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新城疫病毒熒光RT-PCR檢測方法的建立

2019-09-26 02:06:54郭瑩瑩王世狀
中國畜禽種業(yè) 2019年9期
關(guān)鍵詞:檢測方法

郭瑩瑩 王世狀

(黑龍江省前進(jìn)農(nóng)場 156331)

新城疫是由新城疫病毒起地對家禽養(yǎng)殖業(yè)危害較大的一種傳染性疾病。該病毒傳播速度快,比較難控制,是檢驗(yàn)檢疫中要求嚴(yán)格檢驗(yàn)控制的一種病毒。PCR 技術(shù)克服了傳統(tǒng)的病原分離及常規(guī)血清學(xué)診斷等方法的費(fèi)時(shí)、費(fèi)力、敏感性和特異型較差的缺點(diǎn),已被應(yīng)用與多種病原微生物的鑒定和檢測。為了適應(yīng)活禽、禽肉制品中,快速、特異的特點(diǎn),本實(shí)驗(yàn)采用“新城疫病毒熒光RT-PCR 檢測試劑盒”,建立快速檢測NDV 的熒光RT-PCR 方法。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)材料

RT-PCR 新城疫診斷試劑盒由北京出入境檢驗(yàn)檢疫局技術(shù)中心和深圳市匹基生物工程股份有限公司聯(lián)合生產(chǎn)。

試劑:PBS 溶液、氯仿、無水乙醇、異丙醇。

樣品A:新城疫病毒,分離自接種病毒雞體。

樣品B:新城疫標(biāo)準(zhǔn)陰性對照,來自試劑盒。

樣品CDEFG:新城疫疑似病毒,分離自農(nóng)戶家甲、乙、丙、丁、戊病死雞體。

樣品H:新城疫標(biāo)準(zhǔn)陽性對照,來自試劑盒。

1.2 試驗(yàn)設(shè)備

小型離心機(jī)、混勻器、冰箱(4℃,-20℃)、熒光PCR 檢測儀、臺(tái)式高速離心機(jī)、吸頭、1.5mL 滅菌離心管、移液器、記號筆、吸水紙、微量板、鑷子。

1.3 方法

1.3.1 病毒RNA 的提取

(1)分別向每瓶樣品中加入2mLPBS 溶液,使其充分溶解。

(2)取8 個(gè)1.5ml 滅菌離心管,做好標(biāo)記。

(3)每個(gè)離心管加入600μL 裂解液,然后分別加入待測樣品、陰陽對照各200μL; 再加入氯仿200μL,混勻器上振蕩混勻5s。

(4)在4℃條件下,12000g 離心15min。

(5)取與步驟1 中相同數(shù)量的1.5ml 離心管,加入400μL異丙醇(-20℃預(yù)冷),做好標(biāo)記。吸取步驟4 各管中的上清液相轉(zhuǎn)移至相應(yīng)的管中,顛倒混勻。

(6)12000g 離心15min。輕輕倒去上清,倒置于濾紙上,沾干液體; 加入75%乙醇600μL,顛倒洗滌。

(7)12000g 離心10min。輕輕倒去上清,倒置于上吸水紙上,盡量沾干液體。

(8)4000g 離心15min。將管壁上的殘余液體甩到管底部,用微量加樣器盡量將其吸干,室溫干燥3min。

(9)加入11μL DEPC 水輕輕混勻,溶解管壁上的RNA,2000g 離心5s,冰上保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3.2 擴(kuò)增試劑準(zhǔn)備

(1)從試劑盒中取出相應(yīng)的RT-PCR 反應(yīng)液,Taq 酶,在室溫下融化后,在2000r/min 離心5s,則所需的PCR 數(shù)為16,每個(gè)測試體系配制如下,把RT-PCR 反應(yīng)液和Taq 酶按每個(gè)PCR 反應(yīng)管加15μL 的PCR 和1/4 顆(即一顆加4 個(gè)孔)的比例配成反應(yīng)液。

(2)把試劑盒中的PCR 板條取出,放在微量板上,在各設(shè)定的PCR 板條管中分別加入上述病毒提取步驟(9)中制備的RNA 溶液各10μL,蓋緊管,使用臺(tái)式離心機(jī)在17℃下9600g離心20min,取出板條,放入熒光PCR 熒光檢測儀內(nèi),記錄樣本擺放順序。

(3)循環(huán)條件設(shè)置。

表1 PCR 循環(huán)條件程序

儀器檢測通道選擇F1 通道

(4)結(jié)果分析條件設(shè)定

讀取F1 通道的檢測結(jié)果。閾值設(shè)定原則以閾值線剛好超過正常陰性對照品擴(kuò)增曲線的最高點(diǎn),結(jié)果顯示陰性為準(zhǔn),或可根據(jù)儀器噪音情況進(jìn)行調(diào)整。

2 判定依據(jù)

CT 值無數(shù)值的為陰性,CT 值≤40.0 的樣本為陽性樣本。同時(shí),陰性對照的檢測結(jié)果為陰性,陽性對照的檢測結(jié)果為陽性。

3 結(jié)果

熒光RT-PCR 儀對試驗(yàn)樣品的檢測結(jié)果見表2 和附圖。

從表2 和附圖可以看出,接種的新城疫病毒,新城疫陽性(試劑盒)為陽性,因?yàn)橹灰顷栃跃陀袑?shù)增長期。所選的幾種疑似病例中以農(nóng)戶家里的曲線走的好,從圖上的順序來看,其曲線中較高的一條(C1)高于新城疫接種病毒的較低的一條(A2)。其兩條曲線(C1,C2)均高于新城疫陽性對照(H1,H2),這說明它是致病性較強(qiáng)的毒株。而樣品D、E、F、G 均為陰性。從本試驗(yàn)中可以得出,疑似病例中只有農(nóng)戶家甲為強(qiáng)毒株,而由其他農(nóng)戶家的疑似病例產(chǎn)生的新城疫病毒均為弱毒株或無毒性。

4 實(shí)驗(yàn)結(jié)論

通過采用RT-PCR 方法來檢測新城疫病毒毒性強(qiáng)弱程度的同時(shí)發(fā)現(xiàn),該檢測方法具備了多項(xiàng)操作優(yōu)勢:

(1)快速:與雞胚病毒分離方法相比,在時(shí)間上來講,從至少需要21d 縮短為4h;

(2)靈敏:針對感染性雞胚尿囊液,人工感染SPF 雞等方面有與雞胚病毒分離方法的敏感性基本一致;

(3)準(zhǔn)確:與雞胚病毒分離相比,特異性基本一致;閾值為:0.172

表2 熒光RT-PCR 對試驗(yàn)樣品的檢測結(jié)果

附圖 試驗(yàn)樣品的熒光RT-PCR 圖

(4)操作簡單:本試劑盒給檢測者提供了質(zhì)量優(yōu)異的試劑及優(yōu)化的操作程序,經(jīng)過簡單的培訓(xùn),檢測者可勝任該項(xiàng)工作。

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