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喉鱗狀細胞癌ESRRG基因啟動子甲基化及臨床意義研究

2019-08-28 12:38:52胡燕沈志森周重昌袁潔徐捷郝文娟葉棟鄧紅霞
浙江醫學 2019年15期
關鍵詞:水平研究

胡燕 沈志森 周重昌 袁潔 徐捷 郝文娟 葉棟 鄧紅霞

喉癌是常見的頭頸部惡性腫瘤之一[1],其中喉鱗狀細胞癌(LSCC)是最常見的病理學類型[2]。手術和放化療是目前臨床上治療LSCC的主要方法。據統計,LSCC患者的5年生存率較低,這主要是由于患者淋巴結轉移率、復發率和第二原發腫瘤發生率較高所致[3]。LSCC的發生是多因素共同作用的結果,其中包括遺傳因素及吸煙、飲酒、人乳頭瘤病毒感染等環境因素[4],但LSCC發生的具體分子機制尚待深入探討。DNA甲基化是最早發現的基因修飾方式之一,啟動子區域CpG島的甲基化修飾對基因表達的影響十分重要,高甲基化修飾會導致基因轉錄抑制或沉默。抑癌基因高甲基化會導致抑癌作用異常,從而導致癌癥發生、發展[5]。人雌激素相關受體 γ(ESRRG)基因位于人體染色體 1q41[6]。ESRRG蛋白屬孤兒核受體,可在無天然配體的條件下發揮生物學作用[7]。研究表明,ESRRG基因與腫瘤細胞代謝、增殖、轉移等有關,起抑癌作用,包括乳腺癌[8]、子宮內膜癌[9]、卵巢癌[10]及前列腺癌[11]等性別相關腫瘤。據世界癌癥組織統計,LSCC男性高發,在女性中發生率較低,筆者推測LSCC的發生亦與性別相關基因有關。基于此,本研究探討ESRRG基因啟動子在男性LSCC組織中的甲基化狀態,分析其與臨床病理特征及預后的關系,并評估其對LSCC的診斷價值,現報道如下。

1 對象和方法

1.1 對象 選取2011年4月至2015年2月在寧波大學附屬李惠利醫院耳鼻咽喉頭頸外科行手術治療的男性 LSCC 患者 89 例,年齡 40~86(60.15±9.06)歲。患者術前均未接受過放化療。病理學診斷嚴格按照國際癌癥控制聯盟(UICC)分類指南(TNM 2002)分期,其中Ⅰ期28例、Ⅱ期15例、Ⅲ期12例、Ⅳ期34例。患者術后隨訪5年,其中失訪5例,死亡32例,存活52例。術中留取的LSCC組織與距癌組織邊緣0.5cm以上的癌旁正常組織標本立即置于RNA保存液中保存于-80℃冰箱。本研究獲寧波大學附屬李惠利醫院醫學倫理委員會批準,患者知情同意并簽署知情同意書。

1.2 方法

1.2.1 DNA提取及亞硫酸鹽轉化和純化 嚴格按照QIAamp DNA Mini試劑盒 (Qiagen,Hilden,Germany)說明書提取患者LSCC組織與癌旁正常組織的DNA。嚴格按照ZYMO EZ DNA Methylation-Gold試劑盒(ZymoRe.Search,Irvine,CA,USA)說明書進行DNA亞硫酸鹽轉化和純化。

1.2.2 DNA擴增及焦磷酸測序 檢測LSCC組織與癌旁正常組織中ESRRG基因啟動子上連續6個CG位點(hg19:chr1:217311596-217311629)的甲基化水平。嚴格按照聚合酶鏈式反應(PCR)試劑盒(PyroMark PCR Kit;Qiagen)說明書將亞硫酸鹽處理過的DNA進行擴增。ESRRG基因正向引物序列為 5′-TAGAGTTAGAGGGAGATGAATTG-3′,反向引物序列為 5′-Biotin-TCTTTTCAAATCCATCACTAA-3′。PCR反應條件如下:95℃預變性10min后,循環“95℃變性30s,50℃退火 40s,72℃延伸 60s”共 45次。應用 PyroMark Q24(Qiagen)焦磷酸測序儀,按焦磷酸測序試劑盒(EpiTech Bisulfite Kits,Qiagen)說明書對ESRRG基因啟動子進行測序,測序序列為 5′-GGGAGATGAATTGGG-3′,直接從測序儀上讀得ESRRG基因啟動子甲基化水平。以上所有實驗步驟均重復3次,取3次結果的平均值。

