陳立杰 杜巧麗 陳美晴 謝鑫

摘 要 在生物功能研究過程中,通常需要從混合蛋白中區(qū)分、檢測目標(biāo)靶蛋白,而蛋白免疫印跡技術(shù)能較好的實(shí)現(xiàn)該目的。蛋白免疲印跡技術(shù)是一種先擇性地結(jié)合被分離混合物中特異蛋白的分析技術(shù),具有靈敏度高、特異性強(qiáng)、分辨率高、分析容量大,可對蛋白進(jìn)行定性、定量分析,檢測蛋白的時(shí)空表達(dá)變化情況,被廣泛應(yīng)用于蛋白定性實(shí)驗(yàn)技術(shù)中。為在大學(xué)生創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)中推廣該技術(shù),本教學(xué)實(shí)驗(yàn)以貴州大學(xué)本科生為對象,課程的主要內(nèi)容包括了解蛋白印跡法的原理、目標(biāo)蛋白載體的構(gòu)建、蛋白可溶性表達(dá)、PAGE膠制作,以及蛋白質(zhì)免疫印跡試驗(yàn)。該教學(xué)可提高學(xué)生對蛋白免疫印跡技術(shù)原理和實(shí)驗(yàn)操作技能的認(rèn)識(shí)和掌握,同時(shí)訓(xùn)練學(xué)生在科研中的能力。
關(guān)鍵詞 蛋白 免疫印跡 實(shí)驗(yàn)教學(xué)
中圖分類號(hào):G642 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A ? ?DOI:10.16400/j.cnki.kjdks.2021.01.022
Abstract In the process of biological function research, it is usually necessary to distinguish and detect the target protein from the mixed protein, and Western blot technology can better achieve this purpose. Protein immunoblotting is a kind of analytical technology that selectively combines the specific proteins in the separated mixture. It has high sensitivity, specificity, high resolution and large analysis capacity. It can be used for qualitative and quantitative analysis of proteins and detect the changes of spatiotemporal expression of proteins. It is widely used in the qualitative experiment of proteins. In order to popularize the technology in the innovative experiment of college students, this teaching experiment is aimed at undergraduates of Guizhou University. The main contents of the course include understanding the principle of western blotting, the construction of target protein vector, the soluble expression of protein, the preparation of page gel, and the protein immunoblot test. This teaching can improve students' understanding and mastery of Western blotting technology principle and experimental operation skills, and train students' ability in scientific research.
Keywords protein; immunoblotting; experimental teaching
