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QIAamp DNA Investigator 試劑盒提取腐敗肋軟骨1例

2020-03-17 05:21:16
廣東公安科技 2020年4期

(廣東正孚法醫(yī)毒物司法鑒定所,廣東廣州 510663)

1 案例檢驗(yàn)

1.1 檢材來(lái)源

受交警委托,本單位受理了1 例在交通事故身亡的死者肋軟骨,要求將死者與疑似父母進(jìn)行親權(quán)鑒定。送檢的肋軟骨呈淡黃色,表面附著灰褐色腐肉。

1.2 DNA提取

先去除肋軟骨周?chē)母瘮〗M織等表面垢物,用滅菌超純水沖洗干凈。用干凈手術(shù)刀片切除四周后從深中部切取5mm×5mm×1mm 共2份肋軟骨,放入1.5mL 離心管中,分別用Chelex-100 法和QIAamp DNA Investigator 試劑盒(硅珠法)進(jìn)行提取。

1.2.1 Chelex-100法

加入300μL 5%Chelex-100、10mg/mL 蛋白酶K 10μL,56℃消化2h,期間多次渦旋混勻,置于98℃加熱煮沸10min,13000r/min 離心5min,取上清備用。

1.2.2 硅珠法

按照德國(guó)QIAGEN 公司的QIAamp DNA Investigator試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行DNA提取操作。

1.3 DNA擴(kuò)增及電泳

選用Thermo Fisher 公司的華夏白金試劑盒,擴(kuò)增體系為15μL,取DNA上清2μL,加入Master Mix 6μL、Primer Mix 6μL、PnG Buffer 1μL。同時(shí)設(shè)置陰陽(yáng)性對(duì)照。

擴(kuò)增參數(shù):95℃變性1min;94℃3s、59℃16s、65℃29s,30 個(gè)循環(huán);60℃終延伸15 min;4℃保存?zhèn)溆谩U(kuò)增產(chǎn)物在3130XL遺傳分析儀上電泳,數(shù)據(jù)經(jīng)GeneMapper ID-X 軟件進(jìn)行分析。

2 結(jié)果

2.1 采用Chelex-100法和QIAamp DNA Investigator 試劑盒法提取腐敗肋軟骨DNA,結(jié)果顯示,用Chelex-100法提取的DNA未得到有效擴(kuò)增(見(jiàn)圖1);而用硅珠法提取的DNA,包括1 個(gè)Amelogin 位點(diǎn)、1 個(gè)Y-Indel 位點(diǎn)在內(nèi),共25個(gè)基因座獲得成功分型(見(jiàn)圖2)。

2.2 將死者肋軟骨STR 分型數(shù)據(jù)與疑似父母的分型結(jié)果進(jìn)行比對(duì)分析,死者所有基因座上的等位基因均能從疑似父母雙方找到來(lái)源,按照GB/T37223-2018進(jìn)行親權(quán)指數(shù)的計(jì)算,累積親權(quán)指數(shù)CPI均大于10000,達(dá)到認(rèn)定親權(quán)關(guān)系的標(biāo)準(zhǔn)。

圖1 Chelex-100法

3 討論

對(duì)于新鮮肋軟骨,直接擴(kuò)增法或Chelex-100法便可成功獲得STR分型[1~3]。但在實(shí)際檢案中發(fā)現(xiàn)[4],肋軟骨的腐敗程度與年齡、死亡時(shí)間、離體時(shí)間、保存條件等相關(guān),可表現(xiàn)為色澤、氣味等方面的變化。……

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