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轉(zhuǎn)氨酶高效表達(dá)重組工程菌的培養(yǎng)基及誘導(dǎo)條件優(yōu)化

2019-05-14 10:32:06葉質(zhì)強(qiáng)馮露王心潔鄂松
生物化工 2019年2期
關(guān)鍵詞:實(shí)驗(yàn)

葉質(zhì)強(qiáng),馮露,王心潔,鄂松

(湖北省宏源藥業(yè)科技股份有限公司,湖北黃岡 438600)

轉(zhuǎn)氨酶是可催化氨基酸與酮酸之間氨基轉(zhuǎn)移的一類酶,普遍存在于動(dòng)植物組織和微生物中作為生物催化劑可用于制備手性胺類化合物,其催化效率高、選擇性強(qiáng),相比較化學(xué)合成方法具有反應(yīng)條件溫和、轉(zhuǎn)化率高、立體結(jié)構(gòu)專一、成本低等優(yōu)勢(shì)。酶催化方法制備手性化合物是目前不對(duì)稱合成領(lǐng)域重要的研究方向[4]。

西格列汀是由美國(guó)Merck公司開發(fā)生產(chǎn)用于治療Ⅱ型糖尿病的DPP-Ⅳ抑制劑類藥物。由于傳統(tǒng)化學(xué)合成方法條件苛刻,產(chǎn)率較低,導(dǎo)致成本較高,Merck公司通過和Codexis公司合作開發(fā)了一種新型生物催化劑——轉(zhuǎn)氨酶,使用該酶催化200 g/L濃度底物24h轉(zhuǎn)化率達(dá)92%,ee值大于99.5%。該方法路線(圖1)將轉(zhuǎn)化率提高了13%,同時(shí)減少了19%的廢物[6],因此法獲得了2010年美國(guó)總統(tǒng)綠色化學(xué)挑戰(zhàn)獎(jiǎng),也為藥物的手性合成提供了新方向。

本實(shí)驗(yàn)中使用的是一種來自網(wǎng)絡(luò)節(jié)桿菌(Arthrobacter sp. KNK168)菌野生型(R)-選擇性轉(zhuǎn)氨酶克隆基因,通過構(gòu)建表達(dá)質(zhì)粒PE-ATS在大腸桿菌BL21(ED3)中重組突變得到的菌株,可用于表達(dá)轉(zhuǎn)氨酶催化底物轉(zhuǎn)化西格列汀。為提高酶的表達(dá)活性,采用單因素和正交實(shí)驗(yàn)來優(yōu)化菌株培養(yǎng)基組成,并對(duì)酶的誘導(dǎo)條件進(jìn)行優(yōu)化,獲得可高效表達(dá)轉(zhuǎn)氨酶的培養(yǎng)基和誘導(dǎo)條件,為后期放大試驗(yàn)提供了參考和依據(jù)。

圖1 酶催化合成西格列汀路線

1 材料與方法

1.1 實(shí)驗(yàn)材料

1.1.1 菌種

E.coli Bl21

1.1.2 試劑

胰蛋白胨(以下統(tǒng)稱蛋白胨)和酵母浸粉(以下統(tǒng)稱酵母粉),安琪酵母公司;蔗糖,阿拉丁試劑;誘導(dǎo)劑(IPTG),賽默飛;氨芐青霉素,Borship;底物(CAS:764667-65-4)、西格列汀標(biāo)準(zhǔn)樣,Sigma;其它原料均為國(guó)藥分析純?cè)噭?/p>

1.1.3 培養(yǎng)基

LB培養(yǎng)基:蛋白胨10.0 g/L、酵母粉5.0 g/L、氯化鈉10.0 g/L,氨芐1‰。

發(fā)酵培養(yǎng)基:葡萄糖5.0 g/L、酵母粉10.0 g/L、氯化鈉2.0 g/L、磷酸氫二鉀3.0 g/L、磷酸二氫鈉1.0 g/L、氨芐1‰。

