楊秀媚
【摘要】 目的 探討分析石蠟包埋組織DNA快速提取法應用于分子病理檢測的價值。方法 63份經石蠟包埋的組織, 隨機分為實驗組(32份)和對照組(31份)。實驗組采用DNA快速提取法, 對照組采用試劑盒DNA提取法。分別對兩組提取出的DNA進行對比分析。結果 實驗組在小組織標本中提取DNA的濃度及純度均低于對照組;實驗組在大組織標本中提取DNA的濃度及純度與對照組比較無顯著差異。對照組中提取的DNA擴增后可達到500 bp以上, 實驗組擴增產物則在400 bp以上。結論 分子病理檢測中應用石蠟包埋組織DNA快速提取法, 可在保證質量的情況下, 大大縮短檢測時間, 提高檢測安全性, 臨床上值得應用。
【關鍵詞】 分子病理檢測;石蠟包埋組織;DNA快速提取法;價值
DOI:10.14163/j.cnki.11-5547/r.2017.24.118
近年來, 隨著分子病理學的不斷發展, 人們對腫瘤疾病的認識與研究不再局限于患者的器官、細胞, 而是延伸到了蛋白質、DNA等水平。分子病理學使病理診斷變得更加準確、客觀, 而且在腫瘤的治療及預后等方面也有著重要價值, 其中免疫檢測、基因檢測、流式細胞術等技術目前應用較為廣范, 全面推動著醫療技術的發展[1]。提取DNA是分子病理檢測的重要內容, 本研究通過對石蠟包埋組織進行DNA提取、分析, 旨在評價石蠟包埋組織DNA快速提取法應用于分子病理檢測中的價值, 現報告如下。
1 材料與方法
1. 1 材料 選取2016年3~12月經石蠟包埋的組織63份, 將其隨機分為實驗組(32份)和對照組(31份)。所有標本均使用中性甲醛固定, 其中淋巴結、腫瘤、宮頸組織各21份。
1. 2 方法
1. 2. 1 實驗組 采用DNA快速提取法, 對每例標本制作4張蠟片, 首先將蠟片置入離心管中并加入裂解液, 采用金屬浴方法將石蠟溶解, 并將溫度控制在95℃, 持續時間在10 min左右, 然后以14000 r/min對其進行離心操作, 離心過程持續5 min, 最后將蠟層下出現的清涼溶液置于-20℃環境下保存。
1. 2. 2 對照組 采用試劑盒DNA提取法, 與實驗組相同方法制作4張蠟片, 將其置入離心管中并加入二甲苯1 ml, 14000 r/min對其進行離心操作, 3 min后拋除上層清亮液體, 重復操作1次;1 ml無水乙醇加入離心管中, 混勻后重復上述離心操作, 并再次進行乙醇去苯, 完成后開蓋蒸發乙醇;將Buffer ALT及蛋白酶K混入離心管, 混勻后進行消化、孵育;使用離心柱9000 r/min對其進行離心, 2 min后將廢液丟棄;加500 μl緩沖液AW1, 9000 r/min對其進行離心, 2 min后將廢液丟棄;加500 μl緩沖液AW2, 9000 r/min對其進行離心, 2 min后將廢液丟棄;加入ATE靜置2 min, 再離心處理;處理完畢后管內剩余液體置于-20℃環境下保存[2]。
1. 3 DNA產物評價
1. 3. 1 DNA濃度及純度 利用紫外分光光度計評價提取物DNA濃度及其純度。
1. 3. 2 PCR可行性 對提取出的DNA進行PCR擴增(實驗組使用DNA原液, 對照組DNA濃度65 ng/μl);反應溫度:預變性95℃, 變性95℃, 退火60℃;反應時間:預變性7 min, 變性45 s, 退火45 s;經循環35次后對其進行電泳處理, 并經BIO-RAD系統對兩組DNA質量進行分析。
2 結果
2. 1 提取物DNA濃度及純度評價 實驗組在小組織標本中提取DNA的濃度及純度均低于對照組;實驗組在大組織標本中提取DNA的濃度及純度與對照組比較無顯著差異。
2. 2 PCR可行性對比分析 對照組中提取的DNA擴增后可達到500 bP以上,實驗組中不同組織提取的DNA擴增產物大小不同,其中宮頸組織可達300 bp,其余組織則在400 bp以上。見圖1。
3 討論
隨著科學技術的持續發展及醫療水平的不斷進步, 石蠟包埋組織因其具有便于運輸儲存、交叉污染少等優點, 被廣泛應用于臨床病理工作中[3-6]。在進行分子病理檢測時提取DNA的方法中, 酚-氯仿法應用較早, 但因其操作過程復雜, 且對人體有損害等缺點, 目前已逐漸被離心柱法所代替[3]。離心柱法對操作者要求相對較低, 且得到的DNA質量較高, 但檢測過程中因為需要對組織進行消化, 操作步驟較多, 所以檢測所需時間較長, 且在操作過程中換管頻繁, 增加了標本污染的可能性[4]。如何能夠在保證DNA提取質量的情況下縮短操作時間, 成為了研究的熱點問題之一。
石蠟包埋組織DNA快速提取法無需應用有毒試劑, 如二甲苯、氯仿等, 能夠更好地保障檢測人員的身體健康及生命安全[7-11];采用離心管, 不但較通常所應用的PCR管方便許多, 而且可有效降低交叉污染的可能性, 從而提高DNA提取質量;將加熱溫度設置為95℃, 可有效避免過高的溫度所造成的試管爆炸, 大大提高操作安全性[12-14]。石蠟包埋組織在處理過程當中, 會經過甲醛固定以及脫水等步驟, 在進行分子病理檢測之前已放置了一定的時間, 所以DNA斷裂情況較為常見。有研究結果表明, DNA快速提取法所得到的DNA完全可用于PCR擴增[5]。為進一步探討分析石蠟包埋組織DNA快速提取法應用于分子病理檢測價值, 本實驗對石蠟包埋組織進行了分組實驗研究。
本實驗研究結果顯示, 實驗組在小組織標本中提取DNA的濃度及純度均低于對照組;實驗組在大組織標本中提取DNA的濃度及純度與對照組比較無顯著差異。對照組中提取的DNA擴增后可達到500 bp以上, 實驗組擴增產物則在400 bp以上。endprint
綜上所述, 使用石蠟包埋組織DNA快速提取法所提取的DNA, 雖然在小組織中DNA濃度及純度相對較低, 但完全可滿足分子病理檢測所需的條件, 而且該方法擁有方便、快速、經濟等優點, 具有顯著的優勢, 可在臨床上推薦與應用。
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[收稿日期:2017-06-02]endprint