石旦,徐斌,蔣敬庭(蘇州大學(xué)附屬第三醫(yī)院腫瘤生物診療中心,江蘇省腫瘤免疫治療工程技術(shù)研究中心,蘇州大學(xué)細(xì)胞治療研究院,江蘇常州213003)
目前已有多種針對(duì)非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)特別是晚期NSCLC的分子靶向藥物。但對(duì)于特定突變位點(diǎn)之外的NSCLC患者[1],仍迫切需要新的治療靶點(diǎn)。本研究建立了一種基于預(yù)后價(jià)值的篩選生物標(biāo)志物的方法,同時(shí)考慮候選基因在NSCLC良惡性組織中的表達(dá)差異,最終選取母體胚胎亮氨酸拉鏈激酶(MELK)作為研究對(duì)象。MELK又名小鼠蛋白絲氨酸/蘇氨酸激酶38(MPK38)[2],是一種AMPK相關(guān)的絲氨酸—蘇氨酸激酶,在不同物種間高度保守[3]。在正常組織中,MELK僅在睪丸中表達(dá),其在胸腺和小腸中的表達(dá)水平非常低[4]。MELK最初被鑒定為信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)因子,作為細(xì)胞內(nèi)信號(hào)調(diào)節(jié)物發(fā)揮重要作用,并影響各種細(xì)胞和生物學(xué)過程,包括細(xì)胞周期、細(xì)胞增殖、凋亡、剪接體組裝、基因表達(dá)、胚胎發(fā)育、造血和腫瘤發(fā)生等[3]。MELK可被不同外源性刺激激活,包括H2O2、腫瘤壞死因子-α(TNF-α)、硫精氨酸、離子霉素、TGF-β1、5-氟尿嘧啶(5FU)和阿霉素(DOX)等,它們可觸發(fā)ASK1,TGF-β和p53信號(hào)通路[5]。此外,研究證實(shí)MELK具有廣泛的底物特異性。可通過磷酸化激活MAP3K5/ASK1,以激活細(xì)胞凋亡,也可通過介導(dǎo)CDC25B的磷酸化調(diào)節(jié)細(xì)胞周期[6],從而導(dǎo)致細(xì)胞增殖和致癌。雖然MELK在其他腫瘤中已有相關(guān)研究[7-8],但在NSCLC預(yù)后判斷中的作用尚未明晰。本研究基于TCGA和GEO數(shù)據(jù)庫(kù)等公開的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù),旨在闡明MELK在NSCLC中的預(yù)后價(jià)值。
1.1數(shù)據(jù)檢索方法 以“肺癌”為關(guān)鍵詞檢索腫瘤基因組圖譜計(jì)劃(TCGA)和基因表達(dá)譜(GEO數(shù)據(jù)庫(kù)),并制定檢索策略,檢索流程見圖1。……