驗發現,該菌株對喹諾酮類藥物敏感,抑菌圈直徑為18~20 mm,而對多數藥物中度敏感或不敏感。給腹瀉小鼠飼喂喹諾酮類藥物后,腹瀉癥狀明顯改善,發病率明顯下降。該研究結果為奇異變形桿菌引起的免疫缺陷小鼠腹瀉疾病的診斷和治療提供了參考。
關鍵詞 奇異變形桿菌;NYG小鼠;生化鑒定;動物試驗;遷徙行為
中圖分類號 S-852.61+2? 文獻標識碼 A? 文章編號 0517-6611(2021)13-0086-06
doi:10.3969/j.issn.0517-6611.2021.13.021
開放科學(資源服務)標識碼(OSID):
Isolation, Identification and Medical Treatment of Proteus mirabilis in Immunodeficient Mice
MA Guan zhong, LIU Jie yu, WANG Li yun et al
(Animal Core Facility of Nanjing Medical University,Nanjing,Jiangsu 211166)
Abstract A strain of pathogen was isolated from immunodeficient mice with diarrhea symptoms. The isolated strain was identified by biochemical identification, 16S rDNA sequencing and migration behavior observation. Through the migration behavior observation, it was found that the isolated strain showed diffuse growth on 1.5% LB and no migration on 0.5% and 1.0% LB plates. The colony characteristics of this strain on DHL plate were similar to that of Salmonella sp. The isolated strain was confirmed as Proteus mirabilis by manual biochemical identification, ATB bacterial identification and 16S rDNA molecular sequencing comparison. The drug sensitivity test also showed that the strain was sensitive to quinolones, with the inhibition zone diameter of 18-20 mm. But it was moderately sensitive or not sensitive to a variety of drugs. After the diarrhea mice were fed with quinolones, diarrhea symptoms were significantly improved, the incidence was significantly reduced. This study results provided references for the diagnosis and treatment of diarrhea caused by Proteus mirabilis.
Key words Proteus mirabilis;NYG mice;Biochemical identification;Animal experiment;Migration behavior
