日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨肌肉品質和腸道微生物的影響

2019-01-16 03:45:34李雙全唐義梅鄭文涌牛耀嶸呂常旭侯奇良晏向華馬立保

飼料博覽 2018年12期

石敏，李雙全，唐義梅，鄭文涌，牛耀嶸，呂常旭，侯奇良，晏向華，馬立保*

（1.華中農業大學動物科技學院，武漢 430070；2.湖北綠科樂華生物科技有限公司，湖北黃岡 438000）

棉粕和菜籽粕等非常規蛋白質飼料因含有較多的游離棉酚、植酸、單寧及粗纖維等抗營養因子，不能被動物較好地消化、吸收和利用。微生物生物發酵是提高利用效率的有效手段之一，釀酒酵母常用于發酵非常規原料，以提高非常規原料的使用量和飼喂價值。釀酒酵母發酵在提高非常規原料利用價值的同時，還能產生大量的代謝產物（營養代謝物、酶類和未知營養因子等），而且酵母細胞富含氨基酸、維生素、礦物質和甘露寡糖等成分，能為微生物提供豐富的營養物質，改善腸道菌群組成，進而提高動物的生產性能和改善肌肉品質[1]。Gao等研究發現，日糧中添加釀酒酵母培養物2.5 g·kg-1可增加1～42日齡肉雞的平均日增重，降低料重比[2]。路則慶等研究發現，大麥-高粱型日糧中添加釀酒酵母培養物0.8%能增加豬肉肌苷酸的含量，提升豬肉鮮味[3]。Price等研究報道，日糧中添加釀酒酵母培養物0.2%可增加沙門氏菌感染的斷奶仔豬胃腸道中乳酸菌和擬桿菌的數量，改善微生物區系[4]。

本試驗使用的新型釀酒酵母培養物是基于菜籽粕等雜粕在菌酶協同作用下，經固液結合深度發酵、低溫干燥制成，富含還原型谷胱甘肽、原花青素、有機酸和酵母細胞壁多糖等多種活性物質。然而，雜粕的發酵效率較低，發酵后單位重量產生的可供腸道微生物吸收利用的代謝物的含量低于類似于“益康XP”等釀酒酵母培養物，因此，為達到與“益康XP”相同的應用效果，日糧中新型釀酒酵母培養物的添加量要提高，而且適度高劑量的添加也為利用非常規原料提供了可能性。使用發酵后的菜籽粕替代基礎日糧中部分豆粕作為動物的蛋白質來源，可以降低配方成本，減少資源的浪費。本試驗探究日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨肌肉品質和腸道微生物的影響，為其在櫻桃谷鴨日糧中地進一步推廣和應用提供理論依據。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

新型釀酒酵母培養物底物（培養基）和新型釀酒酵母培養物由湖北綠科樂華生物科技有限公司提供。新型釀酒酵母培養物底物養分含量為：粗蛋白質51.4%、粗脂肪1.8%、粗纖維8.4%、粗灰分8.6%；新型釀酒酵母培養物養分含量為：粗蛋白質53.1%、粗脂肪1.7%、粗纖維10.1%、粗灰分8.4%、還原型谷胱甘肽的含量為0.30%，原花青素的含量為0.15%。

1.2 試驗動物及試驗設計

選取健康且體重相近的1日齡櫻桃谷鴨396只，隨機分為3組，每組6個重復，每個重復22只，試驗期42 d。參考美國NRC（1994）櫻桃谷鴨的營養需要量，分別設計1～21日齡和22～42日齡櫻桃谷鴨的日糧配方，基礎日糧組成及營養水平見表1。Ⅰ組為對照組，飼喂玉米-豆粕型基礎日糧，Ⅱ、Ⅲ組分別在基礎日糧中添加新型釀酒酵母培養物底物2.5%和新型釀酒酵母培養物2.5%。

表1 基礎日糧組成及營養水平 %DM

1.3 飼養管理

飼養試驗開始前，鴨舍、水槽和料槽進行充分清洗并且嚴格消毒。櫻桃谷鴨為舍內平養，自由采食和飲水，常規免疫，保證通風良好，溫度適宜。舍內地面平鋪墊料，雛鴨首次墊料厚度6～8 cm，以后逐漸遞減。每天清理鴨舍，更換潮濕墊料，定期消毒。

