β-內酰胺類抗奶對犢牛瘤胃菌群差異基因表達及代謝的影響

張 帥，曲永利，李 偉，辛小月，王 璐，殷術鑫

（黑龍江八一農墾大學動物科技學院，大慶 163319）

目前，抗生素已成為奶牛肺炎、乳房炎、子宮炎和其他疾病的最經濟有效的治療藥物［1-3］。但是在用藥期間以及停藥期，奶中會含有抗生素，這種含有抗生素、高體細胞數的奶統稱為抗奶，被用作犢牛的具有成本效益的飼料［4］。瘤胃中眾多微生物具有多重耐藥性和廣譜抗性［5］。Smillie 等［6］觀察到42 種常見的抗生素抗性基因（ARGs）以及43 種能夠跨地域的ARGs。世界衛生組織公布的12 種耐藥細菌中半數為β-內酰胺類抗生素［7］。因此，探討飼喂β-內酰胺類抗奶對犢牛瘤胃菌群基因功能的影響具有重要意義。目前，許多高通量測序技術已被用于反芻動物瘤胃微生物方面的研究，如Pandya 等［8］研究了3 頭成年蘇替水牛的瘤胃細菌菌群，區分出42 個可操作的分類單位；Jami 等［9］通過焦磷酸測序研究了16 頭泌乳奶牛瘤胃中的細菌種群，不同樣品在細菌分類群中顯示出51%的相似性。盡管目前對反芻動物瘤胃菌群的研究較多，但是瘤胃菌群與抗奶的關系，特別是抗奶與瘤胃菌群基因功能之間的關系尚不清楚。本試驗旨在對飼喂抗奶的犢牛進行瘤胃菌群基因功能注釋、豐度分析和差異分析，為國內外奶牛養殖場使用抗奶提供合理可靠的科學依據。

1 材料與方法

1.1 試驗動物與試驗設計

本試驗于黑龍江省大慶市某大型規模化牧場進行，按照出生日齡相近的原則，選取45 頭3 日齡左右、體重40 kg±5 kg 的健康荷斯坦犢牛，采用完全隨機試驗設計，隨機分為3 組，即巴氏消毒抗奶組（B1）、抗奶組（B2）和無抗鮮奶組（B3），每組15 頭。……