蛋白質(zhì)印跡法(蛋白免疫印跡)即Western Blot,[1-2]是在DNA印跡法(Southern blot)和RNA印跡法(Northern blot)之后,整合電泳、轉(zhuǎn)印和免疫標(biāo)記為一體的蛋白分離檢測技術(shù),是對電泳技術(shù)的進(jìn)一步延深和發(fā)展。目前是一種應(yīng)用比較廣泛的蛋白質(zhì)檢測實(shí)驗(yàn)方法,主要應(yīng)用于免疫遺傳學(xué)、生物化學(xué)和分子生物學(xué)中,同時(shí)也廣泛應(yīng)用于蛋白水平的表達(dá)研究、抗體活性檢測和疾病早期診斷等多個(gè)領(lǐng)域。[3]其基本原理主要是將經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳分離后的細(xì)胞或組織蛋白,用電印免疫印跡法轉(zhuǎn)移到固相支持物(化學(xué)惰性的高分子轉(zhuǎn)移膜,如聚偏二氟乙烯膜)上,然后將目標(biāo)蛋白的特異性抗體(一抗)與轉(zhuǎn)移膜上的目標(biāo)蛋白進(jìn)行免疫結(jié)合反應(yīng),再用被辣根過氧化物酶標(biāo)記過的二抗與一抗結(jié)合,隨后通過分析著色的位置和著色深度來檢測目標(biāo)蛋白。
進(jìn)行蛋白質(zhì)免疫檢測通常需經(jīng)過蛋白裂解及變性、蛋白電泳分離、轉(zhuǎn)模、封閉、一抗孵育、二抗孵育和特異性檢測等環(huán)節(jié),由于該試驗(yàn)涉及的步驟較多,對實(shí)驗(yàn)設(shè)備及操作人員的要求較高,目前還未針對本科生開設(shè)此類課程。本文以貴州大學(xué)面向本科生開設(shè)的大學(xué)生開放性實(shí)驗(yàn)課為基礎(chǔ),對該實(shí)驗(yàn)在本科實(shí)驗(yàn)教學(xué)中進(jìn)行應(yīng)用,教學(xué)效果良好。
1 課程內(nèi)容設(shè)計(jì)
該課程為大學(xué)生創(chuàng)新性實(shí)驗(yàn)計(jì)劃課程,是農(nóng)業(yè)及生命科學(xué)學(xué)科的選修課程。整個(gè)實(shí)驗(yàn)課程內(nèi)容為一個(gè)小設(shè)計(jì)型實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目。本課程的主要內(nèi)容包括掌握蛋白質(zhì)印跡法的原理、目標(biāo)蛋白載體的構(gòu)建、蛋白質(zhì)可溶性表達(dá)、PAGE膠制作,以及Western blot實(shí)驗(yàn)。
本課程通過設(shè)定不同條件(如溫度、菌株及不同IPTG,異丙基硫代半乳糖苷,Isopropyl-D-Thiogalactoside,濃度),以實(shí)現(xiàn)對目標(biāo)蛋白的可溶性表達(dá)。由于本課程需進(jìn)行連續(xù)性實(shí)驗(yàn),課程均安排于周末進(jìn)行,共分為5次實(shí)驗(yàn)及1次匯報(bào),每次實(shí)驗(yàn)時(shí)間約2~8學(xué)時(shí),共約20~28學(xué)時(shí)。具體課程內(nèi)容和安排見表1。
2 代表性結(jié)果
以在實(shí)驗(yàn)教學(xué)過程中1組同學(xué)選擇的高粱(Sorghum bicolor)的抗病蛋白STG1為例。同學(xué)們對STG1進(jìn)行了基因擴(kuò)增、生物信息學(xué)分析、載體pET28a載體構(gòu)建、原核表達(dá)條件摸索以及Western blot檢測,最終用Anti His抗體在重組菌株的上清樣品中檢測到一條清晰單一條帶,而空載體對照都沒有相應(yīng)條帶,說明STG1蛋白成功表達(dá)。
3 教學(xué)效果
3.1 增強(qiáng)學(xué)生對蛋白免疫印跡技術(shù)及相關(guān)生化實(shí)驗(yàn)技術(shù)的理解
在本次大學(xué)生創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)教學(xué)中,首先讓學(xué)生利用在線網(wǎng)站和文獻(xiàn)檢索了解相關(guān)實(shí)驗(yàn)技術(shù),了解其原理和實(shí)驗(yàn)操作步驟。其次,學(xué)生要通過自主設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)并驗(yàn)證蛋白是否成功表達(dá),前提就要求學(xué)生要對基因、蛋白有一定的了解。學(xué)生通過親自參與整個(gè)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)與操作,更進(jìn)一步地增強(qiáng)了對蛋白免疫印跡技術(shù)及相關(guān)生化實(shí)驗(yàn)技術(shù)的理解和掌握。
