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基于雙重猝滅原理的分子信標(biāo)定量檢測凝血酶

2017-11-20 18:08:56翟琨李奉權(quán)史伯安向東山
分析化學(xué) 2017年10期
關(guān)鍵詞:信號檢測

翟琨+李奉權(quán)+史伯安+向東山

摘 要 利用G堿基和有機猝滅基團對熒光基團的雙重猝滅作用構(gòu)建了分子信標(biāo),建立了一種基于雙重猝滅原理的檢測凝血酶的簡單方法。此分子信標(biāo)中熒光基團設(shè)計為羧基熒光素(FAM),有機猝滅基團設(shè)計為Black Hole Quencher 1 (BHQ1),BHQ1連接3個含有G堿基的核苷酸,分子信標(biāo)的環(huán)設(shè)計為凝血酶的核酸適配體。體系中沒有凝血酶時,分子信標(biāo)呈莖環(huán)結(jié)構(gòu),熒光基團FAM與有機猝滅基團BHQ1及G堿基相互靠近,F(xiàn)AM的熒光在BHQ1及G堿基的雙重猝滅下,其熒光信號很弱; 當(dāng)體系中有凝血酶存在時,分子信標(biāo)與凝血酶特異性結(jié)合,形成G四聯(lián)體結(jié)構(gòu),莖環(huán)結(jié)構(gòu)被破壞,F(xiàn)AM遠離猝滅基團BHQ1及G堿基,其熒光得到恢復(fù)。在最適條件下,體系的熒光強度(ΔI)與凝血酶的濃度(C)在0.4~40 nmol/L范圍內(nèi)具有良好的線性關(guān)系,線性回歸方程為ΔI=24.63C (nmol/L)+13.06 (R2=0.9972),檢出限為0.18 nmol/L (3σ, n=9)。實際血樣加標(biāo)回收率為96.3%~98.7%。

1 引 言

凝血酶(Thrombin,TB)是一種由凝血酶前體形成的絲氨酸蛋白酶,在人體凝血過程中發(fā)揮了重要作用[1,2]。適配體是通過指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進化技術(shù),經(jīng)體外篩選得到的能與蛋白質(zhì)或小分子的特定區(qū)域相結(jié)合的寡聚核苷酸片段(DNA或RNA),可以特異性地識別相應(yīng)的靶分子[3~8]。迄今,已篩選到的凝血酶核酸適配體序列有兩個,一個是由 15個堿基構(gòu)成的能識別凝血酶的肝素結(jié)合位點的適配體,另一個是由29個堿基構(gòu)成的能識別凝血酶血纖維蛋白結(jié)合位點的適配體[9,10]。目前,這兩種凝血酶核酸適配體都已被廣泛用于凝血酶的檢測[11~14]。

分子信標(biāo)是一種可形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)的莖環(huán)雙標(biāo)記的寡核苷酸探針,具有選擇性好、檢測速度快以及無需與未反應(yīng)的探針分離即可實時檢測等特點,廣泛應(yīng)用于核酸檢測分析[15~17]。目前分子信標(biāo)在凝血酶的檢測中已有應(yīng)用,但使用的多為傳統(tǒng)的分子信標(biāo),熒光背景較高,影響了定量分析的靈敏度[18,19]。

本研究基于鳥嘌呤(G堿基)對FAM具有較好的猝滅作用[20,21]的原理,利用G堿基和有機猝滅基團對FAM的雙重猝滅作用,設(shè)計了一種結(jié)構(gòu)簡單、合成容易的具有雙重猝滅作用的分子信標(biāo),穩(wěn)定性好, 熒光背景信號低, 與凝血酶反應(yīng)速度快,基于此建立了快速定量檢測凝血酶的新方法。