1.3 觀察指標 (1)比較LSCC組織與癌旁正常組織ESRRG基因啟動子甲基化水平。(2)分析LSCC組織ESRRG基因啟動子甲基化水平與患者臨床病理特征的關系,包括年齡、吸煙行為及腫瘤組織學類型、部位、T分期、淋巴結轉移及臨床分期等。(3)評估ESRRG基因啟動子甲基化水平對LSCC的診斷價值。(4)以甲基化水平26.41%為臨界值,將患者分為高甲基化組(61例)和低甲基化組(28例),分析 LSCC組織 ESRRG基因啟動子甲基化水平與患者預后的關系。

1.4 統計學處理 應用SPSS 18.0統計軟件;計量資料以表示,LSCC組織與癌旁正常組織ESRRG基因啟動子甲基化水平比較采用配對t檢驗,不同臨床病理特征的LSCC組織ESRRG基因啟動子甲基化水平比較采用兩獨立樣本t檢驗;繪制ROC曲線評估ESRRG基因啟動子甲基化水平對LSCC的診斷價值,得出AUC、靈敏度、特異度;采用Kaplan-Meier法繪制生存曲線,生存率的比較采用log-rank檢驗;P<0.05為差異有統計學意義。

2 結果

2.1 LSCC組織與癌旁正常組織ESRRG基因啟動子甲基化水平比較 見表1。

表1 LSCC組織與癌旁正常組織ESRRG基因啟動子甲基化水平比較(%)

由表1可見,LSCC組織ESRRG基因啟動子每個CG位點的甲基化水平均高于癌旁正常組織(均P<0.05)。6個CG位點甲基化水平的均值可以代表組織的甲基化水平,結果顯示LSCC組織ESRRG基因啟動子甲基化水平高于癌旁正常組織(P<0.05)。

2.2 LSCC組織ESRRG基因啟動子甲基化水平與患者臨床病理特征的關系分析 見表2。

表2 LSCC組織ESRRG基因啟動子甲基化水平與患者臨床病理特征的關系分析

由表2可見,T3~4期患者LSCC組織ESRRG基因啟動子甲基化水平高于 T1~2期患者(P<0.05),Ⅲ、Ⅳ期患者LSCC組織ESRRG基因啟動子甲基化水平高于Ⅰ、Ⅱ期患者(P<0.05)。不同年齡、吸煙行為、腫瘤組織學類型、腫瘤部位、淋巴結轉移的患者LSCC組織ESRRG基因啟動子甲基化水平比較差異均無統計學意義(均 P>0.05)。

2.3 ESRRG基因啟動子甲基化水平對LSCC的診斷價值分析 見圖1。

圖1 ESRRG基因啟動子甲基化水平診斷LSCC的ROC曲線

由圖1可見,AUC為0.81,表明檢測ESRRG基因啟動子甲基化水平對診斷LSCC具有一定的診斷價值。當ESRRG基因啟動子甲基化水平為26.41%時,診斷LSCC的靈敏度、特異度分別為0.7079、0.7865。此時,假陽性率和假陰性率分別為0.2135,0.2921,陽性預測值為0.7683,陰性預測值為0.7292,診斷符合率為74.72%。

2.4 LSCC組織ESRRG基因啟動子甲基化水平與患者預后的關系分析 在隨訪中,5例患者失訪(均為低甲基化組),低甲基化組患者4例死亡,高甲基化組患者28例死亡,其余存活。生存曲線見圖2、3。

圖2 89例LSCC患者生存曲線

圖3 高甲基化組與低甲基化組患者生存曲線比較

由圖2可見,LSCC患者的5年生存率為52.65%。由圖3可見,ESRRG基因啟動子低甲基化組患者5年生存率高于高甲基化組患者(69.03%vs 45.12%,P<0.05)。

3 討論

ESRRG蛋白為孤兒核受體,可在無天然配體的條件下發揮生物學作用。其主要通過結合相關基因啟動子序列,轉錄調控下游靶基因的表達發揮作用,而小分子配體可以加強(PGC-1α[12]、GRIP-1)或抑制(SHP、DAX-1[13]、SMILE[14]、GNL3L)ESRRG 對靶基因的轉錄作用。采用染色體免疫沉淀技術(CHIP)分析發現,ESRRG基因的靶基因有很多[15],目前研究的靶基因包括代謝相關基因如己糖激酶 2(HK2)、甘油醛脫氫酶(GAPDH)及丙酮酸脫氫酶激酶4(PDK4)[16]等;細胞周期相關基因如p21、p27[8]等;細胞遷移相關基因如E-鈣黏附蛋白[17]、S100A4[18]等。因此,ESRRG基因與腫瘤細胞代謝、增殖、轉移等有關。ESRRG與雌激素受體的高度同源主要位于ESRRG的DNA結合結構區,因此ESRRG在性別相關腫瘤中研究較多,發現其主要起抑制腫瘤的作用。

