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Vps28基因多態(tài)性與EBV相關(guān)腫瘤易感性的關(guān)系

2018-09-26 10:48:18
精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)雜志 2018年4期

(青島大學(xué),山東 青島 266003 1 附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科; 2 醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)教研室)

EB病毒(EBV)是重要的DNA腫瘤病毒,與鼻咽癌、胃癌、淋巴瘤等多種腫瘤的發(fā)生相關(guān)[1-6]。其中90%以上的低分化鼻咽癌(NPC)組織中可檢測(cè)到EBV的存在,NPC發(fā)病存在家族聚集性、種族易感性及地域集中性。近年來,易感基因及病毒感染已逐步成為NPC發(fā)病的重要因素[7],包括EBV基因在內(nèi)的許多基因已被證實(shí)為NPC的易感基因,其多態(tài)性直接影響NPC的發(fā)病機(jī)制及病理類型[8-10]。Vps28是內(nèi)吞體分選轉(zhuǎn)運(yùn)復(fù)合體(ESCRT)的組成結(jié)構(gòu)之一[11],ESCRT在細(xì)胞分選及降解泛素化膜蛋白這一過程中發(fā)揮重要作用,使一些激素、生長(zhǎng)因子及細(xì)胞因子受體在與配體結(jié)合后內(nèi)化并被溶酶體降解,導(dǎo)致受體表達(dá)下調(diào),從而在信號(hào)衰減中起著重要作用[12-13]。表皮生長(zhǎng)因子與受體結(jié)合導(dǎo)致受體活化,誘發(fā)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),控制細(xì)胞的一系列功能,ESCRT在此過程中起到負(fù)向調(diào)節(jié)功能,其結(jié)構(gòu)的變異可引起調(diào)節(jié)異常,導(dǎo)致腫瘤發(fā)生[14-16]。因此,探討Vps28在EBV相關(guān)腫瘤發(fā)生機(jī)制中的作用具有實(shí)踐指導(dǎo)意義。本文研究首次對(duì)EBV相關(guān)NPC(EBVaNPC)組織及EBV相關(guān)淋巴瘤(EBVaL)組織中Vps28基因rs2272658位點(diǎn)多態(tài)性進(jìn)行檢測(cè),以期明確其多態(tài)性與EBV相關(guān)腫瘤的發(fā)生是否存在相關(guān)性。

1 材料與方法

1.1 材料來源

采用原位雜交技術(shù)檢測(cè)105例NPC及136例淋巴瘤石蠟包埋組織切片中EBV編碼的小分子非多聚腺苷酸EBER1的轉(zhuǎn)錄表達(dá)[17],篩選出93例EBVaNPC組織,12例EBV陰性NPC(EBV-negative nasopharyngeal carcinoma,EBVnNPC)組織,87例EBVaL組織,49例EBV陰性淋巴瘤(EBV-negative lymphoma,EBVnL)組織。同時(shí)選取我院健康體檢者100例作為正常對(duì)照組(NC組)。NC組均已排除各種感染、腫瘤及自身免疫病;各組間種族構(gòu)成、年齡分布和性別構(gòu)成在各病例組(包括鼻咽癌組及淋巴瘤組)與NC組間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

1.2 細(xì)胞DNA提取

NC組采集空腹靜脈血5 mL,EDTA抗凝,分離外周血單個(gè)核細(xì)胞。采用QIAamp DNA FFPE試劑盒(Qiagen,德國)并按說明書提取石蠟包埋腫瘤組織DNA。外周血單個(gè)核細(xì)胞DNA提取采用酚-氯仿-異戊醇法,4 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3 Vps28基因rs2272658位點(diǎn)多態(tài)性的檢測(cè)

