李海龍,宋耀輝,陳兆峰,王晶,2,田一虹,2,王圓圓,2,陳徹,牛媛瑕
(1.甘肅中醫(yī)藥大學臨床醫(yī)學院臨檢基礎教研室,蘭州 730000;2.甘肅省中醫(yī)方藥挖掘與創(chuàng)新轉化重點實驗室,甘肅省中藥新產品創(chuàng)制工程實驗室,蘭州 730000;3.蘭州大學第一醫(yī)院消化科,蘭州 730000;4.甘肅中醫(yī)藥大學附屬醫(yī)院檢驗科,蘭州 730000)
·腫瘤與微環(huán)境檢測·
miR-20a-5p/miR-20b-5p在胃癌細胞和組織中的表達及調控靶基因信號通路富集分析*
李海龍1a,2,宋耀輝1,陳兆峰3,王晶1,2,田一虹1,2,王圓圓1,2,陳徹1,牛媛瑕4
(1.甘肅中醫(yī)藥大學臨床醫(yī)學院臨檢基礎教研室,蘭州 730000;2.甘肅省中醫(yī)方藥挖掘與創(chuàng)新轉化重點實驗室,甘肅省中藥新產品創(chuàng)制工程實驗室,蘭州 730000;3.蘭州大學第一醫(yī)院消化科,蘭州 730000;4.甘肅中醫(yī)藥大學附屬醫(yī)院檢驗科,蘭州 730000)
目的觀察miR-20a-5p/miR-20b-5p在胃癌細胞和胃癌組織中的表達,并用生物信息學方法分析其靶基因和富集的信號通路,探討其生物學行為和功能。方法采用實時熒光定量PCR法檢測miR-20a-5p/miR-20b-5p在不同分化程度(高、中、低)的胃癌細胞和正常胃黏膜細胞以及其在胃癌組織和癌旁組織中的表達水平,并分析其臨床意義,采用mirWALK網(wǎng)站數(shù)據(jù)庫的預測軟件預測其靶基因,選擇該網(wǎng)站10個軟件中具備3個以上軟件支持的靶基因,用DAVID 6.7在線富集其靶基因參與的信號通路。結果miR-20a-5p/miR-20b-5p在不同分化程度(高、中、低)的胃癌細胞中表達上調(P均<0.05),胃癌組織相對于癌旁組織亦明顯上調表達(P<0.05),miR-20b-5p表達上調與胃癌淋巴結侵襲轉移以及浸潤深度關系密切(P均<0.05);生物信息學分析提示,miR-20a-5p/miR-20b-5p的靶基因富集存在于腫瘤相關的多個信號通路中。結論miR-20a-5p/miR-20b-5p在胃癌細胞系及組織中呈高表達,并于與淋巴結侵襲轉移以及浸潤深度有關,可作為胃癌潛在的生物學標志物。
miR-20a-5p;miR-20b-5p;胃癌
研究證實,microRNAs(miRNAs)與胃癌的發(fā)生發(fā)展、侵襲轉移、對化療藥物耐藥、臨床病理參數(shù)等關系十分密切[1-2]。miRNA發(fā)揮著類似于抑癌基因和癌基因的功能, 在腫瘤發(fā)生過程中起至關重要的作用,已經成為特異性的胃癌分子標志物之一。……