奇異變形桿菌為無莢膜、無芽孢、有鞭毛和有菌毛的革蘭陰性桿菌,其廣泛分布于自然界、動物糞便、臨床標本以及人和動物的腸道內,是導致人和動物感染的重要條件致病菌。當機體抵抗力下降時,可引起腦膜炎、腹膜炎、敗血癥、尿路感染和呼吸道感染[1-2]。近年來,奇異變形桿菌感染流行趨勢不斷擴大,關于豬[3]、狐貍[4]、鴿子[5]、貂[6-7]、大熊貓[8]、大黃魚[9]等動物及動物性食品[10-11]感染奇異變形桿菌的報道屢見不鮮,給人類和畜牧業發展帶來較大的經濟損失。此外,該菌還可引起人類原發性或繼發性感染,也能造成人類食物中毒,其作為人畜共患傳染病病原,應引起重視。
NYG小鼠為南京醫科大學醫藥實驗動物中心自主研發建立并擁有自主知識產權的高度免疫缺陷模型鼠,通過CRISPR-Cas9技術直接在NOD小鼠上敲除Prkdc及IL2RG基因,是目前免疫缺陷程度最高、最適合人源細胞移植的工具小鼠。因為該小鼠背景單一、異種移植成活率高、比NOD-scid小鼠壽命更長的特點,所以它具有廣泛的應用前景和研究等領域。
2019年8月,NYG小鼠在正常飼養過程中發生水樣腹瀉為主要特征的急性傳染病,病死率為100%。在病后3~4 d出現死亡現象,初期死亡率低,為0.6%,14 d后開始出現大面積發病并死亡,發病率高達42.3%。筆者從送檢小鼠體內分離出一株致病菌,通過生化鑒定以及16S rDNA基因序列分析,鑒定為奇異變形桿菌。通過藥敏試驗,發現該菌對喹諾酮類藥物敏感。 由于該菌在DHL平板上生長形態和部分生化指標與沙門氏菌相同[12],常常會被誤判為沙門氏菌,給動物生產和使用單位帶來不應有的損失。盡管國家標準(GB 14922—2001)并未將其列為SPF級實驗小鼠的必檢項目,但仍需指出的是該菌為條件致病菌,一旦攜帶者受不良條件的影響或外來因素的刺激,可能引發傳染病,造成嚴重后果[13]。另外,該菌對人畜均易感,迅速準確的診斷、檢測和治療對于控制該病的流行顯得尤為重要。
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 動物來源。16周齡ICR哨兵小鼠2只、8周齡NYG發病小鼠2只,均來自南京醫科大學江蘇省醫藥實驗動物中心。
1.1.2 試劑。血平板、革蘭氏染色試劑盒均購自上海科瑪嘉微生物技術有限公司;膽硫乳瓊脂培養基(DHL)、卵黃甘露醇高鹽瓊脂(SP)培養基、生化鑒定試劑均購自北京陸橋生物試劑有限公司;ID 32E購自法國梅里埃公司;香柏油(國藥);生理鹽水(自配);飽和食鹽水(自配);ELISA檢測試劑盒購于X-Press Bio;DNA提取試劑盒、dNTP、rTaq DNA聚合酶、MgCl2、10×Buffer、DNA DL2000 Marker等購自Tiangen公司。
1.1.3 試驗耗材與儀器。試驗耗材有手術器械、棉簽、載玻片等;試驗儀器有光學顯微鏡(Olympus)、移液器(Thermo)、ATB細菌鑒定儀(梅里埃)、生化培養箱(SPX-150BS)、PCR儀(Eppendorf)、凝膠成像系統(BIO-RAD)、電泳儀(北京六一)等。
1.1.4 細菌標準菌株。沙門氏菌(Salmonella spp.)和金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)購自中國藥品生物制品檢定所;木糖葡萄球菌(Staphylococcus xylose)為南京醫科大學醫藥實驗動物中心提供。
1.1.5 診斷血清。沙門氏菌診斷血清購于寧波天潤生物藥業有限公司。
1.2 方法
1.2.1 動物處理。采集哨兵小鼠血清,用于抗體檢測;哨兵鼠與NYG小鼠處死,無菌操作,取腸內容物,在血平皿、DHL平皿、SP平皿上劃線培養,用于細菌檢測;腸道內容物鏡下觀察,用于寄生蟲檢測。
1.2.2 細菌檢測。
1.2.2.1 細菌培養。將DHL平皿、血平皿、SP培養皿置于37 ℃生化培養箱內培養16~24 h,挑取疑似病原菌菌落用于分純傳代培養。
1.2.2.2 形態鑒定。對培養16~18 h的菌株進行菌落形態觀察。