2 實驗部分

2.1 儀器與及試劑

RF5301PC熒光光譜儀(日本Shimadzu公司); 凝血酶(上海麥克林生化科技有限公司(中國)); 牛血清蛋白(BSA)、雞卵清白蛋白(OVA)、牛血紅蛋白(HB),購于上海邦景實業(yè)有限公司; 其它試劑均為分析純,購于國藥集團化學(xué)試劑有限公司; 實驗所用緩沖溶液為0.1 mol/L TrisHCl 緩沖溶液; 所有的分子信標(biāo)均由上海生工生物技術(shù)有限公司(中國)合成,其序列如表1所示。

2.2 樣品制備及檢測

將分子信標(biāo)及凝血酶分別用0.1 mol/L TrisHCl (pH 8.0)緩沖溶液配制成400 nmol/L儲備液,并分別稀釋成不同濃度的溶液,備用。取50 μL凝血酶溶液加入到50 μL的分子信標(biāo)溶液中,混合均勻,補加TrisHCl緩沖溶液至500 μL,室溫下反應(yīng)30 min,檢測熒光信號。本研究采用同步熒光分析法,因為FAM的最大激發(fā)波長與最大發(fā)射波長之差(斯托克斯位移)為26 nm,因此實驗中同步掃描的波長間隔(Δλ)設(shè)置為26 nm,熒光分光光度計的激發(fā)及發(fā)射狹縫寬度均設(shè)置為10 nm。

2.3 選擇性實驗

在4份50 μL 400 nmol/L凝血酶溶液中,分別加入50 μL蒸餾水、50 μL 濃度為4×10

Symbolm@@ 4 mol/L的牛血清蛋白(BSA)、卵清白蛋白(OVA)、牛血紅蛋白(HB)溶液,再分別加入50 μL 400 nmol/L分子信標(biāo)溶液,最后加入TrisHCl緩沖溶液至500 μL,混合均勻,常溫下反應(yīng)30 min后,進行熒光檢測。

3 結(jié)果與討論

3.1 檢測原理

利用雙重猝滅分子信標(biāo)檢測凝血酶的原理如圖1所示。體系中沒有凝血酶存在時,分子信標(biāo)呈莖環(huán)結(jié)構(gòu),熒光基團FAM與猝滅基團BHQ1及G堿基相互靠近,F(xiàn)AM的熒光在BHQ1及G的雙重猝滅下,其熒光信號很弱; 體系中存在凝血酶時,分子信標(biāo)的環(huán)即凝血酶的適配子序列與凝血酶特異性結(jié)合形成G四聯(lián)體結(jié)構(gòu),莖環(huán)結(jié)構(gòu)被破壞,F(xiàn)AM熒光基團遠離猝滅基團BHQ1及G堿基,熒光得到恢復(fù)。凝血酶濃度越高,與其結(jié)合的分子信標(biāo)越多,即更多的環(huán)被打開,因此體系的熒光信號越強,通過FAM熒光信號增強的程度可實現(xiàn)對凝血酶的定量檢測。

3.2 雙重猝滅分子信標(biāo)的構(gòu)建

本研究中,凝血酶的檢測是基于有機猝滅基團和G堿基對熒光基團的雙重猝滅作用。選擇能被G堿基猝滅的有機染料FAM 作為分子信標(biāo)的熒光基團, BHQ1作為分子信標(biāo)的猝滅基團,因為BHQ1的最大吸收波長為535 nm,F(xiàn)AM的最大發(fā)射波長為525 nm,因此在BHQ1與FAM相互靠近時,F(xiàn)AM的熒光能被BHQ1很好地猝滅。另外,與BHQ1相連接的G堿基數(shù)目越多,猝滅的效果越好[22]。本研究設(shè)計了G堿基數(shù)目分別為3個、2個、1個及沒有G堿基的4種分子信標(biāo)(即MB1、MB2、MB3、MB4),并與沒有猝滅基團的分子信標(biāo)(MB6)的猝滅效果進行比較(圖2)。結(jié)果表明,隨著G堿基數(shù)目的增加,分子信標(biāo)的背景熒光逐漸降低,但降低的程度逐漸減小。這主要是因為增加的G堿基與熒光基團的距離逐漸增加的緣故。因此,選擇MB1對凝血酶進行檢測。

