1株H6N6亞型禽流感病毒分子遺傳特性分析

祁思敏，宋勇春，崔侖標，焦永軍，祁賢

1. 南京大學生命科學學院，南京 210093； 2. 江蘇省疾病預防控制中心，南京 210009； 3. 浙江省中醫藥大學藥學院，杭州 310053

·論著·

1株H6N6亞型禽流感病毒分子遺傳特性分析

祁思敏3，宋勇春1，崔侖標2，焦永軍2，祁賢2

1. 南京大學生命科學學院，南京 210093； 2. 江蘇省疾病預防控制中心，南京 210009； 3. 浙江省中醫藥大學藥學院，杭州 310053

本研究采用無特定病原體(specific pathogen free，SPF)雞胚，從某活禽市場環境中分離出1株H6N6亞型禽流感病毒(A/environment/Zhenjiang/zj18/2013，en/zj18)。通過二代測序技術進行全基因組測序，通過BLASTn 進行同源性檢索，并采用MEGA5.0軟件構建系統發生樹。基因進化樹分析表明，分離株en/zj18的所有8個基因節段(PB2、PB1、PA、HA、NP、NA、M和NS)均與近年來中國華東地區流行的H6N6亞型禽流感病毒的相應基因位于同一進化分支，與參考株的核苷酸同源性達96.7%～99.6%。分離株en/zj18的HA蛋白裂解位點為PQIETR↓GL，是低致病性禽流感病毒的分子特征。HA蛋白上關鍵受體結合位點190和228位(按H3亞型的HA蛋白序列排序)氨基酸分別是E和G，理論上更易與α2，3-半乳糖苷唾液酸受體結合。結果提示，需加強活禽市場禽流感病毒的持續監測，從而為有效應對禽流感病毒對公共衛生的持續威脅提供科學依據。

禽流感病毒；H6N6亞型；病毒分離；基因組測序

甲型流感病毒(influenza A virus)屬正黏病毒科，基因組由8個節段的單股負鏈RNA組成。RNA可編碼的蛋白包括RNA聚合酶(PB1、PB2和PA)、血凝素(hemagglutinin，HA)、神經氨酸酶(neuraminidase，NA)、核蛋白(nuclear protein，NP)、基質蛋白(M1和M2)、非結構蛋白(NS1、NS2/NEP、PB1-F2等)。HA和NA是病毒粒子的兩個重要表面糖蛋白，根據其抗原性差異，甲型流感病毒可分為不同亞型。作為甲型流感病毒的主要自然儲存宿主，野生水禽中已發現16種HA亞型和9種NA亞型。……