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豬SLA基因多態(tài)性研究進(jìn)展

2019-01-09 23:07:42韋思婷程一飛舒星富梁麗彬劉麗霞
豬業(yè)科學(xué) 2019年4期
關(guān)鍵詞:功能研究

韋思婷,程一飛,舒星富,韋 體,梁麗彬,劉麗霞

(西北民族大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院,甘肅 蘭州 730030)

動(dòng)物識(shí)別自己、排除非己以維持機(jī)體正常生理活動(dòng)和抗疾病的能力是免疫系統(tǒng)的核心職能,這種能力在很大程度上由主要組織相容性復(fù)合體(Major histocompatibility complex,MHC)基因所決定[1]。MHC基因系統(tǒng)是個(gè)高度多態(tài)的系統(tǒng),它的高度多態(tài)性使它成為很好的遺傳標(biāo)記,且有可能作為分子標(biāo)記進(jìn)行輔助選擇。

1 豬SLA基因結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能

豬的MHC也叫豬的白細(xì)胞抗原(SLA)。Viza等[2]在 1970年首次發(fā)現(xiàn)豬的MHC不僅在抗原遞呈、機(jī)體器官移植、免疫應(yīng)答和調(diào)控方面有著很重要的作用,而且還與其他的生物學(xué)功能如抗病力、生長(zhǎng)、繁殖等有關(guān)。SLA基因主要位于豬7號(hào)染色體著絲粒的兩端,其基本結(jié)構(gòu)與功能上存在差別,一般可分為三大類(lèi):Ⅰ類(lèi)基因、Ⅱ類(lèi)基因和Ⅲ類(lèi)基因[3]。SLAⅠ類(lèi)基因有三個(gè)位點(diǎn):A、B、C。SLAⅠ類(lèi)基因主要編碼的是細(xì)胞表面高度多態(tài)的糖蛋白,負(fù)責(zé)將內(nèi)源性抗原肽遞呈給T細(xì)胞,引發(fā)特異的免疫反應(yīng)。SLAⅡ類(lèi)基因主要有DRA、DRB、DQA、DQB、DOB、Dpa、TAP、LMP等,其中遺傳多態(tài)性最豐富的區(qū)域是DR和DQ亞區(qū),它們的遺傳多態(tài)性使它們?cè)诳刂茩C(jī)體的免疫應(yīng)答與調(diào)節(jié)中起著重要的作用,與豬的抗病能力息息相關(guān)[4]。SLAⅡ類(lèi)抗原的基因主要有兩種,α鏈基因和β鏈基因,它們分別編碼SLAⅡ類(lèi)抗原的α肽鏈和β肽鏈。研究表明,SLAⅡ類(lèi)基因至少存在3個(gè)α鏈基因和5~8個(gè)β鏈基因[5]。目前對(duì)于SLAⅢ類(lèi)基因的研究比較少,SLAⅢ類(lèi)基因主要位于豬7號(hào)染色體靠近著絲粒區(qū)域。

2 豬SLAⅠ基因多態(tài)性研究

SLAⅠ類(lèi)分子多態(tài)性位點(diǎn)主要是集中在α1、α2區(qū),它和HLAⅠ類(lèi)分子多態(tài)性位點(diǎn)幾乎完全重疊,在HLAⅠ類(lèi)分子中這些多態(tài)性位點(diǎn)參與抗原肽遞呈或與T細(xì)胞受體結(jié)合。近年來(lái),對(duì)于動(dòng)物MHC的研究中,發(fā)現(xiàn)Ⅰ類(lèi)區(qū)域的進(jìn)化史似乎要比Ⅱ類(lèi)和Ⅲ類(lèi)區(qū)域復(fù)雜得多,Ⅰ類(lèi)基因數(shù)目在不同的物種中變化較大。SLAⅠ類(lèi)基因表現(xiàn)出高度多態(tài)性,Jung等[6](1989)用限制性?xún)?nèi)切酶(PvuⅡ、BamHⅠ、EcoRⅠ)將杜洛克和漢普夏豬基因組 DNA消化后,利用SLAⅠ類(lèi)基因探針通過(guò)Southern 印跡和分子雜交,結(jié)果發(fā)現(xiàn),SLAⅠ類(lèi)基因具有較高多態(tài)性。在SLAⅠ類(lèi)基因中也有新的等位基因被不斷的發(fā)現(xiàn),陳福祥等[7](2003)初步分析巴馬豬、貴州香豬、云南版納豬 SLA-1、SLA-2 cDNA序列,結(jié)果表明,各品種在每個(gè)基因位點(diǎn)發(fā)現(xiàn)一個(gè)新的等位基因。Ando 等[8](2003)通過(guò)RT-PCR對(duì)4個(gè)品種豬進(jìn)行研究,結(jié)果在這4個(gè)品種豬中發(fā)現(xiàn)了2個(gè)新的SLA-1等位基因、6個(gè)新的SLA-2等位基因和4個(gè)新的SLA-3等位基因。吳群等[9](2004)在近交系五指山豬發(fā)現(xiàn)P1和P14兩個(gè)等位基因。Tanaka等[10](2008)發(fā)現(xiàn)在不同的單倍型SLA中,SLAⅠ類(lèi)分子基因中存在著不同的基因位點(diǎn)。在對(duì)SLAⅠ類(lèi)基因的功能研究中,高鳳山等[11](2007)通過(guò)基因克隆的方法研究我國(guó)巴馬小型豬SLA-Ⅰ類(lèi)基因的分子特征,研究結(jié)果表明,SLA-2*bm是一個(gè)新的等位基因,而且SLA-2*bm還保留了人 HLA-A2 基因的部分功能位點(diǎn);白婧等[12](2011)通過(guò)RTPCR,研究了托佩克豬 SLA-2 基因的功能,結(jié)果發(fā)現(xiàn)SLA-2-TPK也保留了人HLA-A2 基因的部分功能位點(diǎn)。喬翠等[13](2012)在對(duì)荷包豬SLA-3 基因特征的研究中發(fā)現(xiàn)了一類(lèi)缺失型的SLA-3等位基因,該等位基因仍然保留了典型的SLA-3基因的基本特征、功能區(qū)結(jié)構(gòu)。茍東洲等[14](2015)構(gòu)建了中國(guó)地方品系荷包豬和萊蕪黑豬SLA-3原核表達(dá)載體,同時(shí)獲得了表達(dá)蛋白,為進(jìn)一步研究SLA-3結(jié)構(gòu)和功能奠定了一定的基礎(chǔ)。

