基于分子對接的計算機虛擬篩選技術在新藥發現中的應用進展*

劉玉甜，趙詩雨，呂邵娃

（黑龍江中醫藥大學，黑龍江 哈爾濱 150040）

計算機虛擬篩選技術作為一個計算機輔助藥物設計和高通量篩選的重要方法[1],是在生物結構的基礎上發現新的配體的過程，該過程極大的縮小了人工方法進行配體活性篩選的研究范圍[2]。近些年來，作為一種與高通量篩選互補的便捷工具,順利的加入到了新型藥物研究與發現的工作流程中[3]。通過富集活性化合物,提高藥物篩選的可行性,因此，成為新型藥物發現的重要方法。先進行小分子與生物蛋白活性篩選的結合,可以有效地促進新藥的發現[4]。最終形成了藥物研究的新模式。虛擬篩選技術是基于計算機的方法在生物結構的基礎上發現新的配體的過程，是創新藥物研究的新技術和新方法[5]。理論上講，虛擬篩選是一種通過計算機進行數據庫篩選的過程。最終形成了藥研物究的新模式。在未來，虛擬篩選技術將成為一個用于探索相關生物化學空間的重要的手段。計算機虛擬篩選具有高效、快速、低成本等很多優點。本文就基于分子對接的計算機虛擬篩選技術在新藥發現中的應用現狀、未來前景發展及發展局限性問題作一簡單介紹。

1 新藥研究中計算機虛擬篩選的常用數據庫

藥物篩選是否成功的一個關鍵性因素在于從化合物數據庫中篩選出的化合物的質量和數量。虛擬篩選是計算機輔助藥物設計方法的延伸和推廣,在新藥發現的過程中，如果先進行虛擬篩選即從大量分子數據庫中篩選出少量的目標化合物，再針對性進行藥物理論檢測。……