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siRNA干擾DNALI1基因對HEK-293細胞增殖與遷移的影響

2019-01-17 02:05:19崔勇劉功振
教育教學論壇 2019年50期

崔勇 劉功振

摘要:文章探討了siRNA干擾DNALI1基因對HEK-293細胞增殖、遷移的影響。通過培養HEK-293細胞株,分別轉染siRNA DNALI1組(DNALI1-homo-66組、DNALI1-homo-426組與DNALI1-homo-777組)和對照組。siRNA DNALI1組細胞中DNALI1 mRNA表達量均低于對照組,三個干擾組中DNALI1-homo-66組干擾效率最高,差異均具有統計學意義(P<0.05);與陽性對照組和陰性對照組相比,siRNA DNALI1組細胞轉染24—48h細胞增殖能力明顯減弱,差異均具有統計學意義(P<0.05)。在細胞水平可通過RNA干擾特異性抑制DNALI1基因來抑制細胞的增殖和遷移能力,為研究DNALI1基因在細胞中的作用機制奠定了基礎。

關鍵詞:DNALI1;RNAi;Real-Time PCR;增殖;侵襲

中圖分類號:G642.0? ? ?文獻標志碼:A? ? ?文章編號:1674-9324(2019)50-0061-02

RNA干擾(RNA interference,RNAi)是指內源性或外源性雙鏈RNA(double strands RNA,dsRNA)與細胞內的同源序列mRNA相結合并使之降解的現象,是一種序列特異轉錄后的基因沉默機制,其作用相當于基因敲除[1-3]。與傳統的基因敲除技術相比,RNAi以其高特異性、高效性、操作簡單等顯著優勢成為研究基因功能的全新手段,其在基因組研究、毒病性疾病治療、腫瘤治療、自身免疫性疾病治療及生物醫藥開發領域有著廣闊的應用前景。本研究通過構建針對DALI1基因的shRNA干擾表達載體,研究DNALI1基因干擾后對HEK-293細胞分裂增殖、遷移的影響。

一、實驗方法

1.細胞培養和轉染。轉染前一天,將4-5×104細胞接種在24孔板上,加入0.5ml含FBS和抗生素,等細胞達到轉染密度加入siRNA及lipofectamin2000(invitrogen)試劑柔和混勻,室溫放置5min,形成siRNA/lipofectamin2000復合物。將100μl復合物加到含有細胞培養基的24孔板上來回輕柔搖晃。在CO2培養箱中以37℃溫育24—48h后,進行轉染后的其他檢測步驟。

2.熒光定量PCR檢測。提取RNA并進行反轉錄,根據操作將提取好的RNA,根據反轉錄反應體系配制混合液,充分混勻,42℃,孵育15min;95℃,孵育3min之后放于低溫保存,然后建立Real-Time PCR反應體系,反應條件如下:預變性95℃,15min;變性95℃,10sec;退火延伸60℃,30sec,共40個循環。從GenBank上獲得DNALI1基因序列,按照shRNA設計原則,針對DNALI1基因序列保守區域各篩選設計、合成3條干擾靶序列,分別命名為DNALI1-homo-66、DNALI1-homo-426、DNALI1-homo-777,同時設計各個對照組(si-NC)、(si-FAM)及(si-GAPDH)。

3.CCK8法檢測細胞增殖實驗。取轉染完畢的細胞,在96孔板中加100μl含3×103個靶細胞懸液,在37℃5%CO2的培養箱培養1—7天,每孔加10μl CCK8染液培養2h;用酶標儀檢測450nm波長下每孔的吸光度值;以吸光度值對時間作圖,繪制細胞增殖曲線。

4.Transwell小室檢測細胞遷移試驗。選擇siRNA有效干擾靶點DNALI1的siRNA-66細胞和對照組細胞進行培養,取對數期的轉染siRNA的細胞,常規消化、離心棄上清,加無血清培養基重懸細胞,制備單細胞懸液,密度調整為5×105個細胞/ml。向每個上室中加200μl細胞懸液(含1×105個細胞),沿著下室內壁加700μl 10% FBS DMEM 700ul。細胞培養箱中孵育16h。取出Transwell小室,甲醇中固定15min,PBS洗3次,放入0.2%的結晶紫染液染色20min,PBS洗3次,顯微鏡下觀察拍照。

二、結果

1.不同組別干擾效率比較。轉染細胞24h后,siRNA DNALI1組細胞中DNALI1 mRNA表達量均低于對照組,三個干擾組中DNALI1-homo-66組干擾效率最高,差異均具有統計學意義(P<0.05);試驗結果發現DNALI1-siRNA-66在24h干擾效果最好。轉染細胞48h后,DNALI1-homo-66組仍然保持最高干擾效率,差異均具有統計學意義(P<0.05);試驗結果發現DNALI1-siRNA-66在48h干擾效果最好。

2.不同轉染組細胞侵襲能力情況比較。通過Transwell試驗研究干擾細胞后運動能力的變化,與對照組相比,RNAi DNALI1細胞株運動能力減弱。siRNA DNALI1組細胞遷移細胞數和侵襲細胞數均低于陽性對照組和陰性對照組,差異均具有統計學意義(P<0.05)(見下圖)。

三、討論

軸絲動力蛋白(Axonemal dynein light intermediate polypeptide 1,DNALI1)是纖毛或鞭毛中組成外周二聯絲側臂的蛋白質,是外周二聯絲相互滑動的動力來源。基因敲除軸絲動力蛋白能導致失去纖毛動力,引起男性不育癥和大腦側化缺陷。DNALI1基因定位在4號染色體,包括6個外顯子,其在睪丸組織內大量高效表達,集中在精子細胞和精母細胞,而在其他組織中低水平表達。作為一個軸絲動力蛋白,DNALI1主要定位在氣管纖毛部位和精子,鞭毛部位提供相互滑動的動力來源[4]。

本研究通過培養HEK-293細胞株,分別轉染siRNA DNALI1組和對照組,實時熒光定量PCR技術檢測各轉染組細胞中DNALI1的基因表達,siRNA DNALI1組細胞中DNALI1 mRNA表達量均低于對照組,三個干擾組中DNALI1-homo-66組干擾效率最高,差異均具有統計學意義(P<0.05),而且siRNA DNALI1組在細胞轉染24—48h細胞增殖能力明顯減弱,差異均具有統計學意義(P<0.05);Transwell小室檢測細胞遷移能力,結果發現siRNA DNALI1組遷移細胞數均低于對照組,差異均具有統計學意義(P<0.05)。因此,在細胞水平可以通過RNA干擾特異性抑制DNALI1基因來抑制細胞的增殖和侵襲力,為研究DNALI1基因在細胞增殖和遷移的作用機制奠定基礎。

參考文獻:

[1]SINHA SK.RNAi induced gene silencing in crop improvement[J].Physiol Mol Biol Plants,2010,16(4):321-332.

[2]ELBASHIR SM,HARBORTH J,LENDECKEL W,et al.Duplexes of 21-nucleotide RNAs mediate RNA interference in cultured mammalian cells[J].Nature,2001,411(6836):494-498.

[3]IBA?觡EZ-TALLON I,GOROKHOVA S,et al.Loss of function of axonemal dynein Mdnah5 causes primary ciliary dyskinesia and hydrocephalus[J].Hum Mol Genet,2002,(11):715-721.

[4]RASHID S,BRECKLE R,HUPE M,et al.The murine Dnali1 gene encodes a flagellar protein that interacts with the cytoplasmic dynein heavy chain 1[J].Mol Reprod Dev,2006,(73):784-794.

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