師睿,張毅,王雅春,黃濤,盧國昌,岳濤,盧振西,黃錫霞,衛(wèi)新璞,馮書堂,陳軍,烏蘭·卡格德爾,茹先古麗·阿不力孜,努爾胡馬爾·木合塔爾
研究報告
利用SNP芯片信息評估新疆近交牛基因組純合度
師睿1,張毅1,王雅春1,黃濤2,盧國昌3,岳濤4,盧振西3,黃錫霞5,衛(wèi)新璞6,馮書堂7,陳軍8,烏蘭·卡格德爾8,茹先古麗·阿不力孜8,努爾胡馬爾·木合塔爾8
1. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院,農(nóng)業(yè)農(nóng)村部動物遺傳育種與繁殖(家畜)重點實驗室,畜禽育種國家工程實驗室,北京 100193 2. 新疆石河子大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,石河子 832000 3. 新疆錦盛旺農(nóng)業(yè)科技有限公司,塔城 834700 4. 新疆塔城地區(qū)畜牧科技研究推廣中心,塔城 834700 5. 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院,烏魯木齊 830052 6. 新疆呼圖壁種牛場有限公司,昌吉 831100 7. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所,北京 100193 8. 新疆維吾爾自治區(qū)畜牧總站,烏魯木齊 830009
新疆近交牛是經(jīng)45年近親繁育形成的近交群體,但由于繁育記錄缺失,其原始親本品種未知。為了明確新疆近交牛的遺傳背景,并探索利用基因組信息評價牛群近交水平的可行性,本研究利用該群體及荷斯坦牛、新疆褐牛和哈薩克牛等16個國內(nèi)外牛品種的SNP芯片數(shù)據(jù),應(yīng)用主成分分析和Admixture方法對塔城地區(qū)新疆近交牛的群體結(jié)構(gòu)進行分析;通過進一步計算新疆近交牛、荷斯坦牛、新疆褐牛和哈薩克牛的群體遺傳學(xué)參數(shù)以及基因組近交指標評估各群體近交程度;結(jié)合新疆近交牛的體型分類和基因組近交指標信息,探討了個體近交程度與體型表現(xiàn)的關(guān)系;……