1.4 檢測指標及方法

1.4.1 肌肉品質指標

試驗至第42天，每組每個重復隨機取1只接近平均體重的櫻桃谷鴨，頸部放血屠宰，立即解剖，分割胸肉和腿肉，自封袋分裝，4℃保存備用。

常規營養成分：水分檢測參照GB 5009.3-2016《食品安全國家標準食品中水分的測定》。粗蛋白質檢測參照GB/T 9695.11-2008《肉與肉制品氮含量測定》。肌內脂肪檢測采用三氯甲烷-甲醇法。取5.0 g鴨胸肉和鴨腿肉，攪碎后放入勻漿管，加入30 mL三氯甲烷-甲醇溶液（體積比2∶1，下同），低速勻漿后轉入三角瓶，再加入50 mL三氯甲烷-甲醇溶液，靜置1 h，過濾，加入0.2倍體積的生理鹽水，3 000 r·min-1離心15 min，取下層液體，倒入50 mL燒杯中，沸水浴蒸干，經烘箱干燥后稱重。燒杯蒸前重為m1，蒸后重為m2，肉重為m3，則肌內脂肪含量=（m2-m1）/m3×100%。

pH：屠宰后分別于宰后45 min和24 h檢測肌肉的pH。將DELTA320型pH計的探針插入肌肉中，測定3個不同位置，取平均值。

滴水損失率：屠宰后取約10 g的肉樣，天平稱重得n1，將肉樣放入滴水損失管內，置于試管架上，放入4℃冰箱，48 h后取出稱重得n2，滴水損失率=（n1-n2）/n1×100%。

肉色：將肌肉切成厚度約為0.5 cm，半徑約為2 cm的肉塊，用miniscan-EZ型肉質測色儀檢測肌肉的亮度、紅度和黃度。每個樣品測3次，取平均值為最終結果。

1.4.2 腸道微生物

試驗至第42天，每組每個重復隨機取1只接近平均體重的櫻桃谷鴨，頸部放血屠宰，立即解剖，無菌操作，快速收集盲腸內容物于滅菌的凍存管中，液氮速凍，-80℃保存。

基因組總DNA提取和PCR擴增：Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ組分別選取6、4和6個櫻桃谷鴨的盲腸內容物樣品參考文獻進行盲腸內容物基因組總DNA提取，DS-11型超微量分光光度計和瓊脂糖凝膠電泳（1%）檢測DNA的濃度和純度，-80℃保存[5]。對微生物基因組16S rDNA V3-V4區進行PCR擴增，引物序列為341F：ACTCCTACGGGAGGCAG和806R:GGACTACHVGGGTWTCTAAT。PCR擴增，Illumina Miseq測序和生物信息分析均由深圳華大基因科技服務有限公司協助完成。

生物信息分析：下機后先對數據進行處理，去除低質量、含有接頭和帶有N的序列，將reads拼接成tags，在97%相似度下通過USEARCH（V7.0.1090）軟件將tags聚類，得到分類操作單元（OTUs）[6]。通過RDPclassifer（V2.2）將OTUs代表序列與數據庫進行比對，置信度閾值為0.6，細菌數據庫為Greengene[7]?；跇悠稯TUs的數目通過R軟件（V3.1.1）繪制OTUs韋恩圖，通過與數據庫比對，對OTUs進行菌種注釋繪制profiling柱狀圖?；跇悠稟lpha多樣性指數，通過R軟件繪制相應的稀釋曲線圖和箱形圖。Beta多樣性通過QIIME軟件（V1.80）分析。樣品組間差異的顯著性通過Metastats分析。