利用AssayDesigner 3.1軟件設(shè)計(jì)Vps28基因rs2272658位點(diǎn)的反應(yīng)引物,引物序列如下:上游引物:5′-ACGTTGGATGAACTGTTCCTGAGGCAC-TCC-3′;下游引物:5′-ACGTTGGATGTAGAGCC-CAGAGTGCTACC-3′。根據(jù)實(shí)驗(yàn)體系依次進(jìn)行PCR、SAP純化反應(yīng)及單堿基延伸反應(yīng),使用Sequenom公司的MassArray系統(tǒng)進(jìn)行飛行質(zhì)譜實(shí)驗(yàn),通過分析軟件MassArrayTyper 4.0進(jìn)行處理,從而得到Vps28基因rs2272658位點(diǎn)在所有標(biāo)本中的SNP分型。

1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

采用SPSS 21.0統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。采用χ2檢驗(yàn)分析比較基因型和等位基因頻率的分布差異。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié) 果

2.1 各組織中Vps28基因rs2272658位點(diǎn)多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果

在隱性模型當(dāng)中,EBVaNPC組的TT基因型頻率高于NC組(OR=2.07,95%CI=1.16~3.68,χ2=6.21,P<0.05)。EBVaNPC組的T等位基因頻率明顯高于NC組(OR=1.75,95%CI=1.13~2.72,χ2=6.26,P<0.05)。表明TT基因型為EBVaNPC的致病基因型,而T等位基因?yàn)镋BVaNPC的危險(xiǎn)因子。

EBVaNPC組中T等位基因及TT基因型頻率均高于EBVnNPC組(OR=5.07,95%CI=2.08~12.36,χ2=14.71,P<0.01;OR=41.60,95%CI=3.88~447.56,χ2=18.79,P<0.01)。在隱性的模型中,EBVaNPC組中TT基因型的頻率明顯高于EBVnNPC組(OR=13.95,95%CI=1.37~112.53,χ2=9.63,P<0.01)。在顯性模型中,EBVaNPC組CC基因型頻率明顯低于EBVnNPC組(OR=8.80,95%CI=1.962~39.47,χ2=10.60,P<0.01)。表明相對(duì)于EBVnNPC組,TT基因型以及T等位基因?yàn)镋BVaNPC的危險(xiǎn)因子。見表1。

2.2 淋巴瘤組織中Vps28基因rs2272658位點(diǎn)多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果

EBVaL與EBVnL以及NC組間Vps28基因rs2272658位點(diǎn)的基因型分布無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05);EBVaL與EBVnL組及EBVaL與NC組間T等位基因分布均無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(均P>0.05)。結(jié)果見表2。

3 討 論

ESCRT是一類與腫瘤、神經(jīng)病變性及感染性疾病關(guān)系密切的保守蛋白質(zhì),參與細(xì)胞增殖、分化、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等多種生命活動(dòng)的調(diào)控,與多種疾病的發(fā)生密切相關(guān)[18-19],因此ESCRT的組件受損會(huì)引起一系列的疾病。4種蛋白Vps23、Vps28、Vps37、Mvb12構(gòu)成了復(fù)合體ESCRT-Ⅰ,ESCRT-0、Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ以及Vps4 5個(gè)復(fù)合體進(jìn)一步組成了完整的ESCRT。

表1 EBVaNPC組、EBVnNPC組及NC組的Vps28基因rs2272658位點(diǎn)多態(tài)性的分布(例(χ/%))

表2EBVaL組、EBVnL組及NC組的Vps28基因rs2272658位點(diǎn)多態(tài)性的分布(例(χ/%))

組別基因型頻率CCCTTT等位基因頻率CTNC組11(11.00)51(51.00)38(38.00)73(36.50)127(63.50)EBVaL組10(11.49)43(49.43)34(39.08)63(36.21)111(63.79)EBVnL組8(16.32)19(38.78)22(44.90)35(35.71)63(64.29)

研究證明,ESCRT能夠參與病毒的出芽過程,調(diào)控細(xì)胞自噬。BLECK等[20]研究證實(shí),ESCRT通路能夠在HIV-I病毒顆粒組裝時(shí)被聚集,并且參與新生病毒質(zhì)膜分裂的過程,進(jìn)而參與病毒的復(fù)制。有研究結(jié)果顯示,DNA包膜病毒如皰疹病毒和桿狀病毒等的出芽釋放也依賴于宿主細(xì)胞的ESCRT系統(tǒng),ESCRT可以協(xié)助EBV調(diào)整核膜結(jié)構(gòu),促進(jìn)核酸釋放[21]。

