陳鳳珍,游麗金,楊帆,王麗娜,郭學芹,高飛,華聰,談聰,方林,單日強,曾文君,王博,王韌,徐訊,,4,魏曉鋒
資源與平臺
CNGBdb:國家基因庫生命大數據平臺
陳鳳珍1,游麗金1,楊帆1,王麗娜1,郭學芹1,高飛1,華聰1,談聰1,方林2,單日強3,曾文君1,王博1,王韌1,徐訊1,2,4,魏曉鋒1
1. 深圳國家基因庫,深圳 518120 2. 深圳華大生命科學研究院,深圳 518083 3. 深圳華大智造科技有限公司,深圳 518083 4. 廣東省高通量基因組測序與合成編輯應用重點實驗室,深圳 518120
國家基因庫生命大數據平臺(China National GeneBank DataBase, CNGBdb)是一個致力于生命科學多組學數據歸檔和開放共享的數據庫平臺,是深圳國家基因庫的核心功能“三庫兩平臺”中生物信息數據庫的對外服務平臺,擁有深圳國家基因庫豐富的樣本資源、數據資源、合作項目資源和強大的數據計算和分析能力等優勢。生命科學研究已經進入到了一個以高通量多組學數據為基礎的大數據時代,迫切需要加強國際合作和信息共享。隨著中國經濟的發展和在生命科學研究領域的研究項目投入力度的加大,需要建立相關的生命大數據歸檔和共享的平臺, 來促進我國生命科學研究項目中生成的基因組學數據的系統管理、開放共享與合理利用。目前,CNGBdb主要提供生命科學研究相關的數據歸檔、知識搜索、數據管理、數據計算和數據服務等服務。其歸檔和共享的數據類型,主要包括項目、樣本、實驗、測序、組裝、變異、序列等。截止2020年5月22號, CNGBdb已接受了全球生命科學科研工作者提交的研究項目達2176個,歸檔的基因組學數據量超過2221 TB。……