分子對接模擬法與多光譜法研究鹽酸金霉素與胃蛋白酶的相互作用

王曉霞，于洋洋，馬力通，聶智華，王正德，崔金龍，賽華征，趙文淵

1. 內蒙古科技大學化學與化工學院，內蒙古 包頭 014010 2. 中國石油大學(華東)化學工程學院，山東 青島 266580 3. 清華大學生命科學學院，北京 100084

引 言

金霉素(chlortetracycline，CTC)是一種能抑制革蘭陽性菌和陰性菌的活性四環素類抗生素。胃蛋白酶(pepsin，PEP)主要存在于胃液中，是一種多肽水解酶[1-2]。當CTC經口服進入胃中后，通常會與胃液中的酶結合，由于CTC分子含有多個具有活性的酚羥基，可能會與胃蛋白酶上的活性基團相互作用，從而使PEP的活性發生改變。近年來，藥物小分子與蛋白酶的相互作用吸引了國內外研究學者的廣泛關注。Fatemeh S. Mohseni-Shahri[3]使用多光譜法和分子動力學模擬，探究了食品添加劑日落黃與PEP的結合機理；Mallika Pathak[4]運用多光譜法和熱力學計算，研究了二甲雙胍與PEP的結合反應。

使用多光譜法與分子對接模擬法研究PEP與CTC之間的相互作用，通過探討CTC與PEP的相互作用機制，可進一步了解CTC對PEP活性和功能的影響，以及了解CTC在體內的藥效動力學和代謝動力學，為改良藥物和開發新藥提供參考依據。

1 實驗部分

1.1 儀器與試劑

熒光分光光度計(LS-55，美國PerkinElmer公司)；紫外可見近紅外分光光度計(CARY-5000，美國安捷倫科技有限公司)；圓二色譜儀(Chirascan plus，英國應用光物理公司)。

1.0×10-4mol·L-1金霉素(Chlortetracycline Hydrochloride，質量分數為95.3%，中國藥品生物制品檢定所)溶液；0.1 mol·L-1pH 2.00的三(羥甲基)氨基甲烷(Tris hydroxymethyl aminomethane，Tris，質量分數≥99.0%)0.5 mol·L-1的NaCl溶液；5×10-4mol·L-1胃蛋白酶(porcine stomach mucose，PEP，純度≥98%，上海金穗生物科技有限公司)溶液。

1.2 方法

1.2.1 熒光光譜的測定

取十支比色管，分別加入1.0 mL的PEP溶液(5.0×10-4mol·L-1)，再分別加入適量的CTC溶液(1×10-4mol·L-1)，定容至10 mL，使管內CTC濃度分別為(0，0.5，1.0，1.5，2.0，2.5，3.0，3.5，4.0和4.5)×10-5mol·L-1。……