田會東,王靜,郭麗娜,賈明璐,陳雪平,王瑞
(1.河南省漯河市中心醫院藥學部,漯河 462000;2.漯河醫學高等專科學校,漯河 462000)
近年來,隨著我國人口老齡化與生活方式及飲食結構的改變,糖尿病已經從少見病變成一個流行病,2型糖尿病患病率持續攀升[1]。據最新數據顯示,我國成人糖尿病的患病率達10.9%,患病人數居世界之首[2]。2型糖尿病及其并發癥嚴重危害人類健康,并給社會帶來巨大的經濟負擔。因此,抗2型糖尿病藥物的研究,已經成為當今醫藥研究領域的熱點和難點。中藥因具有“多成分-多靶點-多通路”發揮整體協同作用的特點,在治療糖尿病及其并發癥等疾病方面具有得天獨厚的優勢。中醫認為,2型糖尿病及其并發癥是由于機體燥熱內盛、煉液為痰、血流滯澀所致,治療應以清熱燥濕、化痰通絡為主[3]。黃連是毛茛科植物黃連(CoptischinensisFranch.)、三角葉黃連(CoptisdeltoideaC.Y.Cheng et Hsiao)或云連(CoptisteetaWall.)的干燥根莖,性寒、味苦,具有清熱潤燥的療效[4];三七為五加科植物三七[Panaxnotoginseng(Burk.)F.H.Chen]的干燥根和根莖,性溫、味甘,具有活血通絡之效[5];二者配伍正體現清熱潤燥、益氣活血法治療“消渴癥”的基本方法。現代中醫臨床發現,黃連-三七在很多中藥處方中都有體現,是中醫治療糖尿病的常用藥對[6- 7]。然而,由于中藥多成分多靶點等特點,黃連-三七藥對抗2型糖尿病的作用機制尚未完全闡明。網絡藥理學是一種新的研究藥物作用機制的方法,廣泛應用于中藥復方的研究,為中藥作用機制的研究開辟了新的思路[8]。因此,本研究采用網絡藥理學方法,對“黃連-三七”藥對主要活性物質、作用靶點及信號通路對其抗2型糖尿病的作用機制進行探索,旨在為黃連-三七抗2型糖尿病的進一步探索提供科學依據。
1.1篩選活性成分及相應靶點 分別以黃連、三七為關鍵詞,從中藥系統藥理學分析平臺(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)(http://lsp.nwsuaf.edu.cn/tcmsp.php) 中獲取所有化學成分。把口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%和類藥性(drug-like,DL)≥0.18作為篩選條件[9],從而得到活性成分。其中OB和DL是篩選活性成分的重要指標,OB、DL值越高,表明其越有可能被開發成為藥物[10-11]。活性成分的作用靶點從TCMSP數據庫中獲得,把靶點名稱輸入UniProt數據庫(https://www.uniprot.org/),獲得其相應靶點的人源的靶點基因名稱。
1.2構建“活性成分-靶點蛋白”網絡 將黃連-三七藥對篩選出的活性成分和UniProt數據庫獲得的人源靶點導入Cytoscape 3.6.1版軟件,運用Network Analyzer插件分析構建“活性成分-靶點蛋白”的網絡圖。
1.3構建抗2型糖尿病靶點蛋白互作(protein protein interaction,PPI)網絡 運用比較毒物基因組學數據庫(comparative toxicogenomics database,CTD)(http://ctdbase.org/)和治療靶點數據庫(therapeutic target database,TTD)(https://db.idrblab.org/ttd/),以“Type 2 Diabetes”為關鍵詞,檢索與2型糖尿病相關的靶點,將得到的靶點基因輸入STRING在線分析平臺(https://string-db.org/),選擇分值大于0.7(高置信度評分)[12],預測靶點與靶點之間的相互作用關系,構建抗2型糖尿病靶點PPI網絡圖。
1.4網絡合并 運用Cytoscape 3.6.1版軟件中的Merge功能將活性成分-靶點網絡和抗2型糖尿病PPI網絡合并,觀察是否有交集網絡。有交集的蛋白靶點可能是抗2型糖尿病的關鍵靶點。
1.5通路富集分析 運用DAVID6.8數據庫對黃連-三七抗2型糖尿病靶點蛋白,進行基因的本體(gene ontology,GO)生物學過程富集分析和KEGG代謝通路富集分析,并以P<0.05作為篩選條件,結果用在線制圖平臺Omishare Tools可視化處理,進一步闡明靶點蛋白在信號通路中的作用。
2.1主要活性成分 文獻[13],皂苷類化合物口服,會被代謝生成次生皂苷或苷元,而真正在體內發揮療效的多為次生苷或苷元。TCMSP 數據庫對此以“皂苷-qt”表示,為準確模擬化合物在體內的真實情況,本研究對皂苷類化合物也以后綴qt 的形式進行描述。通過TCMSP數據庫共獲得167個黃連-三七對藥的已知成分,黃連成分有48個,三七成分有119個;以OB≥30%和DL≥0.18作為篩選條件獲得20個成分,其中黃連14個,三七7個,共有相同化合物1個。20個化合物中有3個化合物在TCMSP數據庫沒有篩選到相關作用靶點。因此,本研究共納入黃連-三七對藥的17個成分作為候選化合物,如表1所示。
2.2“活性成分-靶點”網絡圖構建 從UniProt數據庫得到人源靶點基因共116個,將活性成分與作用靶點通過Cytoscape 3.6.1構建成網絡圖,如圖1所示。圖1包含133個節點(17個活性成分和116個相關靶點)和261條線,其正八邊形代表活性成分,三角形代表相關靶點,線代表活性成分與相關靶點的關系。據報道,度值(degree)和介數值的節點(betweenness)與活性成分的重要性呈正相關,即其值越大,相應的節點在此網絡圖中越重要[14]。結果顯示,槲皮素(quercetin)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)、豆甾醇(stigmasterol)、氫化小檗堿[(R)-canadine]等化合物和前列腺素G/H合成酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)、前列腺素G/H合成酶1(prostaglandin-endoperoxide synthase 1,PTGS1)、5α鈉通道蛋白、核受體激活劑2等靶點蛋白在網絡圖中具有樞紐作用,可能是關鍵的活性成分和靶點蛋白。這也充分說明了黃連-三七藥對是以多成分、多靶點協同作用的特點。

