張舒婷 陳賽賽
(沈陽化工大學 環境與安全工程學院,沈陽 110142)
耐藥菌感染被稱為“當代最大的健康威脅之一”,特別是具有多重耐藥能力的超級細菌,如產超廣譜β-內酰胺酶的腸桿菌科細菌、耐甲氧西林金黃色葡萄球菌、耐萬古霉素腸球菌、多重耐藥銅綠假單胞菌等[1-4],2014 年世界衛生組織發布的《抗菌素耐藥:全球監測報告》顯示:每年美國和歐盟范圍內因感染超級耐藥細菌而死亡的人數分別達到 6.3 和2.5萬人。
海洋環境尤其是近岸海域容易受到耐藥菌的污染,造成耐藥菌在海洋環境的流行[5-7]。有學者從海水浴場中分離出8株具有多重耐藥性的大腸桿菌[8],這些耐藥菌對人體健康有較大威脅。國內外學者對海水浴引起的疾病風險進行系統評估的結果顯示,浴者比非浴者有更高的胃腸道感染的風險,且漲潮和雨后會增加其風險[9-10],也有數據表明海水浴場中產超廣譜β-內酰胺酶的細菌可能會引起海水浴者的尿路感染[11],因此,海水浴已成為人類感染耐藥菌的潛在途徑。國內大多數關于海水浴場耐藥菌的研究都是基于糞便污染指示菌,研究對象比較單一,且對細菌耐藥譜的研究不全面,本實驗對從海水浴場篩選到的所有MDRO進行了耐藥特征的分析,并對其進行種屬鑒定,為海水浴場耐藥細菌的污染狀況提供了更加詳細的數據。
1.1.1 主要試劑 R2A培養基與MH培養基(青島高科園海博生物技術有限公司);抗生素:氨芐西林、氯霉素、鏈霉素、四環素、卡那霉素(北京索萊寶科技有限公司);藥敏紙片(杭州微生物試劑有限公司);EasyPure Bacteria Genomic DNA Kit、2×TransTaq High Fidelity PCR SuperMix(北京全式金生物技術有限公司);引物合成及測序由美吉生物醫藥科技有限公司完成。
1.1.2 實驗主要儀器 TC型基因擴增儀-LifeECO型號(杭州博日科技有限公司);DYY-6C型電泳儀(北京六一生物科技有限公司);藍盾501S可見光凝膠投射儀(廈門致善生物科技股份有限公司);德國SIGMA 1-16/16K小型臺式離心機(德國Sigma離心機有限公司)。
1.2.1 采樣方法 于2017年8月到青島海水浴場采樣,以浴者密度最大點、距浴者密度最大點兩側各50米處及距離海岸1公里處為海水采樣點,以浴場近岸的潮上帶、潮間帶、潮下帶的表面沙層5 cm以下為沙樣采樣點。各采樣點設3個平行樣,水樣用孔徑為0.22 μm的濾膜過濾,將濾膜與沙樣收集盒冷藏于采樣箱中。
1.2.2 細菌的分離與純化 在無菌條件下將剪碎的濾膜或沙樣置于一定的生理鹽水中,經振蕩器充分震蕩,用生理鹽水將各個樣本稀釋為不同梯度濃度,分別涂布于R2A瓊脂培養基,29℃培養48 h,根據形態、顏色、表面濕潤程度、邊緣形態等差異挑取單菌落純化培養。
1.2.3 MDRO的篩選 通過抗性篩選平板進行MDRO的篩選。將分離出的細菌在含有不同抗生素的R2A瓊脂培養基上分別進行劃線培養,篩選出能同時對三種及以上抗生素耐藥的細菌。抗生素及其終濃度分別為氨芐西林(100 mg/L)、氯霉素(30 mg/L)、鏈霉素(30 mg/L)、四環素(30 mg/L)、卡那霉素(30 mg/L)。
1.2.4 藥敏試驗 采用K-B藥敏紙片擴散法對篩選到的MDRO做藥敏試驗。用生理鹽水將培養18 h的菌液稀釋至0.5麥氏比濁標準涂布于MH瓊脂培養基,并將藥敏紙片貼于培養基表面。質控菌株采用大腸埃希菌(ATCC 25922)。判讀標準參照臨床實驗室標準化協會(Clinical and Laboratory Standards Institute,CLSI)[12]推薦的標準。
1.2.5 PCR擴增模板的制備 使用EasyPure Bacteria Genomic DNA Kit試劑盒提取MDRO的基因組DNA,并用可見光凝膠透射儀觀察結果,作為PCR反應的模板。
1.2.6 16S rDNA與耐藥基因的PCR擴增 PCR反應體系為:2×TransTaq High Fidelity PCR SuperMix1為10 μL,去離子水6μL,上下游引物各1 μL,DNA模板2 μL。16S rDNA的PCR擴增采用通用引物(27F,1492R),反應程序為:95℃預變性5 min;95℃變性1min、52℃退火1min、72℃延伸10 min,此3個程序進行35個循環;72℃終延伸10 min。耐藥基因的PCR反應程序為:95℃預變性5 min;94℃變性30 s、退火30 s、72℃延伸5min,此3個程序進行30個循環;72℃終延伸5 min(退火溫度及引物見表3)。
經過對樣本細菌的分離培養,共得到271株可培養菌株,將其涂布于五種含不同抗生素的抗性篩選平板上,結果顯示271株可培養菌株對五種抗生素的耐藥率差異不大,其中對四環素耐藥率最低(16.6%),見表1。經篩選,對3種及以上抗生素耐藥的MDRO有60株,MDRO的分離率為22.1%,其中有3株MDRO來自于距離岸邊1公里處的水樣中。