1.2.2.3 革蘭氏染色。無菌挑取菌落,均勻涂抹于雙蒸水中,采用革蘭氏染色方法進行鑒定。
1.2.2.4 生化鑒定。對疑似病原菌進行手工生化與ATB細菌鑒定儀交叉鑒定。
1.2.2.5 血清凝集試驗。采用玻片法,用接種環挑取沙門氏菌(購自中國藥品生物制品檢定所的標準菌株)及疑似病原菌,分別與沙門氏菌診斷血清及生理鹽水混勻,上下搖動玻片數次,1~3 min后觀察結果。
1.2.2.6 PCR檢測與16S rDNA測序。采用細菌基因組DNA試劑盒提取細菌DNA,使用通用引物進行PCR擴增,對PCR產物進行測序鑒定。
(1)總DNA模板的提取。從平板上挑取少許單菌落,移入5 mL LB液體培養基中,37 ℃擴大培養16~18 h。從試管中吸取1 mL菌液,離心收集菌體,使用DNA抽提試劑盒抽提細菌的基因組DNA。
(2)PCR擴增。使用通用引物[10]對16S rDNA進行PCR擴增,擴增產物送交南京金斯瑞生物科技有限公司測序。測序結果在GenBank數據庫中進行Blast比對,使用MEGA軟件對相近序列進行同源性分析,并構建系統發育樹。
1.2.2.7 藥敏試驗。制備0.5麥氏菌懸液,均勻涂布于MH培養基上,5 min后將藥敏片均勻貼服于培養基上,每皿5個藥敏片,15 min后將貼服于藥敏片的培養基放入37 ℃培養箱內培養24 h,觀察結果。
1.2.2.8 遷徙行為的檢測。制備0.5麥氏菌懸液,將NJDWZY1.1點種在血平皿,瓊脂濃度分別為0.5%、1.0%、1.5%、2.0%、2.5%的LB平板上,37 ℃培養20 h,每小時觀察并記錄其遷徙距離。
1.2.2.9 動物用藥試驗。根據藥敏試驗結果與文獻報道,選用50 μg/mL環丙沙星對發病房間內動物進行區域性給藥,用藥7 d后發病率與死亡率明顯降低,發病率由用藥前的42.3%下降到9.6%,病死率未見異常,均為100%,持續給藥14 d后發病率下降到0。
1.2.3 抗體檢測。由于NYG小鼠為高度免疫缺陷小鼠,只能通過對哨兵鼠血清進行抗體檢測,從而間接的達到NYG小鼠檢測的目的。
1.2.4 寄生蟲檢測。將腸內容物溶于生理鹽水與飽和食鹽水中,顯微鏡下觀察蠕蟲、線蟲、鞭毛蟲、纖毛蟲等寄生蟲體。
2 結果與分析
2.1 細菌檢測
2.1.1 菌落形態。37 ℃ DHL平皿培養16~18 h后,可見中間黑心、四周扁平、無色透明的菌落,分純培養,命名為NJDWZY1.1,如圖1A所示。血平皿上生長良好,約0.5 cm大小菌落,表面光滑濕潤、不溶血、半透明、有黏性的菌落,可見遷徙生長現象,分純培養,命名為NJDWZY1.2,如圖1B所示。SP 平皿上生長良好,約0.1 cm大小菌落,表面光滑,呈現淡黃色小菌落,分純培養,命名為NJDWZY1.3,如圖1C所示。
2.1.2 革蘭氏染色。對分離菌株進行革蘭氏染色,NJDWZY1.1與NJDWZY1.2結果均為陰性短桿菌,見圖2A、B;NJDWZY1.3結果為陽性球菌,見圖2C。
2.1.3 手工生化鑒定。由于DHL平皿上菌落有黑心,觸酶試驗為陽性,革蘭氏染色為陰性短桿菌,疑似沙門氏菌,對其進行手工鑒定,鑒定結果見表1。結果表明,排除掉沙門氏菌的可能,需要對該菌進一步生化與PCR鑒定。SP平皿上菌落呈淡黃色,革蘭氏染色為陽性球菌,疑似金黃色葡萄球菌,對其進行手工生化鑒定,結果見表2~3。結果表明,排除金黃色葡萄球菌的可能,對其進行進一步生化鑒定。
2.1.4 血清凝集試驗。以沙門氏菌為陽性對照,對疑似沙門分離菌的NJDWZY1.1進行補充鑒定,結果見表4。
2.1.5 ATB細菌鑒定儀生化反應。根據儀器使用要求,對NJDWZY1.1、NJDWZY1.2與NJDWZY1.3制備菌懸液進行生化反應,其中NJDWZY1.1與NJDWZY1.2結果相同,為奇異變形桿菌,T值為1.0,見表5。NJDWZY1.3鑒定結果為不可接受的鑒定,對其進行PCR鑒定。
2.1.6 PCR擴增與16S rDNA測序。