1.5 統計分析

試驗數據采用SPSS 20.0軟件One Way ANOVA進行統計分析，并進行Duncan's多重比較，結果以“平均值±標準誤”表示。

2 結果與分析

2.1 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨肌肉品質的影響

2.1.1 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨肌肉常規營養成分的影響

日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨肌肉常規營養成分的影響見表2。

由表2可知，各組櫻桃谷鴨水分和粗蛋白質的含量均差異不顯著（P＞0.05）。Ⅲ組櫻桃谷鴨胸肌肌內脂肪的含量極顯著高于Ⅰ和Ⅱ組（P＜0.01），但腿肌肌內脂肪的含量組間差異不顯著（P＞0.05）。

2.1.2 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨常規肉品質指標的影響

日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨常規肉品質指標的影響見表3。

由表3可知，各組櫻桃谷鴨胸肌pH45min、pH24h、滴水損失率和肉色均差異不顯著（P＞0.05）。Ⅲ組櫻桃谷鴨腿肌pH45min和pH24h均顯著高于Ⅰ、Ⅱ組（P＜0.05），滴水損失率較Ⅱ組有降低的趨勢（P=0.06）。各組櫻桃谷鴨腿肌肉色均差異不顯著（P＞0.05）。

表2 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨肌肉常規營養成分的影響 %

表3 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨常規肉品質指標的影響

2.2 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物的影響

2.2.1 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物測序數據的影響

對16只櫻桃谷鴨的盲腸內容物樣品進行測序分析，共得到297792條有效序列。日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物測序數據的影響見圖1。

由圖1可知，隨著測序序列數目的增加，Chao指數已趨于平坦，達到平臺期，表明測序已基本覆蓋櫻桃谷鴨腸道微生物的所有物種。

2.2.2 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物OTUs數目的影響

日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物OTUs數目的影響見圖2。

由圖2可知，97%相似度下進行聚類，所有的序列共聚類成459個OTUs，其中，Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ組櫻桃谷鴨腸道微生物的核心OTUs為336個。

2.2.3 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物Alpha多樣性的影響

Alpha多樣性包括Chao指數、ACE指數、Shannon指數和Simpson指數等。Chao指數和ACE指數反映群落的豐富度，Shannon指數和Simpson指數反映群落的多樣性。日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物Alpha多樣性的影響見圖3。

圖1 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物測序數據的影響

圖2 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物OTUs數目的影響

圖3 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物Alpha多樣性的影響

由圖3可知，Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ組櫻桃谷鴨腸道微生物的Alpha多樣性組間無顯著差異（P＞0.05），但Ⅱ組櫻桃谷鴨腸道微生物的Chao指數（P=0.099）和ACE指數（P=0.050）較Ⅰ組均有降低的趨勢。

2.2.4 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物Beta多樣性的影響

Beta多樣性用于區分樣品組間物種多樣性的差異，weighted UniFrac是考慮序列豐度和進化距離的一種衡量Beta多樣性的重要指標。日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物Beta多樣性的影響見圖4。

圖4 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物Beta多樣性的影響

由圖4可知，細菌主成分1（Principal compoent 1，PC1）、PC2和PC3的貢獻率分別為38%、21%和13%。由圖4可知，Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ組櫻桃谷鴨的腸道微生物區系能夠比較明顯地區分開。

2.2.5 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物群落組成的影響

日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物群落組成的影響見圖5～7、表4。由圖5可知，Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ組櫻桃谷鴨腸道細菌的優勢菌門均為擬桿菌門、厚壁菌門、變形菌門和梭桿菌門。通過Metastats分析比較不同處理間櫻桃谷鴨門水平上腸道微生物相對豐度的差異，由圖6可知，Ⅱ組和Ⅲ組櫻桃谷鴨腸道細菌中擬桿菌門的相對豐度極顯著高于Ⅰ組（P＜0.01），Ⅲ組櫻桃谷鴨腸道細菌中放線菌門的相對豐度顯著高于Ⅰ組（P＜0.05），Ⅱ組櫻桃谷鴨腸道細菌中變形菌門的相對豐度極顯著低于Ⅰ組（P＜0.01），但Ⅲ組櫻桃谷鴨腸道細菌中變形菌門的相對豐度與Ⅰ組無顯著差異（P＞0.05）。

