DNA甲基化驅(qū)動(dòng)的轉(zhuǎn)錄表達(dá)特征作為肝癌預(yù)后預(yù)測(cè)標(biāo)志物的價(jià)值

駱紅波，曹鵬博，周鋼橋,

研究報(bào)告

DNA甲基化驅(qū)動(dòng)的轉(zhuǎn)錄表達(dá)特征作為肝癌預(yù)后預(yù)測(cè)標(biāo)志物的價(jià)值

駱紅波1，曹鵬博2，周鋼橋1,2

1. 貴州大學(xué)醫(yī)學(xué)院，貴陽 550025 2. 軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院輻射醫(yī)學(xué)研究所，蛋白質(zhì)組學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心(北京)，北京 100850

肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma，簡(jiǎn)稱肝癌)是最常見的惡性腫瘤之一。DNA甲基化的異常是惡性腫瘤的特征之一，并被發(fā)現(xiàn)在肝癌等腫瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用。為了能為肝癌患者提供新的臨床預(yù)后預(yù)測(cè)標(biāo)志物，本研究首先采用整合組學(xué)分析策略在全基因組范圍內(nèi)鑒定與肝癌患者預(yù)后相關(guān)的DNA甲基化驅(qū)動(dòng)的差異表達(dá)基因；然后，采用LASSO (least absolute shrinkage and selection operator)分析建立了10個(gè)最優(yōu)基因組合的預(yù)后預(yù)測(cè)模型。Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸分析顯示，在校正臨床特征參數(shù)后，此預(yù)測(cè)模型高風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分與患者不良預(yù)后顯著相關(guān)，表明該模型具有潛在的獨(dú)立預(yù)后價(jià)值。受試者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲線分析顯示該風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型在預(yù)測(cè)患者短期和長(zhǎng)期預(yù)后方面優(yōu)于其他已被報(bào)道的肝癌預(yù)后預(yù)測(cè)模型。基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)表明，高風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分與細(xì)胞周期和DNA損傷修復(fù)通路相關(guān)。以上結(jié)果表明，本研究構(gòu)建了一個(gè)基于10個(gè)DNA甲基化驅(qū)動(dòng)基因的預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型，該模型可作為肝癌患者的潛在預(yù)后生物標(biāo)志物，有助于肝癌患者的生存預(yù)后評(píng)估和治療策略的指導(dǎo)。

肝癌；轉(zhuǎn)錄組；表觀基因組；預(yù)后模型

肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma；簡(jiǎn)稱肝癌)是最常見的原發(fā)性肝癌，也是全球范圍內(nèi)與癌癥相關(guān)死亡的主要原因之一[1]。……