從作物基因組分析到整合組學知識庫建設

梁承志

從作物基因組分析到整合組學知識庫建設

梁承志1,2

1. 中國科學院遺傳與發育生物學研究所，植物基因組學國家重點實驗室，種子創新研究院，北京 100101 2. 中國科學院大學，北京 100049

高通量技術的廣泛應用使得各類組學數據的產出速度越來越快，由此產生的海量數據蘊藏著大量的基因組變異和相關功能信息。如何對這些數據進行深度整合和利用將會是一個長期而艱巨的任務，這需要具備高效的數據存儲、分析和挖掘的能力。在過去幾年中，本課題組通過與所內外課題組的合作，在多個植物的基因組的組裝、注釋、比較基因組和群體基因組分析等方面進行了探索，同時也將大量的水稻種質信息和組學數據進行了整合，存儲于結構化數據庫中并開發了一些相應的網絡查詢展示和數據挖掘工具。本文對相關的研究成果及其進展進行了概括性介紹，并展望了下一步的目標：構建一個用于支持作物功能基因組學和分子設計育種研究的整合組學知識庫。

基因組分析；數據庫；組學大數據；分子設計育種；作物；組學知識庫

近年來，隨著高通量組學技術的迅猛發展，各類組學數據的產出成本越來越低，產出速度也越來越快。這些新技術和海量數據已為動植物功能基因組、人類健康及遺傳育種方面的研究帶來了前所未有的機遇和挑戰。一方面，基因組技術的廣泛應用極大提高了這些領域的研究效率；同時，通過多學科知識、多領域技術和各類組學信息的交叉融匯，這些領域的前沿應用技術也在迅猛發展。……