基于長讀長高通量基因測序技術在腫瘤融合基因檢測中的應用進展

劉 政，黃 玲，萬紹貴，劉曉平

（1.贛南醫學院第一臨床醫學院；2.贛南醫學院基礎醫學院；3.贛南醫學院分子病理中心；4.贛南醫學院第一附屬醫院普外科，江西 贛州 341000）

過去數十年的研究證實基因突變是腫瘤形成的重要因素，融合基因是其典型例子［1］。融合基因是腫瘤產生、發展的重要驅動因素，同時也作為臨床重要的分子生物學標志，在癌癥的診斷、靶向治療以及預后具有重要的意義［1-2］。然而現有的臨床檢測技術都存在一些不足。第二代測序技術（Second generation sequencing，SGS）憑借其高通量和相較于第一代基因測序技術更低的價格，成為現代醫學遺傳常規診斷工具［3-4］。但其短讀長及過高的價格，限制了其在臨床上的應用。近年來第三代基因測序技術（Third generation sequencing，TGS）的出現為高通量測序技術的臨床應用帶來了曙光，TGS 技術最大的特點就是單分子實時測序，相對于SGS技術，不僅在價格上具有優勢，其獨特的長讀長測序在結構變異及重復序列檢測方面更加準確，更加適用于融合基因檢測。

1 融合基因及其檢測技術

融合基因是兩個獨立的基因串聯產生的染色體結構變異（圖1）。堿基的缺失、重復和倒置，且錯誤序列達到50 bp以上時，就能產生融合基因［2］。近些年也有研究表明，臨近基因的轉錄通讀或mRNA分子的剪接，前信使RNA 的反式和順式剪接是導致融合基因產生的重要原因［5-6］。關于融合基因導致癌癥的產生機制，目前已知的有兩種：癌基因與強啟動子融合而導致其表達上調［7］；融合基因可以翻譯兩個基因的嵌合結構域，從而表達融合蛋白，使得這種嵌合蛋白的活性異常或者內源性蛋白功能喪失。……