1.1.4 儀器設(shè)備

SX-700蒸汽滅菌鍋(日本TOMY);TGL-20MS離心機(jī)(湘儀);Scientz-ⅡD超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)(寧波新芝);C-MAG HS 10 digital攪拌器(IKA);HZQ-311C搖床(上海一恒);L5/UV759紫外分光光度計(jì)(上海精密);垂直型槽電泳儀(北京君意);ME104分析天平(梅特勒);高效液相色譜儀(安捷倫1260)。

1.2 實(shí)驗(yàn)方法

1.2.1 培養(yǎng)方法

工程菌保存:將菌種劃線于LB(Amp)固體培養(yǎng)基上,37 ℃恒溫箱培養(yǎng)24 h,挑取單菌落接種于LB(Amp)液體培養(yǎng)基中,培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期按1 :1比例加入30%甘油水溶液,分裝100 μL/管,放置-80 ℃保存。

菌種活化:從冰箱中取1支菌種,快速融化,按1%量接種于含LB培養(yǎng)基的試管中,加入1‰的氨芐青霉素,置于37 ℃搖床中,210 r/min培養(yǎng)12 h。

1.2.2 發(fā)酵條件

培養(yǎng)基裝液量為搖瓶體積的1/5,加入1‰氨芐青霉素,接種量2%,溫度37 ℃,搖床180 r/min,培養(yǎng)4 h,加入0.5 mmol/L IPTG誘導(dǎo)培養(yǎng)5 h。

1.2.3 菌體濃度(OD600)測(cè)定

發(fā)酵液適當(dāng)稀釋后,在分光光度計(jì)600 nm波長(zhǎng)處測(cè)定吸收值(要求每次讀數(shù)≤0.8),每個(gè)樣測(cè)量3次,取平均值作為結(jié)果,然后乘以稀釋倍數(shù)即為發(fā)酵液OD600值。

1.2.4 表達(dá)量檢測(cè)

SDS-PAGE檢測(cè)酶的表達(dá)情況:配制12%分離膠+5%濃縮膠,取1 mL發(fā)酵液離心收集菌體,加入上樣緩沖液100 μL,開水煮沸,置于冰上10 min,取上清10 μL上樣,80 V電泳過濃縮膠,換110 V至結(jié)束??捡R斯亮藍(lán)染色2 h,甲醇-醋酸混合液脫色過夜。

1.2.5 酶活性測(cè)定

將發(fā)酵液離心得到菌絲體,加入緩沖液充分混勻并用超聲波破碎,催化一定濃度的底物轉(zhuǎn)化為西格列汀,使用高效液相色譜(HPLC)檢測(cè)生成物峰面積(圖2),與標(biāo)準(zhǔn)樣品濃度峰面積對(duì)比并計(jì)算出底物單位時(shí)間轉(zhuǎn)化量,得出酶活性。以西格列汀標(biāo)準(zhǔn)樣品溶液濃度為橫坐標(biāo)(X),色譜峰面積(測(cè)3次取平均值)為縱坐標(biāo)(Y)作標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖3)。酶活定義:按照酶活性試驗(yàn)與檢測(cè)方法,1 min 催化1μmol底物轉(zhuǎn)化為西格列汀所需的酶量為一個(gè)活力單位(U)。

酶活性試驗(yàn)與檢測(cè)方法 取1 mL發(fā)酵液離心,去掉上清,加入等體積PBS,超聲破碎30 s再分別加入45% DMSO、10 g/L底物、2.0 mol/L異丙胺鹽、1 mmol/L磷酸吡哆醛(PLP),異丙胺調(diào)節(jié)pH值為8.5,反應(yīng)總體積為3 mL,在45 ℃下反應(yīng)30 min后立即取出,快速加入等量乙腈充分混勻,離心,取上清液微濾稀釋后通過HPLC檢測(cè)。條件為:安捷倫1260機(jī)型,SB-C18/ 4.6×150 mm/5μm色譜柱,流動(dòng)相為0.1%磷酸-水溶液/乙腈,檢測(cè)波長(zhǎng)267 nm,進(jìn)樣量10 μL,流速 1 mL/min。