表1 271株細菌對5種抗生素的耐藥率
2.2.1 總體耐藥特征 藥敏試驗結果(表2)顯示,60株MDRO對九大類15種抗生素的耐藥率在31.6%-81.7%,除氟氧沙星、環丙沙星、四環素和氟苯尼考外,60株MDRO對其他11種抗生素的耐藥率均在50%以上,其中對鏈霉素(81.7%)、磷霉素(78.3%)、甲氧芐氨嘧啶(78.3%)的耐藥率較高,對氟苯尼考耐藥率最低(31.6%)。從抗生素種類分析,60株MDRO對氨基糖苷類、磺胺類和磷霉素類抗生素耐藥率較高,對喹諾酮類、四環素類和氟苯尼考類抗生素較敏感。

表2 60株多重耐藥菌對15種藥敏紙片的敏感度
2.2.2 MDRO的多重耐藥情況 藥敏試驗結果(圖1)顯示60株MDRO中至少對4種抗生素耐藥,有5株MDRO對15種抗生素全部耐藥,其中對10種以上抗生素耐藥的有35(58.3%)株。值得注意的是編號為H2B3、H2B17、H2C27、H6C3、H6C11的MDRO對15種藥敏紙片均表現為耐藥,且均為條件致病菌。

圖1 MDRO對15種抗生素的多重耐藥性
為探究MDRO的耐藥表型與耐藥基因間的相關性,選擇鏈霉素和四環素耐藥基因進行PCR檢測,引物見表3。結果顯示,60株 MDRO中有2株顯示strA-strB陽性,31株顯示aadA1陽性,33株鏈霉素耐藥基因陽性菌株中有97%的菌株表現為耐藥表型陽性;另外,有11株顯示tetA陽性,3株顯示tetB陽性,14株四環素耐藥基因陽性的菌株全部表現為四環素耐藥表型陽性。
為進一步驗證MDRO的耐藥表型與耐藥基因間的相關性,用SPSS 19.0軟件對其進行卡方檢驗,結果顯示,鏈霉素耐藥基因陽性菌株中的耐藥表型陽性菌株顯著高于耐藥基因陰性菌株,四環素耐藥基因陽性菌株中的耐藥表型陽性菌株顯著高于耐藥基因陰性菌株,表明細菌耐藥性與耐藥基因的檢出率呈正相關(表4,表5)。
提取60株MDRO的基因組DNA作為模板,PCR法擴增其16s rDNA基因片段并通過瓊脂糖凝膠電泳觀察結果(圖2),將PCR產物送測序公司測序。通過Mothur軟件將測序所得的基因序列進行操作分類單元聚類分析,將相似性≥97%的序列歸為一個OTU,共分為33個OTU。選出每個OTU的代表序列,并通過NCBI網站進行比對,選出同源性最高的序列作為參考序列并下載。將33個代表序列及其參考序列用MEGA 5.0 軟件以鄰接法構建系統發育樹(圖3),初步確定耐藥細菌所屬菌屬。

表3 耐藥基因檢測所用引物

表4 60株MDRO鏈霉素耐藥表型與鏈霉素耐藥基因的相關性分析

表5 60株MDRO四環素耐藥表型與四環素耐藥基因的相關性分析

圖2 部分細菌樣品16S rDNA基因片段電泳圖
結合系統發育樹和比對結果進行初步鑒定,從青島海水浴場篩選出的60株MDRO屬于6個綱,24個菌屬,分別為α-變形菌綱的短波單胞菌屬(Brevundimonas)、鞘脂菌屬(Sphingobium)、鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)、玫瑰單胞菌屬(Roseomonas)、甲基營養菌屬(Methylobacterium);β-變形菌綱的戴爾福特菌屬(Delftia);γ-變形菌綱的寡養單胞菌屬(Stenotrophomonas)、不動桿菌屬(Acinetobacter);芽孢桿菌綱的葡萄球菌屬(Staphylococcus)、腸球菌屬(Enterococcus);放線菌綱的節桿菌屬(Arthrobacter)、微桿菌屬(Microbacterium)、土壤球菌屬(Agrococcus)、紅球菌屬(Rhodococcus)、微球菌屬(Micrococcus)、考克氏菌屬(Kocuria)、兩面神菌屬(Janibacter)、短狀桿菌屬(Brachybacterium)、分枝桿菌屬(Mycobacterium)、原小單孢菌屬(Promicromonospora)、鏈霉菌屬(Streptomyces)、白蟻菌屬(Isoptericola)、劉志恒菌屬(Zhihengliuella);擬桿菌綱的擬桿菌屬(Pedobacter)。其中寡養單胞菌屬(Stenotrophomonas)占比最大(16%),其次分別為微桿菌屬(Microbacterium)、短波單胞菌屬(Brevundimonas)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)分別占比13%、8%、8%,其他菌屬數量較少。值得注意的是,對15種藥敏紙片均表現為耐藥的H2B3、H2B17、H2C27菌株經初步鑒定為嗜麥芽窄食單胞菌,H6C3、H6C11菌株為缺陷短波單胞菌,均為條件致病菌。

