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2020-02-20 04:54:26
遺傳 2020年12期

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Nature | 10+小麥基因組揭示全球小麥當代育種材料豐富的變異

基因組技術的發展加快了水稻(L.)、玉米(L.)等多種重要農作物的改良進程,與其相比,普通小麥(L.)卻面臨著諸多挑戰。普通小麥作為多倍體,基因組龐大且復雜,序列組裝拼接困難,缺乏多小麥品系的基因組組裝數據為小麥改良提供參考。小麥10+基因組團隊基于飛速發展的基因組測序及組裝技術,由加拿大薩斯喀徹溫大學、瑞士蘇黎世大學Thomas Wicker、德國環境健康研究中心Manuel Spannagl和加拿大農業和農業食品部Curt A. McCartney等合作完成了15個六倍體小麥的基因組拼裝,其中10個達到染色體水平參考基因組的質量,另外5個為scaffold水平的基因組,并探討了全球育種計劃中小麥品系的基因組多樣性(2020年11月25日在線發表,doi: 10.1038/s41586-020-2961-x)。通過比較分析組裝的10+六倍體小麥基因組序列,該研究分析了一些農藝性狀相關基因家族在各個基因組中的分布,注釋了大量的NLR抗病基因;揭示了這些小麥品系中廣泛的結構重排、野生近緣物種基因片段的導入以及復雜的育種歷史導致的基因含量差異;開發了單倍型可視化工具,快速鎖定了一個抗小麥橙色花蠓蟲(Géhin)的基因,該工具為農藝性狀基因的篩選定位提供了極大的便利。10+小麥基因組這項工程將為小麥功能基因的發現和育種提供基礎,從而促進未來小麥新品種的培育。■推薦人:孔令讓

Developmental Cell | 時空各異的轉錄因子可組合發揮功能

盡管單個轉錄因子的表達和功能并非高度特異,但是通過多個轉錄因子的組合可以發揮細胞特異性功能。……

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