表1 黃連-三七藥對篩選后得到的17個活性成分

圖1 活性成分-靶點網絡圖
2.3抗2型糖尿病靶點PPI網絡構建 在TTD數據庫檢索到抗2型糖尿病靶點75個,其中具有人源基因的靶點53個,在CTD數據庫中檢索到有直接證據來源的靶點211個,將這些靶點輸入STRING在線分析平臺,從而構建抗2型糖尿病靶點PPI網絡,如圖2所示。
2.4合并網絡 運用Cytoscape 3.6.1版軟件中的Merge功能將活性成分-靶點網絡和抗2型糖尿病靶點PPI網絡合并,獲得交集網絡圖,見圖3。從而得到黃連-三七藥對發揮抗2型糖尿病作用的化合物15個,包括槲皮素、β-谷甾醇、黃連堿、巴馬汀、小檗浸堿等;關鍵靶點19個,包括胰島素受體、前列腺素G/H合成酶2、二肽基肽酶IV、腸道麥芽糖酶-葡糖淀粉酶、凋亡調節因子Bcl-2、過氧化物酶體增殖物激活受體γ等,見表2。

圖2 抗2型糖尿病靶點PPI網絡
2.5通路富集分析 運用DAVID平臺進行GO功能富集分析得到111個GO條目(P<0.05),其中生物過程(biological process,BP)條目92個,細胞組成(cellular component,CC)條目12個,分子功能(molecular function,MF)相關的條目7個,見圖 4。KEGG通路富集,篩選出21條信號通路(P<0.05),涉及HIF-1信號通路、胰島素抵抗通路、脂肪細胞脂解調控通路、PI3K-Akt信號通路等,見圖5。

圖3 抗2型糖尿病作用活性成分-靶點網絡
其中準確度最高(P最小)的通路為HIF-1信號通路。缺氧誘導因子(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)是由α和β亞單位組成一種異源二聚體,屬于轉錄因子堿性螺旋-環-螺旋家族蛋白。HIF與細胞和組織內的能量代謝有關,在缺氧條件下,可上調糖酵解途徑,降低線粒體功能來維持細胞代謝平衡,并且HIF還參與肝內糖類和脂質代謝[15]。由DAVID6.8平臺富集的HIF-1信號通路圖可知(圖6),黃連-三七通過作用于EGFR、IL-6、HMOX1、bcl-2、NOS3、NOS2、INSR等7個靶蛋白調控HIF-1信號通路,起到抗2型糖尿病及其并發癥的作用。