圖3 33個OTU代表序列及其參考序列構建的系統進化樹
海水浴場受人類活動影響較大,通常含有較多耐藥的致病菌,海水浴者通過皮膚接觸或海水吞咽等方式易感染耐藥致病菌,面臨一定的健康風險[15],因此對海水浴場耐藥菌的調查研究尤為重要。本實驗對青島海水浴場中MDRO分離率為22.1%,與De Oliveira等[16]的調查結果相比,要高于其在巴西東南部休閑海域MDRO分離率(6.9%-8.33%),揭示了青島海水浴場的耐藥菌污染較為嚴重。雖然耐藥菌的存在通常與人類活動有關,但本研究中有3株MDRO來自于浴者罕至的距離岸邊1公里處的水樣中,甚至有關研究在人類活動罕至的南極地區也發現了具有多重耐藥性的細菌[17],表明細菌的耐藥性可以從海岸擴散到更遠的海域。
抗生素的不合理使用是造成耐藥菌流行的主要原因,有關研究對我國多地海水養殖場的耐藥菌進行了調查,結果顯示海水養殖區的耐藥菌對氨基糖苷類和磺胺類抗生素表現出了高耐藥率[18],對喹諾酮類、氟苯尼考類抗生素的耐藥率較低[19],與本研究結果大致吻合,側面反映出海水浴場細菌的耐藥情況或與海水養殖中抗生素的使用有較大關系。本研究分離出的MDRO顯示出了對鏈霉素的高耐藥率,Andrade等[20]對圣維森特兩個海灘水樣及沙樣中的大腸桿菌的耐藥性進行了研究,也顯示出了對鏈霉素的高耐藥率,這可能與鏈霉素臨床應用較早有關。另外,有數據顯示海水浴場細菌的耐藥性還與糞便污染程度和攜帶致病菌的浴者數量有關,人類糞便污染指數較高的海水浴場有更高的耐藥率[20-22]。
有研究表明細菌的耐藥表型與耐藥基因的檢出率相關[23],本研究對60株MDRO的鏈霉素耐藥基因和四環素耐藥基因進行了PCR檢測,結果也顯示了細菌耐藥表型和耐藥基因檢出率的正相關性。60株MDRO分屬于24個菌屬,且多為條件致病菌,其中有3株對15種抗生素均耐藥的MDRO經鑒定為嗜麥芽窄食單胞菌,該菌主要引起呼吸道感染,是重要的醫院感染菌,其分離率在非發酵菌中,僅次于銅綠假單胞菌和鮑曼氏不動桿菌[24];另外,還有2株對15種抗生素均耐藥的MDRO經鑒定為缺陷短波單胞菌,該菌雖然致病率低,但致病作用較強,已有報道表明其可引起顱內感染和腹膜炎[25-26],這些細菌的致病率取決于各種因素,例如水中的污染程度、暴露的時間及海灘游客的免疫狀況,有研究顯示,浴者暴露于海水中15分鐘即可帶入6×106CFU的金黃色葡萄球菌[27],因此海水浴場中的耐藥致病菌對浴者有較大的健康風險。建議相關部門把浴場的耐藥菌污染情況作為浴場水質監測的項目之一,另外,由于海水中的耐藥菌主要來自于人類和動物糞便、城鎮污水的排放及水產養殖業,對于靠近海濱度假勝地的沿海地區,應加強對城鎮污水處理系統及水產養殖業的監督,從源頭控制耐藥菌的擴散。
研究結果顯示,青島海水浴場的MDRO有較高的分離率(22.1%),對氨基糖苷類、磺胺類、磷霉素類抗生素耐藥性較強,并分離到有5株對15種抗生素均有耐藥性的MDRO,表明青島海水浴場的耐藥菌污染較嚴重。海水浴場的MDRO多樣性豐富,60株MDRO屬于6個綱,24個菌屬,且多為條件致病菌,其中寡養單胞菌屬占比最大(16%)。另外,研究表明MDRO對鏈霉素、四環素的耐藥表型與其耐藥基因的檢出率顯著相關。