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產(chǎn)耐有機溶劑糖苷酶菌株的篩選與鑒定*

2018-07-07 02:05:34金歡煥陳少云
海外文摘·藝術(shù) 2018年2期

金歡煥 陳少云

(浙江中醫(yī)藥大學生命科學學院,浙江杭州 310053)

糖苷酶(Glycoside hydrolases, GH, EC 3.2.1),又稱糖苷水解酶,廣泛存在于生物體中,在自然界糖苷鍵的水解過程中扮演著非常重要的角色。糖苷酶作為一類重要的化合物,在食品、醫(yī)療、工業(yè)等領(lǐng)域都有著十分廣泛的利用價值。但目前已知存在的糖苷酶大多數(shù)都存在酶活力低的問題,且該酶來源十分匱乏。因此,尋找天然產(chǎn)耐有機溶劑糖苷酶的微生物顯得尤為重要。本實驗采用含有機溶劑的培養(yǎng)基,篩選能產(chǎn)耐有機溶劑糖苷酶的微生物,并對所得微生物進行生物學鑒定,優(yōu)化產(chǎn)酶條件,為進一步的研究和應(yīng)用提供酶源和基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 主要設(shè)備與材料

臺式高速冷凍離心機,德國希格瑪離心機有限公司,singma3K15型;PCR自動系列化分析儀,德國耶拿分析儀,Tpersonal型;瓊脂糖水平電泳儀,北京市六一儀器廠,DYCP-32A型。

浙江臺州路橋某家化工企業(yè)所排污水長期污染過的土樣。羧甲基纖維素鈉(CM C-N a)、N,N-二甲基甲酰胺(DMF)、對硝基苯酚-p-D-葡萄糖苷、HEPES。

1.1.2 培養(yǎng)基

富集培養(yǎng)基:羧甲基纖維素鈉(CMC-Na)10.0 g/L,DMF 5%,胰蛋白胨25.0 g/L,酵母提取物3.0 g/L,NaCl 5.0 g/L,KHPO3.0 g/L,KHPO1.0 g/L,微量元素液100 mL/L(MgSO·7HO 0.3g,F(xiàn)eSO·7HO 0.005 g,CaCl0.005g,溶于100 ml蒸餾水中),pH 7.0。

初篩培養(yǎng)基:將富集培養(yǎng)基中的胰蛋白胨替換成(NH)SO5.0 g/L。

圖1 產(chǎn)耐有機溶劑糖苷酶微生物顯微形態(tài)

圖2 菌株ZXS的16SrDNA序列比對

圖3 不同因素對酶活力的影響

復(fù)篩液體培養(yǎng)基:羧甲基纖維素鈉(CM C-Na)10.0 g/L,蛋白胨 3.0 g/L,酵母提取物2.0 g/L,DMF 5%,(NH)SO5.0 g/L,NaCl 5 g/L,KHPO3 g/L,KHPO1.0 g/L,微量元素溶液100 mL/L,pH 7.0。1.2 方法

1.2.1 富集培養(yǎng)

將采集的土壤懸浮在裝有90 mL已滅菌的生理鹽水的錐形瓶中,在180 r/min,30 ℃條件下的搖床中震蕩30 min,取部分菌液轉(zhuǎn)移到富集液體培養(yǎng)基進行培養(yǎng),然后重復(fù)轉(zhuǎn)接2次。

1.2.2 初篩

選擇有明顯的微生物生長的富集培養(yǎng)液,取部分富集培養(yǎng)液涂布于初篩固體培養(yǎng)基上,30 ℃恒溫箱中培養(yǎng)24 h,觀察平板上微生物生長情況。

1.2.3 復(fù)篩及酶活測定

從初篩培養(yǎng)基中挑取明顯生長的單菌落于復(fù)篩液體培養(yǎng)基中培養(yǎng),然后取菌懸液離心收集菌體,再用等體積的50 mM HPPES(pH7.0)緩沖液重懸,制得菌懸液,以對硝基苯酚葡萄糖苷為底物,測其糖苷酶活力大小。