圖2 西格列汀與底物HPLC圖

圖3 西格列汀濃度與峰面積標(biāo)準(zhǔn)曲線

1.2.6 培養(yǎng)基優(yōu)化

以發(fā)酵液OD600為指標(biāo),考察碳源、氮源和無機(jī)鹽對(duì)其影響。單因素實(shí)驗(yàn)分別選用葡萄糖、甘油、蔗糖作為碳源,濃度為3、6、9、12、15 g/L和18 g/L;蛋白胨、酵母粉、玉米作為氮源,濃度為4、8、12、16、20 g/L和24 g/L;正交實(shí)驗(yàn)選用硫酸銨、氯化鈉、磷酸氫二鉀、磷酸二氫鈉4種無機(jī)鹽確定最優(yōu)配比,條件見表1。

表1 無機(jī)鹽濃度正交實(shí)驗(yàn)因素與水平 (單位g/L)

1.2.7 發(fā)酵誘導(dǎo)條件優(yōu)化

以酶活性和表達(dá)量作為考察指標(biāo),通過單因素實(shí)驗(yàn)分別選取不同誘導(dǎo)溫度分別為28、30、32、34、36、38、40 ℃,誘導(dǎo)時(shí)間分別為 2、4、6、8、10、12h,誘導(dǎo)劑濃度分別為0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2 mmol/L。以上培養(yǎng)條件均同實(shí)驗(yàn)方法(2.2.2),每次實(shí)驗(yàn)得出最優(yōu)結(jié)果將置換下一次實(shí)驗(yàn)其他同因素。

2 結(jié)果與分析

2.1 不同碳源及其濃度選擇

碳源是組成細(xì)胞成分的碳架,為細(xì)胞生長(zhǎng)代謝提供能源,常見的碳源有甘油、葡萄糖,蔗糖、可溶性淀粉等[8]。由圖4可知:甘油從3 g/L增加到6 g/L時(shí)菌生長(zhǎng)速率最快,到9 g/L時(shí)OD達(dá)到最高,繼續(xù)增加濃度呈下降趨勢(shì);隨著葡萄糖濃度增加OD600快速增長(zhǎng),當(dāng)濃度大于9 g/L后增長(zhǎng)緩慢;蔗糖濃度對(duì)菌密度影響趨勢(shì)與葡萄糖相似,但低于葡萄糖。綜合分析,選用甘油作為培養(yǎng)基碳源,濃度為9 g/L。

圖4 不同碳源及其濃度對(duì)菌密度影響

2.2 不同氮源及其濃度選擇

氮源作為細(xì)胞蛋白質(zhì)和代謝產(chǎn)物合成的重要營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),一般可分為有機(jī)氮和無機(jī)氮兩大類,常見有機(jī)氮源有蛋白胨、酵母粉、玉米漿等,無機(jī)氮源主要有硝酸鹽和銨鹽類。實(shí)驗(yàn)室常用有機(jī)氮源,可為菌提供豐富的蛋白質(zhì)、多肽及不同的微量元素和生長(zhǎng)因子,有利于蛋白質(zhì)的合成與表達(dá)。由圖5可知,酵母粉作氮源,當(dāng)其濃度在16 g/L時(shí)增長(zhǎng)速度和OD600最高;使用蛋白胨濃度增長(zhǎng)速度變緩;玉米粉作氮源菌密度相對(duì)偏低。因此選用酵母粉作為氮源,濃度為16 g/L。

2.3 不同濃度無機(jī)鹽配比對(duì)菌生長(zhǎng)影響。

無機(jī)鹽是微生物生長(zhǎng)和代謝不可缺少的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),是構(gòu)成細(xì)胞的組織成分,具有維持酶的活性、調(diào)節(jié)滲透壓等作用[7]。正交實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,硫酸銨對(duì)菌體生長(zhǎng)影響最為顯著,氯化鈉影響作用最小。影響主次硫酸銨>磷酸氫二鈉>磷酸二氫鉀>氯化鈉;最優(yōu)配比組合A2D2C3B2,依次濃度為硫酸銨4.0 g/L、磷酸氫二鈉2.0 g/L、磷酸二氫鉀3.0 g/L、氯化鈉6.0 g/L,見表2、表3。