圖5 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物門水平相對豐度的影響

圖6 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道差異菌門水平相對豐度的影響

櫻桃谷鴨屬水平上腸道微生物的相對豐度：由圖7可知，通過與數據庫比對，Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ組櫻桃谷鴨的腸道細菌共注釋到64個菌屬，并且優勢菌屬均為擬桿菌屬和梭桿菌屬。表4結果顯示，與Ⅰ組相比，Ⅲ組櫻桃谷鴨腸道細菌中擬桿菌屬的相對豐度顯著增加（P＜0.05），Erysipelatoclostridium的相對豐度顯著減少（P＜0.05）；與Ⅱ組相比，Ⅲ組櫻桃谷鴨腸道細菌中Oxalobacter的相對豐度極顯著增加（P＜0.01），Parabacteroides和Oscillibacter的相對豐度極顯著減少（P＜0.01），脫硫弧菌屬、Hydrogenoanaerobacterium、Butyricimonas、嗜膽菌屬和梭菌屬的相對豐度顯著增加（P＜0.05）。

圖7 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物屬水平相對豐度的影響

表4 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道差異菌屬水平相對豐度的影響 %

2.2.6 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物基因功能的影響

日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物基因功能的影響見圖8。

由圖8可知，Ⅱ組櫻桃谷鴨腸道細菌脂質代謝基因功能的相對豐度顯著高于Ⅰ、Ⅲ組（P＜0.05），細胞運動基因功能的相對豐度極顯著低于Ⅰ組（P＜0.01），但與Ⅲ組差異不顯著（P＞0.05）；Ⅲ組櫻桃谷鴨腸道細菌核苷酸代謝基因功能的相對豐度極顯著高于Ⅰ組（P＜0.01），氨基酸代謝基因功能的相對豐度顯著高于Ⅰ組（P＜0.05），能量代謝基因功能的相對豐度較Ⅰ組有增加的趨勢（P=0.073），而細胞運動基因功能的相對豐度較Ⅰ組有減少的趨勢（P=0.085）。

圖8 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物基因功能的影響

3 討論

3.1 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨肌肉品質的影響

肌肉品質能體現肉用畜禽的經濟價值。肌肉中水分含量越高，保水性越強，肌肉的嫩度和多汁性等性狀越好[8]。蛋白質是肌肉中的主要養分，含量越高，肉品質越好。肌內脂肪是評定肉品質的關鍵因素之一，與肌肉的嫩度、多汁性和風味有著密切的聯系[9]。于素紅等研究報道，日糧中添加酵母培養物5.0和7.5 g·kg-1，肉雞胸肌和腿肌粗蛋白質的含量無顯著差異[9]。路則慶等研究報道，大麥-高粱型日糧中添加酵母培養物0.8%對肥育豬背最長肌水分和肌內脂肪的含量無影響[3]。本試驗日糧中添加新型釀酒酵母培養物底物2.5%和新型釀酒酵母培養物2.5%對櫻桃谷鴨胸肌和腿肌的水分和粗蛋白質的含量均無影響，而新型釀酒酵母培養物2.5%組櫻桃谷鴨胸肌肌內脂肪的含量高于對照組和新型釀酒酵母培養物底物2.5%組。

新型釀酒酵母培養物中還原型谷胱甘肽的含量較高，由于含有半胱氨酸殘基，還原型谷胱甘肽易與自由基結合，轉化成氧化型谷胱甘肽，提高機體的抗氧化能力[10]。此外，代謝組數據顯示，新型釀酒酵母培養物中原花青素的含量高于新型釀酒酵母培養物底物組，原花青素由于含有多個酚性羥基，可以競爭性地與自由基結合，抑制脂質氧化反應，從而保護機體免受氧化損傷[11]。新型釀酒酵母培養物2.5%組櫻桃谷鴨胸肌肌內脂肪的含量高于對照組和新型釀酒酵母培養物底物2.5%組，原因可能是新型釀酒酵母培養物中還原型谷胱甘肽和原花青素的含量較高，能減少機體的氧化應激，抑制肌內脂肪的氧化，從而改善肌肉品質。

