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早期青光眼相關(guān)基因的關(guān)鍵lnc RNA分析

2020-04-26 01:30:33吳國強李軍陳彤王海峰
健康大視野 2020年7期
關(guān)鍵詞:分析

吳國強 李軍 陳彤 王海峰

【摘 要】目的:通過早期青光眼相關(guān)基因的關(guān)鍵lnc RNA分析,探索早期青光眼發(fā)生機(jī)制。方法:本文納入2018年8月-2020年3月我院200例早期青光眼病例數(shù),其中正常人和青光眼各100例,分別設(shè)為對照組和觀察組,系統(tǒng)地分析早期青光眼相關(guān)基因的關(guān)鍵lnc RNA,運用統(tǒng)計學(xué)方法篩選出差異lnc RNA。結(jié)果:觀察組青光眼基因關(guān)鍵lnc RNA特異表達(dá)量民新概念多于對照組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),其中對關(guān)鍵基因進(jìn)行通路分析,發(fā)現(xiàn)主要集中在補體和凝血級聯(lián)通路,細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用等通路。結(jié)論:早期青光眼相關(guān)基因的關(guān)鍵lnc RNA參與到疾病發(fā)生機(jī)制中,為研究疾病進(jìn)展提供理論基礎(chǔ)和方向。

【關(guān)鍵詞】早期青光眼;相關(guān)基因;關(guān)鍵lnc RNA;分析

【中圖分類號】R770.43;R775【文獻(xiàn)標(biāo)志碼】A【文章編號】1005-0019(2020)07-228-01

隨著電子產(chǎn)品的廣泛普及和生活方式的變化,早期青光眼發(fā)病人數(shù)不斷增多,嚴(yán)重影響人類身心健康和生活質(zhì)量[1]。青光眼作為一種致盲性眼病,早期診斷和及時治療是保障視力的關(guān)鍵,因其受到多種誘發(fā)因素影響,因此我們對發(fā)病的相關(guān)基因的關(guān)鍵lnc RNA進(jìn)行分析。長鏈非編碼RNA(LncRNA)是一類長度大于200個核苷酸不具備編碼蛋白質(zhì)功能的轉(zhuǎn)錄子,在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄或轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)節(jié)基因的表達(dá),維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài)[2]。最新研究發(fā)現(xiàn)許多關(guān)鍵Lnc RNA特異表達(dá)和眼部疾病有著密切關(guān)系。本文旨在通過分析早期青光眼相關(guān)基因的關(guān)鍵lnc RNA,為青光眼的早期診斷提供新思路,選取正常人和青光眼各100例,現(xiàn)報道如下。

1 資料與方法

1.1 臨床資料

本文納入2018年8月-2020年3月我院200例早期青光眼病例數(shù),其中正常人和青光眼各100例,分別設(shè)為對照組和觀察組。患者年齡15-76歲,其中男女比例為105:95,平均年齡為(37.48±4.63)歲。從基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(GEO)中找到收錄的關(guān)鍵lnc RNA基因。所有參與本次研究的患者均簽署知情同意書。

1.2 方法

為了得到可利用數(shù)據(jù),按照生物學(xué)和統(tǒng)計學(xué)可比性原則將GEO樣本數(shù)據(jù)組成不同的數(shù)據(jù)集( GDS)。每個數(shù)據(jù)集都載入對應(yīng)的實驗內(nèi)容,包括摘要、變量、數(shù)據(jù)顯示方式和分析工具等,將此作為下游數(shù)據(jù)挖掘的基礎(chǔ)。系統(tǒng)地分析早期青光眼相關(guān)基因的關(guān)鍵lnc RNA,運用統(tǒng)計學(xué)方法篩選出差異lnc RNA。

1.3 統(tǒng)計學(xué)處理

本次數(shù)據(jù)導(dǎo)入統(tǒng)計學(xué)軟件SPSS17.0處理,標(biāo)準(zhǔn)差(x±s)代表計量資料,t檢驗;%代表計數(shù)資料,x2驗證,P<0.05表示具有統(tǒng)計學(xué)意義。