ESCRT-I中的Vps23,又稱為Tsg101,是一種腫瘤易感基因,能夠促進(jìn)細(xì)胞分裂和增殖,加快細(xì)胞周期進(jìn)程,促進(jìn)體內(nèi)病毒的運(yùn)輸,在人類多種腫瘤中高度表達(dá),檢測(cè)Tsg101可用于評(píng)估腫瘤惡性程度并為靶向治療提供可能的位點(diǎn)[22]。CHUA等[23]報(bào)道,Tsg101能夠與病毒裂解激活酶Rta反應(yīng),促進(jìn)EBV的晚期基因激活,完成EBV的生產(chǎn)性裂解循環(huán),具有Tsg101缺陷的細(xì)胞不能表達(dá)晚期病毒蛋白,導(dǎo)致病毒顆粒的產(chǎn)量降低。STUCHELL等[24]研究發(fā)現(xiàn),Tsg101蛋白發(fā)生突變之后由于不能夠與Vps28蛋白連接,因而使細(xì)胞具備了抑制HIV出芽的能力。因此可以推斷,Vps28與腫瘤易感基因Tsg101關(guān)系較為密切,是病毒復(fù)制及其信號(hào)通路中不可缺少的一部分。Vps28的基因多態(tài)性亦有可能引起Tsg101功能的改變,進(jìn)而影響病毒相關(guān)腫瘤的易感性。

WAGENAAR等[25]研究表明,在Vps28缺失的條件下,肺腺癌細(xì)胞系A(chǔ)549對(duì)miR21抑制劑的攝取作用大大增強(qiáng),侵襲能力明顯減弱,增殖速度降低。上述研究結(jié)果提示,Vps28與miR21在腫瘤中的作用密切相關(guān),Vps28的基因多態(tài)性在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中起到了重要的輔助作用。

本研究首次對(duì)Vps28基因rs2272658位點(diǎn)多態(tài)性與EBV相關(guān)腫瘤的易感性進(jìn)行探討。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,EBVaNPC中TT基因型頻率和T等位基因頻率明顯高于EBVnNPC組及NC組,提示T等位基因可能是EBVaNPC發(fā)病的危險(xiǎn)因子,攜帶T等位基因可能會(huì)增加EBVaNPC的易感性。由此可以推斷Vps28基因rs2272658位點(diǎn)多態(tài)性與EBVaNPC具有相關(guān)性。

本研究結(jié)果顯示,EBVaL、EBVnL及NC組間Vps28基因rs2272658位點(diǎn)多態(tài)性分布無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,表明該位點(diǎn)的多態(tài)性與此類疾病無明顯相關(guān)性。在EBV的生命周期中,口咽部和唾液腺等的上皮組織通常是病毒復(fù)制的主要部位[26-30],而淋巴瘤為間葉組織中造血組織腫瘤,鑒于兩者組織來源不同,EBV感染的潛伏類型也不盡相同,因此Vps28基因rs2272658位點(diǎn)多態(tài)性與EBV的相互影響更易于發(fā)生在上皮細(xì)胞的腫瘤中[31-32]。

總之,本研究結(jié)果提示Vps28基因rs2272658位點(diǎn)基因型頻率、等位基因頻率與EBVaNPC易感性有關(guān),攜帶T等位基因會(huì)增加患EBVaNPC的風(fēng)險(xiǎn),Vps28基因rs2272658位點(diǎn)多態(tài)性與淋巴瘤組織中EBV感染無相關(guān)性。Vps28基因rs2272658位點(diǎn)多態(tài)性與EBV感染及有關(guān)信號(hào)通路中的相互關(guān)系還有待更進(jìn)一步的研究。

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