表2 核心靶點信息

圖4 核心靶點GO富集分析

圖5 核心靶點GO富集分析
中醫藥學有相對完備的理論基礎,在防治糖尿病方面具有優勢,中藥能有效降低糖尿病的發病率已逐漸得到驗證[16]。本研究采用網絡藥理學方法預測了黃連-三七對藥抗2型糖尿病的主要活性成分及潛在分子作用機制。由抗2型糖尿病作用活性成分-靶點網絡可知,15種成分能對2型糖尿病的相關靶點產生作用,其中6種來自三七,10種來自黃連,槲皮素是黃連和三七的共有成分。據報道槲皮素具有顯著的降糖功效,可通過降低大鼠血清抵抗素從而改善胰島素抵抗,并對空腹血糖、空腹胰島素水平有直接降低作用[17]。這也為兩藥聯合抗2型糖尿病的合理性提供理論依據。
從交集網絡靶點可知,黃連-三七抗2型糖尿病是多靶點協同作用的結果。研究證實,IL-6可促進肝臟合成超敏C反應蛋白(hs-CRP)等急性時相蛋白,促進炎癥發生,是2型糖尿病的獨立影響因素之一[18];抑制二肽基肽酶4(dipeptidyl-peptidase 4,DPP4),可以阻斷對GLP-1的降解,因此增加了體內內源性GLP-1水平和活性,從而促進胰島素分泌[19];過氧化物酶體增生激活受體γ(PPARG)基因定位予3p25,屬于轉錄因子的核激素受體超家族,在調節胰島素敏感性方面具有重要作用[20]。這些研究報道部分預示著通過網絡藥理學預測黃連-三七藥對作用靶點和通路的可行性,可以把IL6、PTGS2、DPP4、SCD、PPARG等19個關鍵靶點作為黃連-三七抗2糖尿病的潛在作用靶點深入研究其分子作用機制。

圖6 HIF-1信號通路
從GO富集分析可知,靶點主要富集在BP(生物過程)環節,如氧化應激,炎癥應答,細胞對鎘離子反應等;KEGG通路富集分析發現HIF-1信號通路、胰島素抵抗通路、脂肪細胞脂解調控通路、PI3K-Akt信號通路等與2型糖尿病密切相關,其中胰島素抵抗通路直接與糖尿病相關,表明黃連-三七具有良好的抗2型糖尿病效果。HIF-1信號通路準確度最高(P=1.0×10-7),是黃連-三七主要抗2型糖尿病途徑。研究表明,缺氧貫穿于糖尿病并發癥發病機制的始終[21]。HIF-1α作為調節細胞內氧代謝的關鍵因子之一,是目前發現的唯一能在特異性缺氧狀態下發揮活性的轉錄因子,對糖尿病及其并發癥的發生、發展起促進作用[22-23]。本研究發現黃連-三七能作用于HIF-1信號通路上EGFR、IL-6、HMOX1、bcl-2、NOS3、NOS2和INSR 7個靶點,證明黃連-三七的抗2型糖尿病作用可通過調控HIF-1信號通路實現。Akt是PI3K通路末端重要的靶蛋白,PI3K-Akt通路在胰島素調節血糖穩定方面發揮作用,孟昭杰[24]發現黃連素能上調糖尿病患者受損的Akt活性,促進GLUT4轉位,從而改善胰島素抵抗,這與本研究富集在PI3K-Akt通路的結論是吻合的。叉頭轉錄因子(FoxO)是體內一重要的轉錄因子,已證實與糖代謝密切相關[25];據王水秀等[26]報道,NF-κB信號通路的活化與炎癥反應及胰島素抵抗的發生密切相關;這些通路也可能是黃連-三七抗2型糖尿病的主要途徑之一。
本研究首次采用網絡藥理學的方法對“黃連-三七”藥對抗2型糖尿病的復雜機制進行了探究,成功預測了黃連-三七藥對抗2型糖尿病的主要活性成分、作用靶點和相關信號通路,體現了中藥復方多成分、多靶點、多通路的特點,為進一步深入探討作用機制奠定基礎,同時也為中藥復方治療2型糖尿病的物質基礎和作用機制提供了借鑒。誠然,網絡藥理是一種新興的研究方法,本研究的結論仍存在局限性,尚需要基礎和臨床藥理試驗的進一步驗證。