pH、滴水損失率和肉色是反映肉品質的重要指標。pH反映動物屠宰后肌糖原的降解速度。一定范圍內，pH升高，肌肉系水力增強，嫩度越好[12]。滴水損失率是在外力（如加壓、冷凍和儲藏等）條件下，肌肉維持固有水分的能力[9]。肉色可通過亮度、紅度和黃度進行鑒定，一般紅度越大，亮度和黃度越小，肉品質越好。于素紅等研究報道，日糧中添加酵母培養物5 g·kg-1可顯著降低肉雞胸肌和腿肌的滴水損失率，但對胸肌pH45min和pH24h無顯著影響[9]。試驗日糧中添加新型釀酒酵母培養物底物2.5%和新型釀酒酵母培養物2.5%對櫻桃谷鴨胸肌pH45min、pH24h、滴水損失率和肉色均無影響，但2.5%新型釀酒酵母培養物組櫻桃谷鴨腿肌pH45min和pH24h高于對照組和新型釀酒酵母培養物2.5%底物組，并且新型釀酒酵母培養物2.5%組櫻桃谷鴨腿肌的滴水損失率較新型釀酒酵母培養物底物2.5%組有降低的趨勢。新型釀酒酵母培養物中還原型谷胱甘肽的含量較高，抗氧化能力增強，進而提高細胞膜的屏障功能，減少水分外流，降低肌肉的滴水損失率，增強系水力[10]?？寡趸芰υ鰪娺€會減少機體的氧化應激，從而減少促腎上腺皮質激素的含量，抑制糖酵解過程中各催化酶的活性，減少乳酸的產生，因此提高腿肌pH[13]。有研究表明，PPAR-δ是過氧化物酶體增殖物激活受體γ輔助活化因子1α（PGC-1α）的上游調控因子，能與其他的轉錄因子共同作用促進PGC-1α的表達，而PGC-1α可誘導Ⅰ型肌纖維特異基因的表達，增加Ⅰ型肌纖維的數量，抑制pH的下降，從而改善肌肉品質[14]。

3.2 日糧中添加新型釀酒酵母培養物對櫻桃谷鴨腸道微生物的影響

Illumina MiSeq測序能夠比較準確全面地分析腸道微生物的多樣性，在微生物研究中應用越來越廣泛[15]。本試驗日糧中添加新型釀酒酵母培養物2.5%對櫻桃谷鴨腸道細菌的Alpha多樣性無影響，可能與新型釀酒酵母培養物的發酵菌株和發酵時間有關。Si等研究發現，日糧中添加酵母細胞壁Biolex MB40 0.2%，裸頸雞腸道細菌的Alpha多樣性無變化，而添加0.2%酵母細胞壁Leiber ExCel，裸頸雞腸道細菌的Alpha多樣性下降[16]。孫喆等研究發現，隨著日糧中添加的酵母培養物發酵時間的延長，肉雞腸道細菌的Alpha多樣性呈現先降低后升高的趨勢[17]。

Vasa?等通過16S rRNA焦磷酸測序檢測綠頭鴨和番鴨的盲腸微生物區系發現綠頭鴨和番鴨在門水平上主要由厚壁菌門、擬桿菌門、放線菌門和變形菌門組成[18]。本試驗對照組、新型釀酒酵母培養物底物2.5%組和新型釀酒酵母培養物2.5%組櫻桃谷鴨腸道細菌的優勢菌門為厚壁菌門、擬桿菌門、變形菌門和梭桿菌門，說明相同種屬間腸道菌群組成存在一定的相似性。新型釀酒酵母培養物底物2.5%組和新型釀酒酵母培養物2.5%組櫻桃谷鴨腸道細菌中擬桿菌門的相對豐度高于對照組，可能與釀酒酵母培養物底物和釀酒酵母培養物中粗纖維的含量較高有關。擬桿菌門是動物體內酵解碳水化合物的主要菌門，擬桿菌門的相對豐度增加，降解纖維素的能力可能增強，能為微生物提供更多的營養物質以促進其生長[19]。Upadrasta等研究發現，日糧中添加蘋果酒酵母可增加斷奶仔豬糞便中擬桿菌門的相對豐度，此結論與本文一致[20]。放線菌門的主要功能是產生抗生素，鏈霉素、紅霉素和卡那霉素等均由放線菌門中的鏈霉菌產生。此外，具有營養、抑菌、免疫調節和抗癌等生理功能的雙歧桿菌也隸屬于放線菌門[21]。變形菌門在動物腸道中含量較豐富，且形態多樣，但變形菌門中許多細菌如沙門氏菌、霍亂弧菌和幽門螺桿菌等均被證實是致病菌。變形菌門相對豐度的增加不僅會打亂微生物群落結構的平衡，還可能使機體患病的機率大幅提高[22]。新型釀酒酵母培養物底物2.5%組櫻桃谷鴨腸道細菌中變形菌門的相對豐度極顯著低于對照組，而新型釀酒酵母培養物2.5%組與對照組無顯著差異。說明日糧中添加新型釀酒酵母培養物底物2.5%和新型釀酒酵母培養物2.5%通過增加擬桿菌門和放線菌門等有益菌的相對豐度抑制或穩定了變形菌門中病原菌相對豐度的增加，維持櫻桃谷鴨腸道的健康。

