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L-纈氨酸對巨噬細胞raw264.7的作用

2019-12-20 09:18:08倪宇昕章立群謝安琪劉學楊旭
中國老年學雜志 2019年24期
關鍵詞:分析

倪宇昕 章立群 謝安琪 劉學 楊旭

(1華中科技大學協和深圳醫院口腔科,廣東 深圳 518000;2吉林大學口腔醫院)

牙列缺損是老年人常見的口腔疾病,而種植治療是最佳的治療方案之一。口腔種植體周圍炎是種植治療最常見的并發癥,病因是菌斑生物膜及其引起的免疫炎癥反應。巨噬細胞是天然免疫系統的重要組成之一,能對外界刺激產生炎癥反應〔1,2〕。有多個研究證明聯合應用脂多糖(LPS)和干擾素(IFN)-γ刺激巨噬細胞后,會誘導M1型巨噬細胞極化,表現為白介素(IL)-1β、腫瘤壞死因子(TNF)-α和IL-6的升高,引起后續的炎癥反應〔3~5〕。有學者報道了巨噬細胞的M1極化參與種植體周圍炎的發生和進展〔6,7〕。

纈氨酸是人體必需的氨基酸之一,根據其構象可以分為L-纈氨酸和D-纈氨酸,在人體中存在的均為L-纈氨酸。前期研究顯示L-纈氨酸參與眾多的生理反應,影響炎癥和腫瘤的發生與轉歸〔8,9〕。然而L-纈氨酸對巨噬細胞M1極化的作用還不清楚,本研究利用轉錄組測序的方法分析L-纈氨酸對巨噬細胞的作用。

1 材料和方法

1.1主要試劑和儀器 L-纈氨酸溶液0.384 mg L-纈氨酸(Sigma,美國)溶于10 ml磷酸鹽緩沖液(PBS)中,制備成320 mmol/L的儲備液,0.22 μm微孔濾膜過濾,4℃保存備用。LPS溶液:將購買的LPS(Sigma,美國)粉末用PBS稀釋成500 μg/ml備用。IFN-γ溶液:將購買的重組小鼠IFN-γ(碧云天,中國)用PBS稀釋成80 ng/μl備用。總RNA提取試劑盒購自上海生工公司(中國),IL-1β、TNF-α和IL-6的酶聯免疫吸附試驗(ELISA)試劑盒購自碧云天公司(中國)。使用的主要儀器有Invitrogen Qubit2.0光度計;Thermo臺式高速低溫離心機;北京六一DYY-11電泳儀;復日科技FR-980A生物電泳圖像分析系統。

1.2巨噬細胞 小鼠巨噬細胞系Raw264.7細胞購自中國科學院細胞庫,用RPMI1640完全培養液(含10%胎牛血清和1%雙抗),置于條件為37℃和5%CO2的孵箱中培養。

1.3實驗方法 實驗分為空白組、誘導組和L-纈氨酸組。空白組細胞使用RPMI1640培養液培養;LPS+IFN-γ組細胞應用條件培養液(RPMI1640完全培養液、50 μg/ml LPS、20 ng/ml IFN-γ)進行培養;L-纈氨酸組中細胞在條件培養液基礎上分別增加0.8 mmol/L、0.4 mmol/L、0.2 mmol/L和0.1 mmol/L的L-纈氨酸。每組進行獨立的3個生物學重復。

1.4ELISA檢測 將上述各組細胞培養24 h后,分別收集培養基上清,經過10 000 r/min離心5 min后,將上清轉移并進行ELISA檢測。按IL-1β、TNF-α和IL-6試劑盒中說明,建立標準品對照,加入待測上清后進行洗板和顯色等步驟,最后利用酶標儀讀數,每組進行3次重復。

1.5轉錄組測序 向上述LPS+IFN-γ組和0.8 mmol/L的L-纈氨酸組細胞中,分別加入1 ml的Trizol溶液,按設計盒說明提取總RNA并應用Qubit2.0檢測RNA濃度,瓊脂糖凝膠檢測RNA完整性及基因組污染情況。將質檢合格的RNA交付上海生工公司進行建庫與測序,所用測序平臺為IlluminaHiseqTM 2000。獲得下機數據后應用Fast QC軟件進行質量評估和過濾,用Hisat2軟件將質控后的reads同參考基因組進行對比。計算每個基因的(TPM),并據此采用DESeq進行分析,將篩選條件設為:q值<0.05 且差異倍數log 2 FoldChange>1。最后根據篩選出的顯著差異基因結果,將其注釋到GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)數據庫,并分析可能涉及的細胞活動。