目前臨床診斷LSCC的方法主要包括影像學技術及內鏡或支撐喉鏡下病理學活檢。影像學技術作為普查項目不實際,往往在晚期腫瘤患者癥狀明顯時考慮此技術,并且作為手術參考的輔助項目進行;內鏡或支撐喉鏡下病理學活檢目前仍是LSCC診斷的金標準,但該方法是有創操作,也不適用于普查。LSCC治療方法主要以手術為主,放化療為輔,而晚期LSCC手術大大降低了患者的生活質量,如通氣障礙、發聲障礙等。故尋求微創、簡便、早期診斷LSCC的腫瘤標記物及治療靶點有著重要意義。大量研究從分子遺傳角度對LSCC的發病機制及預后進行研究,而目前仍無巨大的突破,仍未有同甲胎蛋白、癌胚抗原等公認的腫瘤標志物的出現,因此探索LSCC的分子遺傳學機制仍在繼續。目前所知,LSCC患者中大部分為男性。因此,臨床有理由推測男性中存在某種基因表達低于女性,而此基因具有抑制LSCC發生、發展的作用。

已有研究報道DNA高甲基化可導致LSCC抑癌基因表達下調,抑制癌癥進展[19]。在LSCC組織中,高甲基化的基因有 CBY[20]、DAPK[21]等,這些基因都被視為LSCC的抑癌基因。本研究主要探討ESRRG基因啟動子在男性LSCC組織中的甲基化狀態,分析其與臨床病理特征及預后的關系,并評估其對LSCC的診斷價值。結果顯示,ESRRG基因啟動子甲基化水平在男性LSCC組織中明顯高于癌旁正常組織,表明在男性LSCC組織中ESRRG基因的轉錄可能受到限制,從而減少了ESRRG蛋白的表達,加大了LSCC發生的風險。因此,ESRRG基因在LSCC中可能也發揮著抑癌作用。

在ESRRG基因啟動子甲基化水平與LSCC患者臨床病理特征的關系分析中發現,ESRRG基因啟動子甲基化水平與腫瘤T分期和臨床分期呈正相關,而與淋巴結轉移無明顯關系。臨床分期是由TNM分期綜合評估的結果,本研究結果發現ESRRG基因啟動子甲基化水平對臨床分期的影響主要是T分期引起的,因此筆者考慮ESRRG基因啟動子甲基化狀態可能在LSCC中主要對腫瘤大小起抑制作用,可能具有抑制腫瘤增殖的作用。同時ESRRG基因啟動子高甲基化可以預測腫瘤進展情況,可為治療方案作一參考。此外,臨床還可通過降低患者ESRRG基因啟動子甲基化狀態抑制腫瘤進展。研究報道,DNA甲基化狀態與患者的生活習慣有關[22]。在LSCC的研究中,p14、APC基因甲基化與吸煙、飲酒等相關[23]。而本研究中ESRRG基因啟動子甲基化水平與男性LSCC患者吸煙行為并無統計學上的意義,這提示ESRRG基因啟動子甲基化水平與吸煙因素無相關性,可能存在其他影響ESRRG基因啟動子甲基化的危險因素。

腫瘤特異性標志物一直以來是癌癥研究中的熱點話題,而目前尚無特異的腫瘤標志物可以協助早期診斷LSCC及評估LSCC患者預后。本研究結果顯示,ESRRG基因啟動子甲基化水平對診斷LSCC具有較高的靈敏度、特異度,分別為0.7079、0.7865。AUC表明ESRRG基因作為腫瘤標志物具有一定的可靠性,具有較高的診斷價值。其可以與其他腫瘤標志物,如上述CMTM3、miR-34a等基因進行聯合診斷。有研究報道DNA甲基化狀態可納入癌癥的預后指標[21]。據相關數據統計,LSCC患者5年生存率約57%[3]。本研究中LSCC患者的5年生存率約52%,稍低于上述統計情況。將LSCC患者分成高、低甲基化組,對這兩組患者的5年生存率進行比較,發現低甲基化組患者的5年生存率明顯高于高甲基化組,說明ESRRG基因啟動子高甲基化水平是影響LSCC患者預后的不良因素。

綜上所述,本研究結果顯示ESRRG基因啟動子在LSCC組織中呈高甲基化水平,且在T3~4期及Ⅲ、Ⅳ期患者LSCC組織中明顯增高。ESRRG基因啟動子高甲基化LSCC患者預后較差。檢測ESRRG基因啟動子甲基化水平可為LSCC的診斷和靶向治療提供新思路,并為預后判斷提供新線索。

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