在屬水平上，2.5%新型釀酒酵母培養物組櫻桃谷鴨腸道細菌中擬桿菌屬的相對豐度高于對照組，Erysipelatoclostridium的相對豐度低于對照組。擬桿菌屬的脆弱擬桿菌能激活Toll樣受體，通過分泌一種微生物多糖A可抵制Helicobacter hepaticus誘導的結腸炎，增強機體免疫力[23-24]。Erysipelatoclostridium是一種條件性致病菌，日糧中添加新型釀酒酵母培養物2.5%可降低Erysipelatoclostridium的相對豐度，減小櫻桃谷鴨患病的可能性[25]。日糧中添加新型釀酒酵母培養物能改善櫻桃谷鴨的腸道菌群結構可能與新型釀酒酵母培養物細胞壁組成甘露寡糖和β-葡聚糖有關。

甘露寡糖可吸附在腸道表面，為病原菌提供特定的結合位點，競爭性地抑制病原菌在腸道表面的定植[26]。Mourao等研究發現，日糧中添加甘露寡糖可顯著降低育肥兔盲腸大腸桿菌和腸球菌的數量，改善腸道微生物區系[27]。Wang等研究發現，β-葡聚糖能極顯著增加人體糞便中擬桿菌屬的相對豐度，并且普氏菌屬的相對豐度有增加的趨勢[28]。

此外，腸道菌群結構發生改變還可能與新型釀酒酵母培養物富含有機酸有關，腸道中的有益菌能在酸性環境（5.8～6.2）中較好地生存，而致病菌大多存在于pH≥7的中性或偏堿性環境中[29]。Ozduven等研究發現，日糧中添加有機酸可顯著增加肉雞盲腸乳酸菌的含量，降低大腸桿菌的含量，調節腸道菌群組成[30]。

PICRUSt分析彌補了16S rDNA測序只能檢測微生物的組成，無法預知微生物功能的缺陷，目前已成為一種預測細菌和古細菌代謝功能的重要工具。本試驗PICRUSt分析結果顯示，新型釀酒酵母培養物2.5%組櫻桃谷鴨腸道細菌核苷酸代謝基因功能高于對照組，氨基酸代謝基因功能高于對照組，能量代謝和細胞運動基因功能組間差異不明顯。但新型釀酒酵母培養物2.5%組櫻桃谷鴨腸道細菌能量代謝基因功能較對照組有增加的趨勢，而細胞運動基因功能較對照組有減少的趨勢。Fang等研究發現，細菌能量代謝、氨基酸代謝、核苷酸代謝和碳水化合物代謝等基因功能的相對豐度與肌內脂肪的含量呈正相關，而細胞運動和膜轉運等基因功能的相對豐度與肌內脂肪的含量呈負相關[31]。因此，日糧中添加新型釀酒酵母培養物2.5%能增加櫻桃谷鴨胸肌肌內脂肪的含量，可能與該組櫻桃谷鴨腸道細菌核苷酸代謝、氨基酸代謝和能量代謝基因功能增強，細胞運動基因功能減弱有關。