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影響RT-PCR實驗結果的因素

2019-01-05 14:19:25張鵬
中國畜禽種業 2019年4期
關鍵詞:實驗室污染實驗

張鵬

(遼寧省丹東市動物疫病預防控制中心 118002)

1 樣品因素

(1)非洲豬瘟的靶器官是脾臟、淋巴結、腎臟、扁桃體,應選取在病變和健康組織交界處采集樣品。

(2)對于腐敗動物尸體剖檢取股骨,將附著的肌肉和韌帶等全部剔除,采集骨髓。最低建議量5g。

(3)蜱可進行核酸檢測、抗原檢測和蜱的形態學鑒定,查找豬圈的墻邊、墻縫、木質或瓦質的屋頂,或挖掘豬圈地面均可能找到蜱,也可查看豬體表面,采集蜱。

以上3 種是常見的非洲豬瘟檢測樣品。為盡可能減少污染,每取一個組織塊或蜱,用火焰消毒剪鑷等取樣器械,組織樣品分別放入滅菌容器內并立即密封,做好標記,注意防止組織間相互污染。組織樣品的處理應在二級生物安全柜中進行,勿使液體濺到生物安全柜中。

病毒的滅活處理應在二級生物安全柜中進行,將處理好的血清、全血或者研磨破碎后的組織樣品連同EP 管放入60℃水浴中,放置30min 滅活。這樣可以保證檢測樣品的純凈度,保證實驗結果真實有效。

2 人員因素

要求PCR 的實驗操作人員有很好的素質,能嚴格遵守操作規程,并能發現問題和解決問題。PCR 實驗的操作人員除了要做好必要的個人防護之外,還要熟悉實驗流程中容易出現的問題。要實行考核上崗和定期培訓制度。

到不同的操作間時,要注意及時更換防護用品,在核酸提取室操作時,戴的一次性口罩、帽子、手套要勤換,避免污染。在擴增室,對于頂部采光儀器要帶新的一次性PE 手套對熒光PCR 封蓋,對于底部采光的儀器要避免徒手或使用過的手套接觸熒光PCR 管底,檢測過程中使用不帶熒光物質的一次性乳膠手套。

3 儀器因素

要選擇性能好的儀器。RT-PCR 實驗所用的大多屬于貴重儀器,熒光PCR 儀、冷凍離心機、生物安全柜、核酸提取儀,要根據儀器操作規程使用,定期維護保養,填寫使用和維護記錄,做好儀器狀態標識,同時也要對實驗室的溫濕度進行監測記錄,避免實驗室濕度過大使儀器銹蝕。移液器要定期請計量部門進行校正,各室都要有一套完整移液器,互相不能調換使用。

4 試劑因素

試劑質量直接影響實驗結果,所以要選用高質量的PCR 試劑。采購的試劑必須有國家正式的批準文號,認真查看試劑批號和有效期。實驗室對每批購進的試劑要進行校對實驗,質量驗收合格后方可使用。

試劑盒,待檢樣品以及試驗中使用的氯仿、異丙醇等試劑要分區存放,不能存放于同一個冰箱內,避免污染。

凍存試劑使用前應于室溫下完全融化,瞬時離心使液體完全沉于管底,吸頭盡量在液體表層吸取,使用后立即放回-20℃。反復凍融不超過3 次,以免影響試劑性能。

5 實驗因素

(1)實驗室應嚴格按照有關規定分區管理,依照樣品前處理區—核算制備區—擴增區—分析區順序進行基因檢測。各區間人員、器材、試劑及空氣流向應有嚴格要求。

(2)核酸提取時要認真按照試劑使用說明書一步一步進行,防止試劑和樣品受到污染,開離心管時要用雙手,動作要輕,防止液體濺出。加樣時最后加陽性對照,減小陰性對照和樣品被污染的概率。非洲豬瘟試驗需要2 組陰陽對照:提取陽性對照(E+)、提取陰性對照(E-)、反應陽性對照(R+)和反應陰性對照(R-)。

(3)配液時一般要多比反應需要的樣品數量配出2 份,由于加樣量非常小,所以加樣時,吸頭不要碰倒離心管的管壁,樣品加入后,應在液面以下輕輕吹打幾次混勻。

(4)擴增時用將8 連管豎直放正,確保每個管內液體平穩在管底,無掛壁,無氣泡。帶PE 手套操作,不能用裸手接觸管蓋或管底。實驗結束后,要將管從儀器中取出。

總之,影響RT-PCR 實驗準確性的因素有很多,實驗室只有不斷提升檢測人員的能力,加強控制檢測方法和檢測過程,定期開展樣品比對實驗才能有效提高實驗的準確率。

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