3.2 鍛煉學(xué)生的動(dòng)手和分析能力
在實(shí)驗(yàn)操作中,蛋白免疫印跡技術(shù)有兩大關(guān)鍵因素:(1)必須將分離的蛋白很好地從PAGE凝膠上轉(zhuǎn)到固相支持物上。在此過程中,對轉(zhuǎn)膜緩沖液的選擇顯得尤為重要,它對蛋白與膜和探針的結(jié)合起著決定性作用。(2)對抗體的選擇,抗體是目前在該技術(shù)中最常用的標(biāo)記探針。在實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證環(huán)節(jié),許多學(xué)生會(huì)出現(xiàn)沒有得到理想的預(yù)期結(jié)果(信號(hào)弱或無信號(hào)、條帶大小與預(yù)期不符、非特異條帶、背景高、污點(diǎn)等常見問題),這是可能由于在轉(zhuǎn)膜過程中所配緩沖液組分不對,抗體選擇不對(一抗、二抗選擇及濃度選擇),在轉(zhuǎn)膜時(shí)溫度過高,制作PAGE凝膠時(shí)膠上有氣泡、膠厚度不一致、凝固程度不一致等因素造成的。這些都需要學(xué)生在操作過程中認(rèn)真思考、按要求操作、多次摸索、總結(jié)經(jīng)驗(yàn)、找出失敗原因,多與老師和同學(xué)進(jìn)行討論問題才能最終找到解決方案。問題能得到有效的解決,是鼓勵(lì)學(xué)生進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)的關(guān)鍵。對于在本實(shí)驗(yàn)中出現(xiàn)的問題,說明學(xué)生的動(dòng)手操作能力還不夠,在本科階段很有必要設(shè)立此類動(dòng)手能力強(qiáng)的生化實(shí)驗(yàn)類創(chuàng)新課程,提高本科生的實(shí)際動(dòng)手操作能力。
3.3 實(shí)驗(yàn)教學(xué)的推廣性分析
蛋白免疫印跡技術(shù)在分子生物學(xué)、生物化學(xué)和免疫遺傳學(xué)中是一種非常實(shí)用的實(shí)驗(yàn)技術(shù)。對于只了解其理論知識(shí)而未受到過實(shí)際操作培訓(xùn)的同學(xué),具有實(shí)際的意義。對于農(nóng)業(yè)及生命科學(xué)學(xué)科類專業(yè)的同學(xué),學(xué)校具備實(shí)施此類實(shí)驗(yàn)技術(shù)的相關(guān)設(shè)備,更應(yīng)開設(shè)其相關(guān)實(shí)驗(yàn)課程。此外,該實(shí)驗(yàn)的最大優(yōu)勢就在于其適應(yīng)性好,不需要特殊的實(shí)驗(yàn)儀器。因此,希望通過蛋白免疫印跡技術(shù)的推廣,能讓廣大本科生受益。
4 教學(xué)總結(jié)
對2019年度的教學(xué)總結(jié)發(fā)現(xiàn),40%的實(shí)驗(yàn)組通過自主學(xué)習(xí)下完成實(shí)驗(yàn),約55%的實(shí)驗(yàn)組能在老師的指導(dǎo)下完成實(shí)驗(yàn),5%的實(shí)驗(yàn)組不能順利完成實(shí)驗(yàn)。教學(xué)實(shí)踐結(jié)果顯示該實(shí)驗(yàn)適合于高年級本科生(大三、大四),最好有分子生物學(xué)以及基本的生物信息學(xué)基礎(chǔ)的同學(xué)。學(xué)生在課程結(jié)束時(shí)要PPT匯報(bào),并寫一份實(shí)驗(yàn)報(bào)告以及個(gè)人學(xué)習(xí)總結(jié),以鍛煉他們的書面和口頭表達(dá)能力。從匯報(bào)和實(shí)驗(yàn)報(bào)告來看,學(xué)生對實(shí)驗(yàn)背景、材料與方法、實(shí)驗(yàn)操作過程和各階段的實(shí)驗(yàn)結(jié)果都有清晰的認(rèn)識(shí)。因此,非常有必要在本科教學(xué)中推廣此類課程。
*通訊作者:謝鑫
參考文獻(xiàn)
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[3] 宋亮,陳丹丹.淺談蛋白質(zhì)印跡法操作過程中的實(shí)驗(yàn)技巧[J].科技資訊,2015,13(21):63-65.