張鳳霞,王國棟
現代代謝組學平臺建設及相關技術應用
張鳳霞,王國棟
中國科學院遺傳與發育生物學研究所,植物基因組學國家重點實驗室,種子創新研究院,北京 100101
代謝組作為生命科學研究的5個層面(基因組、轉錄組、蛋白質組、代謝組和表型組)之一越來越受到科研工作者的關注。色譜–質譜聯用技術由于其高分離能力、高靈敏度等優點在代謝組學(定性和定量)領域發揮重要的作用,基于色譜–質譜聯用技術的代謝組學已成功應用于代謝表型差異研究、基因功能鑒定和轉基因生物安全性評價等多個研究方向。本文以中國科學院遺傳與發育生物學研究所代謝組學平臺為例,詳細介紹了現代代謝組學平臺色譜–質譜聯用儀器的硬件組成,以及不同技術平臺在現在系統生物學研究中的具體應用。
小分子化合物;代謝組學平臺;色譜–質譜聯用;系統生物學
小分子代謝物作為細胞調控過程的終產物,其種類和數量的變化被視為生命體對基因或環境變化的最終響應,對這些化合物在動態和靜態上進行全面的定性定量分析,即為代謝組學研究。它是目前系統生物學研究的一個重要組成部分,主要通過鑒定動植物體內代謝物變化與特定基因表達變化之間的聯系,研究代謝產物在動植物生長發育與環境之間應答中的作用,從而進一步揭示生物體在特定時間、特定環境下代謝網絡的整體狀態,深入解析生命活動規律的內在機制[1]。……