3 豬SLAⅡ基因多態(tài)性研究

近年來(lái)SLAⅡ類(lèi)基因是國(guó)內(nèi)外研究的熱點(diǎn),它主要包含α鏈和β鏈,α鏈上主要是的 DRA和DQA基因,β鏈上主要是DRB和DQB基因。SLA的研究地位自發(fā)現(xiàn)SLA就僅次于鼠和人類(lèi)的MHC研究[15],特別是 SLAⅡ類(lèi)基因的研究。過(guò)去常用血清學(xué)與細(xì)胞學(xué)分型方法對(duì)SLAⅡ類(lèi)抗原進(jìn)行分型研究,但是由于開(kāi)發(fā)有用的血清型還是存在著很大的困難,因此該方法并未得到較好的發(fā)展[16]。在SLAⅡ類(lèi)β鏈基因中研究得較早的是DRB和DQB這兩個(gè)基因。關(guān)于SLA-DRB基因多態(tài)性的研究,Vage DI等和Brunsberg U等用PCR法對(duì)SLADRB 基因進(jìn)行了擴(kuò)增[17-18],結(jié)果表明,至少存在3個(gè)DRB基因,但只有一個(gè)可以表達(dá),另外值得注意的是,兩個(gè)DRB假基因也呈現(xiàn)出了相當(dāng)可觀的等位基因多態(tài)性;奚衍洋等[19](2018)對(duì)長(zhǎng)白豬SLAⅡ-DRB1 第二外顯子進(jìn)行了多態(tài)性研究,研究的結(jié)果表明,DRB1基因具有較高的多態(tài)性。在對(duì)SLA-DQB基因多態(tài)性進(jìn)行研究中也發(fā)現(xiàn)DBQ基因具有高度的多態(tài)性,陳福祥等[20](2004)采用RT-PCR方法,發(fā)現(xiàn)了三個(gè)豬DQB新等位基因,同時(shí)發(fā)現(xiàn)中國(guó)豬種DQB基因及其推導(dǎo)的氨基酸與人相應(yīng)基因的同源性明顯高于小鼠;吳圣龍等[21](2007)對(duì)3個(gè)江西省地方豬種SLA-DQB基因外顯子2的多態(tài)性進(jìn)行研究,研究表明3個(gè)豬種SLA- DQB基因外顯子2多態(tài)性非常豐富。

在SLAⅡ類(lèi)α鏈基因中主要研究的是DRA和DQA。對(duì)于SLADRA 基因,M.T.Le等[22](2012)從野豬DRA基因中鑒定出兩個(gè)新的等位基因,并確定了34種SLAⅡ類(lèi)單倍型;SLA-DRA也有表現(xiàn)出較低的多態(tài)性,金麗等[23](2016)通過(guò)PCR-SSCP 和克隆測(cè)序的方法對(duì)八眉豬 SLA -DRA 基因的第2外顯子進(jìn)行多態(tài)性分析,結(jié)果表明,八眉豬SLA -DRA 基因的第2外顯子表現(xiàn)出較低的多態(tài)性。

4 展望

隨著豬SLA結(jié)構(gòu)與功能不斷地被人們發(fā)現(xiàn)與研究,SLA基因在免疫學(xué)方面也在不斷的發(fā)展,在進(jìn)一步對(duì)豬SLA的研究當(dāng)中,將揭示更多關(guān)于SLA基因的功能與作用,特別是豬SLAⅠ類(lèi)基因和SLAⅢ類(lèi)基因的功能與作用,更進(jìn)一步對(duì)它們的作用機(jī)理以及在豬的抗病力、生長(zhǎng)、繁殖中的作用進(jìn)行研究,從而能更好的指導(dǎo)科研工作者為豬的某些研究做基礎(chǔ)。

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