譚靜,胡秀彩,呂愛軍,孫敬鋒,劉小雪,廉正義
半滑舌鰨黏蛋白基因的克隆與結(jié)構(gòu)預測
譚靜,胡秀彩,呂愛軍通信作者,孫敬鋒,劉小雪,廉正義
(天津農(nóng)學院 水產(chǎn)學院 天津市水產(chǎn)生態(tài)及養(yǎng)殖重點實驗室,天津 300384)
黏蛋白作為魚類黏液的主要成分,在抵御病原感染過程中發(fā)揮重要作用。以半滑舌鰨()黏蛋白為研究對象,采用RT-PCR方法對其皮膚黏蛋白MUC5AC(即CsMUC5AC)進行基因克隆及結(jié)構(gòu)預測分析。結(jié)果獲得基因片段的長度為2 771 bp,推測編碼917個氨基酸,預測所含5個抗原表位分布在314-321、507-516、578-589、748-762和811-826 aa,3個結(jié)構(gòu)域主要為C8(164-238,624-698 aa)、VWD(1-128,430-588 aa)和VWC(303-365,768-836 aa)。二級結(jié)構(gòu)預測C8區(qū)主要由α-螺旋構(gòu)成、VWD區(qū)以β折疊為主,三級結(jié)構(gòu)蛋白亞基主要由VWD-C8-VWC組成。構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹分析顯示,其與大菱鲆、攀鱸、羅非魚黏蛋白MUC5AC親緣關(guān)系較近,與分泌型黏蛋白家族自然聚為一支。以上結(jié)果為研究半滑舌鰨黏蛋白基因功能提供科學參考。
半滑舌鰨;黏蛋白;基因克隆;結(jié)構(gòu)預測
黏蛋白()作為機體黏膜免疫應答的主要組分之一,備受關(guān)注[1-3]。對人類和哺乳動物研究發(fā)現(xiàn),黏蛋白與腸炎[1]、支氣管炎[2]及多種癌癥[3]等疾病發(fā)生密切相關(guān)。在水產(chǎn)養(yǎng)殖中,魚類易受水體病原微生物感染,主要通過皮膚、鰓和胃腸道等黏膜組織侵入,這些組織中含有黏液細胞,分泌一種保護性黏液,其中黏蛋白作為黏液的主要成分,在抵御病原體感染過程中發(fā)揮著重要作用[4]。研究表明,魚類皮膚黏液中含有多種活性物質(zhì),包括黏蛋白、多糖、免疫球蛋白及酶類等,對魚類的許多生理、病理功能有著重要影響[5-6]。……