圖2 分子信標(biāo)莖的不同G堿基數(shù)目對猝滅效果的影響(a→e: MB1,MB2,MB3,MB4,MB6),各分子信標(biāo)的濃度均為32 nmol/Lendprint

Fig.2 Effect of the number of G base in the stem of MB on quenching effect (a→e: MB1, MB2, MB3, MB4, MB6). Concentration of each MBs is 32 nmol/L, respectively

3.3 雙重猝滅分子信標(biāo)性能評價

對不同猝滅基團猝滅FAM的效果進行考察(圖3)。結(jié)果表明,當(dāng)分子信標(biāo)中既沒有G堿基也沒有猝滅基團(MB6)時,體系具有較強的熒光信號(圖3d); 當(dāng)分子信標(biāo)中只有有機猝滅基團(MB4)或只有G堿基(MB5)時,分子信標(biāo)的熒光信號顯著減弱(圖3b, 3c),說明有機猝滅基團BHQ1和G堿基對FAM都具有很好的猝滅作用; 當(dāng)分子信標(biāo)中既有G堿基, 又有有機猝基團BHQ1(MB1)時,分子信標(biāo)的熒光信號變得非常微弱(圖3a),說明G堿基和有機猝基團BHQ1對FAM的雙重猝滅效果更好。根據(jù)計算,經(jīng)典分子信標(biāo)(MB4)的猝滅效率為90.3%,信背比(沒有猝滅基團的分子信標(biāo)所產(chǎn)生的信號與有猝滅基團的分子信標(biāo)所產(chǎn)生的信號之比)為10.3; 雙重猝滅分子信標(biāo)的猝滅效率為97.5%,信背比為39.8。因此,基于雙重猝滅的分子信標(biāo)的熒光背景遠低于經(jīng)典分子信標(biāo)。

3.4 工作曲線及檢出限

考察了凝血酶的濃度與相應(yīng)的體系熒光強度之間的關(guān)系,圖4為不同濃度的凝血酶所對應(yīng)的同步熒光光譜圖。在0.4~ 40.0 nmol/L范圍內(nèi),體系的熒光強度(ΔI)與凝血酶的濃度(C)具有良好的線性關(guān)系(圖4插圖),線性回歸方程為ΔI= 24.63 C (nmo/L)+13.06 (R2=0.9972),檢出限為0.18 nmol/L(3σ, n=9)。對3.0 nmol/L凝血酶重復(fù)測定9次,響應(yīng)值的相對標(biāo)準(zhǔn)偏差(RSD)為 3.7%,說明此方法精密度良好。

3.5 選擇性

對建立的檢測方法的特異性進行了考察(圖5)。結(jié)果表明, 40 nmol/L凝血酶溶液中加入40.0 μmol/L的BSA、OVA及HB后,各體系的熒光強度幾乎無變化,說明這幾種干擾蛋白的存在對凝血酶的檢測沒有明顯影響,表明此分析方法具有良好的選擇性。

與文獻報道的利用適配體或熒光方法檢測凝血酶方法相比(表2),本方法檢出限更低。

3.6 血清樣品的加標(biāo)回收實驗

取人血清樣品,離心后稀釋500倍; 取2份稀釋后的血清樣品,分別加入不同濃度水平的凝血酶,利用本方法進行檢測(表3)。兩個加標(biāo)水平的回收率為96.3%和98.7%,說明本方法具有較高的準(zhǔn)確性。

4 結(jié) 論

利用G堿基和有機猝滅基團對熒光基團的雙猝滅作用構(gòu)建了一種結(jié)構(gòu)簡單的基于雙重猝滅原理的分子信標(biāo),并建立了一種檢測凝血酶的簡單方法,獲得了更低的檢出限(0.18 nmol/L)。endprint

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