2.1.6.1 PCR擴增。采用PCR方法對分離菌進行擴增。PCR產物在1%瓊脂糖凝膠電泳分析結果表明,陽性對照與分離菌均擴增到目的條帶,空白對照未見條帶,不存在非特異性條帶。與Marker相比,PCR擴增產物片段大小約1 450 bp(圖3),與預期結果相一致。
2.1.6.2
16S rDNA測序。將分離菌的PCR產物送檢測序,結果在 NCBI GenBank 數據庫中進行 BLAST 比對分析,發現NJDWZY1.1與NJDWZY1.2分離菌與其同源性最高的序列均為奇異變形桿菌,同源性均在 99%以上,確定該2株分離菌為同一菌株,為奇異變形桿菌,為此次分離的致病菌。NJDWZY1.3鑒定為腐生葡萄球菌,排除金黃色葡萄球菌的可能。
2.1.6.3 進化樹分析。將分離的奇異變形菌株16S rDNA基因序列與從GenBank數據庫中獲得的變形桿菌屬細菌及質檢中常見細菌進行統計和聚類分析,結果見圖4。從圖4可以看出,分離菌株與奇異變形桿菌的同源性在99%以上。
2.1.7 藥敏試驗結果。根據CLSI(2018年)頒布抗菌藥物體外藥敏試驗判定標準,利用不同種類的抗生素檢測該分離株的藥敏特性,敏感度根據抑菌圈直徑的大小來判斷。結果顯示,在測定的30種常用藥物中,該菌株對諾氟沙星、氧氟沙星、環丙沙星等喹諾酮類藥物敏感,抑菌圈直徑為18~20 mm;該菌株對復方新諾明與頭孢氨芐中度敏感,而對大環內酯類、多肽類、β-內酰胺類、四環素類等多種藥物不敏感(表6)。
2.1.8 遷徙行為結果分析。NJDWZY1.1在血平皿,瓊脂濃度分別為2.0%、2.5%的 LB平板上呈現周期性向四周遷徙運動,形成多圈同心圓環,在1.5%LB上呈現彌漫性生長,在0.5%、1.0%的LB平板上未見遷徙現象,結果見圖5。
2.1.9 動物用藥試驗。對房間內93籠小鼠用藥,持續給藥7 d后,小鼠狀態得到明顯改善,死亡數量較用藥前明顯減少;經觀察發現有9籠小鼠發病并死亡,持續給藥超過7 d未見小鼠死亡(表7)。
2.2 抗體檢測 采用ELISA方法對哨兵鼠的泰澤病原體、鼠肝炎病毒、輪狀病毒、呼腸孤病毒、小鼠腺病毒進行檢測,結果見表8。
2.3 寄生蟲檢測
將腸道內容物溶于生理鹽水中,用于檢測鞭毛蟲、阿米巴變形蟲與纖毛蟲;將腸道內容物溶于飽和食鹽水中,用于檢測線蟲,結果見表9。
3 討論
該試驗中在DHL平板上分離的菌落特點與沙門氏菌相似,故在此次檢測中最初誤判為沙門氏菌,但通過沙門氏菌手工生化鑒定,排除了沙門氏菌的可能。經過進一步的生化鑒定,初步判定為奇異變形桿菌。在SP平板上分離菌落與金黃色葡萄球菌相似,經過生化鑒定與PCR鑒定判定為腐生葡萄球菌,排除了金黃色葡萄球菌的可能。由于NYG小鼠在常規監測中檢出了腐生葡萄球菌,所以認為腐生葡萄球菌不是此次發病的致病菌。
通過對細菌中16S rDNA序列分析比較來對細菌進行鑒定已經是國際上通用的鑒定技術[14],一般認為同源性為99%~100%,判定為同一個種,97%~99%的同源性即判定為同一個屬,根據此標準,對此次致病菌的16S rDNA進行測序并比對結果表明,該菌與奇異變形桿菌的同源性高達100%,故該分離菌株可鑒定為奇異變形桿菌。
在現代臨床醫學檢驗中,檢驗工作的儀器化、電腦化、智能化、快速化是其中的一個發展方向,微生物檢驗也不例外。該試驗中使用的ATB細菌鑒定儀是一臺在微量生化反應環節實現電腦自動化的儀器,由于在制備菌懸液濃度、加樣等操作過程中存在人為原因與系統誤差,會出現ATB鑒定結果與手工結果不符現象[15-16],所以通過PCR方法對該菌進一步診斷,確定為奇異變形桿菌。此次檢測中ATB鑒定結果與PCR鑒定結果相一致,最終該菌鑒定為奇異變形桿菌。ATB細菌鑒定儀試劑在樣品的制備與加樣過程中,在顏色比對過程中存在人為因素造成的誤差,而PCR方法具有反應快速、靈敏度高、成本低、假陽性等特點,所以需要生化與PCR交叉鑒定來最終確診。