2 結 果

2.1ELISA結果 當用LPS和IFN-γ聯合刺激巨噬細胞時,檢測的三種炎癥因子均明顯升高。當L-纈氨酸存在時,TNF-α表達量無明顯規律性的變化;但是IL-1β與IL-6的表達出現明顯劑量相關,即L-纈氨酸會促進這兩種炎癥因子的分泌。見表1。

表1 ELISA檢測結果

與空白組相比:1)P<0.05

2.2RNA瓊脂糖凝膠電泳 成功的提取了擬進行轉錄組測序的六個樣品RNA,通過瓊脂糖凝膠電泳結果表明RNA條帶清晰,拖尾較少,完整度好,達到建庫要求。見圖1。

2.3差異基因表達 經過測序和質控,分別計算了不同樣本的TPM值,并經過生物學重復,得到了L-纈氨酸組與空白組的顯著差異基因28個,其中升高6個,降低22個,這些基因的TPM值及變化倍數如表2所示。

2.4GO和KEGG富集分析 將上述28個顯著差異表達的基因分別進行注釋,GO功能基因分類分析的結果如圖2所示,三個大類中的多個亞類均有基因富集;KEGG分析結果如圖3所示,三條通路的基因富集數尤為明顯。

1:Marker,2~4:LPS+IFN-γ,5~7:0.8 mmol/L L-纈氨酸圖1 瓊脂糖凝膠電泳

表2 L-纈氨酸組中顯著差異表達的基因信息

圖2 顯著表達差異基因的GO分析

圖3 基于差異分析基因的KEGG分析

3 討 論

種植體周圍炎是口腔種植治療最常見的并發癥,表現為牙齦紅腫、種植體松動甚至脫落,增加患者負擔〔10〕。牙菌斑是種植體周圍炎的始動因素,宿主的免疫反應也參與其中,影響種植體周圍炎的進展與轉歸〔11,12〕。巨噬細胞是對牙菌斑刺激發生反應的最主要天然免疫細胞之一,其在感受到LPS存在后,會通過Toll樣受體(TLR)引起下游NF-κB等信號通路的激活,最終引起諸多炎癥因子的升高,包括TNF-α、IL-1β和IL-6等。這些炎癥因子會通過級聯反應,引發更為廣泛和強烈的免疫反應,從而發揮清除細菌的作用〔13~15〕。但是過于強烈的炎癥反應也會引起組織的破壞,促進種植體周圍炎的發生。

通過ELISA結果可以發現,LPS與IFN-γ聯合應用能夠誘導巨噬細胞分泌炎性因子,這與前人研究〔16〕結果相符,隨著培養體系中L-纈氨酸濃度的增加,巨噬細胞分泌的IL-1β和IL-6顯著增加,但是對TNF-α的表達無明顯影響,說明L-纈氨酸能夠促進巨噬細胞的活化,從而發揮抗菌作用。IL-6發揮作用有兩種途徑,第一是cis途徑,IL-6與細胞膜上的IL-6受體(IL6R)結合,引發gp130蛋白聚集形成三聚體;另一種trans途徑,適用于細胞膜上沒有受體的細胞,IL-6與可溶性的IL-6R(sIL6R)結合,引起下游gp130蛋白聚集。IL-6并不直接調控破骨細胞功能,而是通過trans途徑影響RANKL表達,間接促進破骨細胞功能〔17,18〕。但是值得注意的是,高濃度的L-纈氨酸可能會過度誘發宿主的炎癥反應,在實際應用中需要注意控制使用濃度,相關的最適濃度仍需進一步研究。轉錄組測序能夠以高通量方式分析特定模式下的細胞mRNA表達情況,因此成為研究細胞作用和分析機制的高效方法〔19〕。GO注釋分析,說明L-纈氨酸對于巨噬細胞的作用不止局限于炎性因子表達。隨后的KEGG分析結果表明多個信號通路可能介導了L-纈氨酸的調控作用,例如PI3K-Akt通路、Rap1通路和Jak-STAT通路等。在其他研究〔20,21〕中,這些通路已被報道參與了巨噬細胞的激活過程。通過轉錄組測序研究,發現了多個潛在的作用途徑,為進一步后續探討L-纈氨酸調控巨噬細胞活化的機制提供了方向。本研究初步發現了L-纈氨酸能夠促進巨噬細胞炎癥因子的表達,并發現了可能的作用通路,但是考慮到L-纈氨酸在人體代謝中的基礎地位,關于L-纈氨酸對巨噬細胞代謝中的作用和具體機制,仍然需要進一步研究。

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