楊樹miR393對FBL基因家族成員調(diào)控作用的鑒定

唐 芳，楚立威，賀學(xué)嬌，舒文波，盧孟柱

（1.中國林業(yè)科學(xué)研究院 a.林業(yè)研究所；b.林木遺傳育種國家重點實驗室；c.國家林業(yè)和草原局林木培育重點實驗室，北京 100091；2.南京林業(yè)大學(xué) 南方現(xiàn)代林業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心，江蘇 南京 210037；3.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) a.教育部園藝植物生物學(xué)重點實驗室；b.園藝與林業(yè)科學(xué)學(xué)院，湖北 武漢 430070）

microRNAs（miRNAs）是一類長度為21 ～ 22 個核苷酸的負(fù)調(diào)控非編碼小RNA，可以對其特異的靶基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后負(fù)調(diào)控[1-2]。大部分miRNAs 是以獨立的轉(zhuǎn)錄單位存在，由RNA 聚合酶II 轉(zhuǎn)錄成的原始轉(zhuǎn)錄本（pri-miRNA），可以形成一個發(fā)卡結(jié)構(gòu)并被進(jìn)一步剪切，釋放出成熟的miRNAs。植物miRNAs 通過靶向mRNA 進(jìn)行剪切或翻譯抑制，在植物發(fā)育和環(huán)境脅迫反應(yīng)中發(fā)揮重要的調(diào)控作用[3-4]。miRNA 是通過堿基互補(bǔ)配對原則選擇靶基因的，因此一個靶基因家族中的成員因具有同源度高的結(jié)構(gòu)域，可能會同時受到相同miRNA 的調(diào)控。

大多數(shù)miRNA 家族在植物進(jìn)化過程中具有較高的保守性[5]。miR393 作為植物體中保守的miRNA 家族之一，在擬南芥、水稻、楊樹等不同植物物種中均存在。盡管編碼miR393 前體的序列在物種內(nèi)、物種間各有不同，但其成熟體序列相同或只有1 ～2 個堿基的差別[6-8]。擬南芥miR393是由MIR393a 與MIR393b 2 個前體編碼而來，但成熟體序列完全相同，它的靶基因是4 個F-box 家族的生長素受體基因（TIR/AFB）[6]，miR393 可直接對TIR/AFB轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行剪切，起負(fù)調(diào)控作用[5-6,9]。 在水稻中，miR393 2 個前體編碼的成熟體只有1 個堿基長度的差異，且只靶向剪切OsTIR1與OsAFB22 個基因[10-11]。在楊樹中，通過小RNA與降解組高通量測序，發(fā)現(xiàn)miR393 由4 個前體編碼，但成熟體序列完全相同，并且有4 個TIR/AFB同源家族基因可能受到miR393 的剪切[12]。……