1.2.4 菌種鑒定

分離純化菌種,觀察純種菌種的菌落形態(tài),包括菌落大小,顏色,濕度,邊緣等;用革蘭氏染色,用顯微鏡觀察細菌形態(tài);根據(jù)試劑盒提取基因組DN A,然后進行PCR擴增(50 μl的體系:去離子水21 μl,PrimeSTAR MAX Premix 25 μl,基因組1 μl,引物pF-rRNA和pR-rRNA各1.5 μ l),瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR結(jié)果。接著對PCR產(chǎn)物割膠回收,利用割膠回收試劑盒純化基因組以及回收基因組。最后,進行測序,在基因庫進行比對,制作進化樹。

2 實驗結(jié)果與分析

2.1 微生物鑒定

2.1.1 形態(tài)鑒定

對微生物進行革蘭氏染色,并在顯微鏡下觀察其染色情況以及形態(tài),實驗結(jié)果如圖1所示,微生物革蘭氏染色呈紫色,所以該微生物屬于革蘭氏陽性菌,并且微生物的形態(tài)呈桿狀,桿狀比較短,屬于短桿菌類。

2.1.2 分子生物學鑒定

通過提取基因組,再進行PCR,瓊脂糖凝膠電泳后進行割膠回收純化基因,并將片段收回用于測序。經(jīng)過序列比對,得出該微生物的生長進化樹如圖2所示。經(jīng)過序列比對得出該微生物與Enterobacter cloacae(陰溝腸桿菌)一類序列最為接近。

2.2 微生物產(chǎn)酶性質(zhì)研究

2.2.1 反應(yīng)溫度對酶活力的影響

對于反應(yīng)溫度進行優(yōu)化,分別考察了20、25、30、35、37、40 ℃條件下微生物ZXS的產(chǎn)酶活力,每個條件都進行3次平行重復(fù)試驗。結(jié)果如圖3(A)所示,隨著反應(yīng)溫度的不斷升高,該酶活力先升高達到最大值后再降低,其中在溫度為35 ℃時產(chǎn)酶效果最佳。

2.2.2 反應(yīng)體系pH值對酶活力的影響

對于反應(yīng)體系中的p H進行優(yōu)化,分別在p H為5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0的條件下進行考察,每個條件進行3次平行重復(fù)試驗,再檢測微生物ZXS的產(chǎn)酶活力。結(jié)果如圖3(B)所示,隨著pH的變化酶活力也在不斷地變化,總體趨勢是隨著pH的不斷增大,酶活力呈現(xiàn)上升趨勢,其中pH為7.0和10.0時酶活力達到最高,接近相等,所以該菌株在一定程度上具有耐受堿性能力,并且在pH 5.0~10.0之間時,此酶的催化活力都相對較穩(wěn)定。

2.2.3 DMF濃度對酶活力的影響

對于反應(yīng)體系中有機溶劑試劑DMF的含量進行考察,分別選取了不含DMF試劑,含5%、10%、15%、20%DMF的反應(yīng)體系進行反應(yīng),每個條件進行3次平行重復(fù)試驗,再檢測微生物ZXS的產(chǎn)酶活力。結(jié)果如圖3(C)所示,隨著DMF濃度的升高,菌株的產(chǎn)酶性能逐漸減弱,但并沒有完全抑制酶活力,所以總體上D MF對該酶的酶活力有一定的抑制作用。

2.2.4 不同有機溶劑對酶活力的影響

對于微生物ZXS的耐有機溶劑性能進行考察,在反應(yīng)體系中分別含有10%的DMF、二甲基亞砜(DMSO)、無水乙醇的條件下進行催化反應(yīng),每個條件進行3次重復(fù)試驗,再檢測微生物ZXS的產(chǎn)酶活力。結(jié)果如圖3(D)所示,該菌株在相同條件下對二甲基亞砜的耐受力更好,對無水乙醇的耐受力最差。

3 結(jié)語

本實驗篩選得到1株產(chǎn)耐有機溶劑糖苷酶的微生物,命名為ZXS,屬于Enterobacter cloacae(陰溝腸桿菌)類革蘭氏陽性菌株。該菌株在無有機溶劑的情況下酶活最高達到40.2U/L。經(jīng)進一步對其產(chǎn)酶條件的優(yōu)化,菌株培養(yǎng)8h后,在反應(yīng)溫度為35℃,pH為7.0,DMF含量為5%時,酶活力最高達到25.9U/L。

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