圖5 不同氮源及其濃度對(duì)菌密度影響

表2 無機(jī)鹽配比優(yōu)化結(jié)果與分析

表3 正交實(shí)驗(yàn)結(jié)果方差分析

2.4 不同溫度下誘導(dǎo)結(jié)果

由圖6、圖7可知,酶活性和表達(dá)量隨著誘導(dǎo)溫度的上升而增加,在36 ℃活性達(dá)到最大;繼續(xù)升溫,出現(xiàn)較多雜蛋白,酶活性也快速降低,溫度過高和過低都不利于酶的表達(dá)。因此,在36 ℃條件下誘導(dǎo)最適宜。

圖6 不同誘導(dǎo)溫度對(duì)酶活性影響

圖7 不同誘導(dǎo)溫度對(duì)酶表達(dá)量影響 (28-40℃)

2.5 不同誘導(dǎo)時(shí)間結(jié)果

由圖8、圖9得知,酶活性在誘導(dǎo)4 h后最大,隨著時(shí)間的增加,包涵體濃度增加,酶活性有所下降。因此,選擇誘導(dǎo)時(shí)長(zhǎng)為4 h。

圖8 不同誘導(dǎo)時(shí)間對(duì)酶活性影響

圖9 不同誘導(dǎo)時(shí)間對(duì)酶表達(dá)量影響

2.6 不同誘導(dǎo)劑濃度下誘導(dǎo)結(jié)果

由圖10、圖11可知,在誘導(dǎo)劑濃度為0.8 mmol/L時(shí),酶表達(dá)量最高,活性最高。濃度從0增加到0.6 mmol/L,酶活性也快速增加,濃度從0.6增加至0.8時(shí),酶活性增量不明顯,繼續(xù)增加誘導(dǎo)劑濃度對(duì)酶活性沒有明顯影響。因此從經(jīng)濟(jì)角度考慮,選擇0.6 mmol/L濃度適宜。

圖10 不同濃度誘導(dǎo)劑對(duì)酶活性影響

圖11 不同濃度誘導(dǎo)劑對(duì)酶表達(dá)量影響

3 結(jié)論

從實(shí)驗(yàn)可以看出,甘油作碳源更適合菌的生長(zhǎng),可能相對(duì)于葡萄糖不容易產(chǎn)酸、乙醇等有害代謝物;使用蛋白胨作為氮源菌生長(zhǎng)更快一些,最后隨著濃度的增加兩者OD值基本達(dá)到一致,發(fā)酵過程中多采用二者搭配使用來促進(jìn)菌體更高密度的增長(zhǎng);添加無機(jī)鹽對(duì)菌的生長(zhǎng)代謝有促進(jìn)作用,其中硫酸銨對(duì)菌密度影響最大,可能是氮元素的增加促進(jìn)了菌的生長(zhǎng);誘導(dǎo)條件作為影響酶表達(dá)和活性關(guān)鍵因素,通過SDSPAGE分析酶表達(dá)量和HPLC測(cè)定酶催化活性發(fā)現(xiàn)二者變化趨勢(shì)基本一致,說明表達(dá)量與酶活性呈一定的線性關(guān)系。實(shí)驗(yàn)最終確定培養(yǎng)基條件為葡萄糖9 g/L、蛋白胨16 g/L、硫酸銨4.0 g/L、磷酸氫二鈉2.0 g/L、磷酸二氫鉀3.0 g/L、氯化鈉6.0 g/L;最佳誘導(dǎo)條件為37 ℃下加入0.6 mmol/L誘導(dǎo)劑(IPTG)誘導(dǎo)4 h結(jié)束發(fā)酵。通過驗(yàn)證使用以上條件下培養(yǎng)最終得到的菌OD600可達(dá)到6.63,轉(zhuǎn)氨酶可溶表達(dá)量約占可溶蛋白總量的50%,轉(zhuǎn)氨酶活性可達(dá)758 U/L。

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