周聯(lián)東 柳繼鳳 孫佩
摘要 以玉米品種沃玉964及其親本為試驗(yàn)材料,進(jìn)行了沃玉964玉米品種SSR指紋圖譜的構(gòu)建研究。結(jié)果表明,從72對(duì)玉米SSR引物中篩選出在沃玉964雙親間多態(tài)性好、重復(fù)性高的6對(duì)引物(分別為Phi090、umc2105、bnlg2305、umc1125、phi065和umc1506),可用于沃玉964的真實(shí)性檢測(cè),同時(shí)可為鑒定種子純度提供參考。該方法準(zhǔn)確可靠、實(shí)用性強(qiáng),為生產(chǎn)上沃玉964真實(shí)性的快速、有效鑒定提供了科學(xué)依據(jù)。
關(guān)鍵詞 玉米;沃玉964;SSR標(biāo)記;指紋圖譜
中圖分類號(hào) S513 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A 文章編號(hào) 1007-5739(2017)15-0001-01
Abstract Taking Woyu 964 and its parents as test material,fingerprint construction of corn variety Woyu 964 was studied.The results showed that six pairs of primers(Phi090,umc2105,bnlg2305,umc1125,phi065 and umc1506) screening from 72 pairs of maize SSR primers could be applied in authenticity detection of Woyu 964,which presented polymorphism,stable and clear between the parents. The method with high accuracy and strong practicality was applicable for testing seed purity of Woyu 964 rapidly and efficiently.
Key words maize;Woyu 964;SSR marker;fingerprinting
玉米品種的真實(shí)性檢驗(yàn)和純度鑒定對(duì)玉米種子質(zhì)量管理具有重要意義。SSR標(biāo)記具有數(shù)量豐富、信息含量高、呈共顯性、檢驗(yàn)程序簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn),被廣泛應(yīng)用于許多作物的DNA指紋圖譜構(gòu)建。近年來(lái),前人在利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)構(gòu)建DNA指紋圖譜方面做了大量的研究工作。王鳳格等[1]利用10個(gè)SSR引物對(duì)420份已知玉米雜交種進(jìn)行DNA指紋分析,確定bnlg161和bnlg1450為玉米雜交種純度鑒定的首選核心引物,5個(gè)引物bnlg439、bnlg125、umc2105、umcl705和bnlg1792為玉米雜交種純度鑒定的備選核心引物。趙 靜等[2]采用100對(duì)玉米SSR引物分析了陜西省23個(gè)主要玉米自交系的遺傳多態(tài)性,從中篩選出擴(kuò)增帶型清晰、穩(wěn)定的30對(duì)引物作為構(gòu)建23個(gè)玉米自交系指紋圖譜的核心引物。邱紅波等[3]利用86對(duì)SSR引物分析了36份喀斯特高海拔山區(qū)玉米骨干自交系的多態(tài)性,從中確立了多態(tài)性、重復(fù)性均較好的34對(duì)核心引物。
蓋樹(shù)鵬等[4]分別利用74對(duì)SSR引物對(duì)35份骨干自交系和19份主栽雜交種進(jìn)行了SSR分析,分別篩選出10對(duì)和20對(duì)適于玉米自交系和雜交種分析的核心引物。王文潔等[5]從50對(duì)SSR引物中篩選出雙親間多態(tài)性明顯、重復(fù)性較好的5對(duì)引物bmc1792、bmc1496、umc2105、bnlg2291和phi065,可用于鑒定玉米品種新科19的真實(shí)性,同時(shí)為鑒定該種子的純度提供參考。邸仕忠等[6]選用32對(duì)玉米SSR引物檢測(cè)重慶市部分常用及新選玉米自交系間的遺傳差異,從中篩選出10對(duì)引物作為構(gòu)建66個(gè)玉米自交系指紋圖譜的核心引物。
沃玉964是河北沃土種業(yè)股份有限公司選育的高產(chǎn)廣適多抗玉米品種,目前已通過(guò)河北、河南兩省審定、天津市引種認(rèn)定和山西省引種備案。為了準(zhǔn)確、高效地鑒定沃玉964,本研究對(duì)該品種及其親本進(jìn)行了分子指紋圖譜構(gòu)建。
1 材料與方法
1.1 供試材料
供試材料為沃玉964雜交種及其親本ND140和Z598,均由河北沃土種業(yè)股份有限公司提供。DNA聚合酶、dNTP購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司。SSR分析中所用的72對(duì)引物序列由玉米基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.maizegdb.org/ssr.php)獲得,分布在玉米10條染色體上[7-8],由上海英駿生物工程有限公司合成。
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 DNA的提取。將沃玉964雜交種及其親本種子在25 ℃培養(yǎng)箱內(nèi)暗培養(yǎng)8 d左右,取黃化葉片混樣,置于液氮中冷凍、研磨,用CTAB法提取基因組DNA[7]。紫外分光光度計(jì)檢測(cè)DNA濃度和質(zhì)量,將DNA樣品濃度稀釋至20 ng/μL,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 擴(kuò)增體系及電泳分析。20 μL的反應(yīng)體系包括2 μL 10×PCR Buffer、1 U Taq DNA 聚合酶、0.2 mmol/L dNTPs、0.25 μmol/L引物和20 ng模板DNA。PCR擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃ 變性40 s,60 ℃ 退火35 s,72 ℃延伸 45 s,30個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。PCR反應(yīng)在BIOER TC-96/G/H(b)型PCR儀上進(jìn)行。反應(yīng)結(jié)束后置于4 ℃貯藏備用。反應(yīng)產(chǎn)物變性后用8%變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分離(75W, 1 h),銀染[9-10]。
2 結(jié)果與分析
2.1 SSR多態(tài)性引物篩選
用分布在玉米10條染色體上的72對(duì)SSR標(biāo)記引物,對(duì)沃玉964的2個(gè)親本DNA進(jìn)行擴(kuò)增,初步篩選到能夠擴(kuò)增出條帶并在親本間有差異的10對(duì)引物。用這10對(duì)引物擴(kuò)增沃玉964及其親本,通過(guò)多次重復(fù)和比較最終選擇出6對(duì)引物,可以用于構(gòu)建沃玉964的指紋圖譜(表1)。endprint
2.2 指紋圖譜構(gòu)建
在擴(kuò)增條帶中,引物Phi090、umc2105、bnlg2305、umc1125、phi065、umc1506的指紋圖譜中(圖1)沃玉964及其親本均表現(xiàn)出較好的雜種共顯性圖譜特征,而且這些引物所擴(kuò)增出的主帶大小集中在100~400 bp之間。
3 結(jié)論與討論
SSR分子標(biāo)記技術(shù)在遺傳圖譜構(gòu)建、遺傳多樣性分析、自交系系譜研究、雜種優(yōu)勢(shì)類群劃分和DNA指紋圖譜構(gòu)建等方面的研究都有很好的應(yīng)用價(jià)值[11-12]。本研究篩選出6對(duì)SSR引物對(duì)沃玉964雜交種和親本進(jìn)行了SSR圖譜的構(gòu)建,這6對(duì)SSR引物重復(fù)性好,可為沃玉964真實(shí)性鑒定和純度檢驗(yàn)提供參考。
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