抗生素自發現以來,拯救了無數生命,但隨著抗生素越來越多被不合理使用,它們正在迅速失去效力,而此種現象被人們稱為耐藥性。現今耐藥菌株出現的速度遠遠超過了抗生素的研發速度[17],近年來,由于廣譜抗菌藥物的廣泛大量使用,奇異變形桿菌的耐藥性日益嚴重,不斷誘導出新的耐藥菌株。此次藥敏試驗發現在常用的30種抗生素中,有11種抗生素完全耐藥、藥敏直徑為0 mm,14種抗生素不完全耐藥,2種抗生素中度敏感,3種抗生素高度敏感。在11種完全耐藥的抗生素中,涉及大環內酯類抗生素2種,100%耐藥;多肽類抗菌素2種,100%耐藥;林可胺類抗菌素1種,100%耐藥;頭孢菌素類抗菌素1種,12.8%耐藥;β-內酰胺類抗菌素2種,60%耐藥;四環素類抗菌素2種,75%耐藥。該分離菌株的藥敏試驗結果與已有報道[18-20]的藥敏試驗結果相差較大,這提示該地區這幾種抗生素已不適用于治療由奇異變形桿菌引起的各種感染,而喹諾酮類藥物敏感率為100%,可作為該地區的臨床經驗用藥和臨床首選用藥。南京醫科大學醫藥實驗動物中心在選用喹諾酮類藥物治療后,小鼠的發病率呈現明顯的下降趨勢。用藥14 d后,已無死亡現象,籠盒內可見成型糞便,死亡率由用藥前的42.3%下降到0,已有效控制了該疾病的發展。該病在發病初期零星發生,持續14 d后開始大量暴發,從0.4籠/d死亡劇增到13籠/d,給藥2 d后死亡率出現明顯下降,達到9籠/d,可見通過飲水飼喂的藥物已發揮作用。持續給藥7 d后死亡率持續下降,達到0.3籠/d,持續給藥14 d后未見發病動物。持續給藥21 d后停藥,停藥7 d又出現復發現象,出現1籠死亡,又繼續給藥,未見發病。該病從發病到暴發需要14 d的潛伏期,在潛伏期給予藥物治療可以很好地控制該病的發展。持續給藥21 d后有復發現象,說明環丙沙星僅能抑制該菌,但不能有效殺滅或只有持續給藥才能殺滅該菌,這需要在后續延長給藥的治療中證實。該試驗中發病動物多為生產后的雌性小鼠,可能為妊娠和生產壓力對小鼠腸道屏障產生損害,從而受到奇異變形桿菌的入侵和感染[21]。
奇異變形桿菌的遷徙行為有2種形態,即VC型與CGC型。其中,VC型細菌產生大量酸性物質,阻礙細菌生長,而CGC型菌體鞭毛變長變密,由于趨化作用,細菌向外部擴散生長。因此,奇異變形桿菌是處于這2種狀態變化中生長[22-23]。NJDWZY1.1的遷徙距離隨著培養試劑的延長而增加,其中血平皿最先達到閾值,然后依次為瓊脂濃度2.0%、2.5%、1.5%的LB平皿,在4、7~8、10與12 h遷徙速度最快,有4個峰值,在這幾個時間段應該處于CGC型狀態,其余時間段處于VC型狀態。在瓊脂濃度0.5%與1.0%的LB平皿上未見明顯的遷徙現象,其原因可能是0.5%與1.0%的LB平板表面水分含量高,有助于酸性代謝產物的擴散,導致未見遷徙現象。該試驗中的遷徙行為與文獻報道[24]差別較大,可能是由于不同菌屬造成的。奇異變形桿菌通過遷徙行為有效提高了其抵抗力和致病力,而此次分離的奇異變形桿菌對NYG小鼠具有較強的致病性。
引起小鼠腹瀉的原因多種多樣,主要分為飼養環境的改變與病原體的感染。由于試驗用小鼠飼養在屏障環境中,所以季節的變化已不是造成該小鼠腹瀉的主要因素,著重檢測了引起小鼠腹瀉的病原體,主要分為病毒、細菌與寄生蟲。輪狀病毒感染通常表現在幼崽腹瀉,成年小鼠一般不會發生,而油毛效應是呼腸孤病毒感染的典型特征,根據以上特征可初步排除,而泰澤病原體[25]一般為陰性感染,且持續時間較長,但為預防漏檢,該試驗依然對其抗體進行了檢測,結果發現血清中抗體均為陰性。對寄生蟲的檢測應著重考慮鞭毛蟲、纖毛蟲、阿米巴變形蟲與線蟲發現分別檢測了2只發病NYG小鼠與未見癥狀的哨兵鼠,通過鏡檢均未發現目標蟲體。在病毒與寄生蟲均排除的情況下,著重考慮細菌感染的因素。在此次檢測中,由于哨兵鼠一直未表現出腹瀉癥狀,因此僅對NYG發病鼠采樣,最終檢測到引起此次發病的致病菌為奇異變形桿菌。對于NYG小鼠,因為其高度免疫缺陷性,有其特殊性,極易引起各種病原體與條件性病原體的感染,因此在飼養管理等方面應該更加嚴格。
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