2 結(jié)果

兩組早期青光眼相關(guān)基因的關(guān)鍵lnc RNA分析 觀察組青光眼基因關(guān)鍵lnc RNA特異表達(dá)量民新概念多于對照組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),其中對關(guān)鍵基因進(jìn)行通路分析,發(fā)現(xiàn)主要集中在補體和凝血級聯(lián)通路,細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用等通路。

3 討論

研究表明多種 LncRNA 的表達(dá)失衡在腫瘤細(xì)胞的增殖、轉(zhuǎn)移、干細(xì)胞的全能性、免疫細(xì)胞的發(fā)育及應(yīng)答過程中發(fā)揮重要。同時相關(guān)基因的關(guān)鍵lnc RNA參與到早期青光眼等表達(dá)中。早期青光眼發(fā)病原因尚未完全明確,但認(rèn)為和神經(jīng)節(jié)細(xì)胞病變和神經(jīng)損傷有關(guān),屬于一種慢性神經(jīng)退行性疾病。世界失明群體中有10%左右是青光眼導(dǎo)致的視神經(jīng)性病變造成,其病理特征表現(xiàn)為逐漸喪失的視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)細(xì)胞及區(qū)域視野損失[3]。早期青光眼作為一種多因素疾病,體內(nèi)基因和外在環(huán)境都是重要發(fā)病因素,并對病變起到關(guān)鍵作用,當(dāng)前我們主要通過青光眼相關(guān)的眼壓、視野、房角等診斷青光眼疾病,但是早期檢出率不夠理想,經(jīng)常漏診或誤診,因此隨著生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,臨床開始采取基因測序技術(shù)診斷青光眼,明確其發(fā)病機(jī)制。

早期青光眼相關(guān)基因的關(guān)鍵lnc RNA位于編碼LOXL1反義鏈上,并和剝脫綜合征(XFS)有著密切關(guān)系,選擇對青光眼進(jìn)行分期的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析,分析早期青光眼差異表達(dá)基因,深入挖掘數(shù)據(jù)[4],尋找青光眼內(nèi)在發(fā)病機(jī)制,以提高早期檢出率,在明確青光眼疾病后可及時采取治療措施。一直以來,長鏈非編碼RNA(Lnc RNA)被認(rèn)為是垃圾DNA,其中長度大于200各核苷酸幾乎不參與蛋白質(zhì)編碼過程的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為Lnc RNA。但隨著生物基因技術(shù)研究的進(jìn)展,Lnc RNA逐漸被發(fā)現(xiàn)具有不同的生物學(xué)功能,參與到細(xì)胞增殖、遷移、凋亡,調(diào)節(jié)干細(xì)胞分化等過程中,發(fā)揮出微小RNA(MiroRNA)的前體作用。Lnc RNA關(guān)鍵基因分類多樣,其存在的價值有所不同,但可證實的是,其基因和早期青光眼發(fā)病機(jī)制有關(guān),并且可通過研究lnc RNA基因研究得到診斷人類眼科疾病的方法。本次研究結(jié)果顯示,Lnc RNA可以在染色質(zhì)重構(gòu)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控以及蛋白質(zhì)代謝等水平發(fā)揮重要作用,提高早期青光眼檢出診斷率。

綜上所述,早期青光眼相關(guān)基因的關(guān)鍵lnc RNA參與到疾病發(fā)生機(jī)制中,為研究疾病進(jìn)展提供理論基礎(chǔ)和方向。

參考文獻(xiàn)

[1]肖情, 馮光強. microRNA對原發(fā)性青光眼TGF-β和CYP1B1基因調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 眼科新進(jìn)展, 2014, 34(5):497-500.

[2]趙燕燕, 張豐菊, 朱思泉, et al. 人眼鞏膜組織中亮蛋白聚糖基因mRNA水平與高度近視及青光眼的相關(guān)性[J]. 中華醫(yī)學(xué)雜志, 2012, 92(9):608-611.

[3]王麗媛, 孫河, 于天洋. MicroRNA在青光眼防治的研究進(jìn)展和前景展望[J]. 中國中醫(yī)眼科雜志, 2016(6).

[4]岳秀娟, 王麗媛, 蘇勝, et al. 與眼部疾病相關(guān)的長鏈非編碼RNA的研究進(jìn)展[J]. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展, 2018, 18(24):204-207.

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