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應(yīng)用實時熒光定量PCR法進行急性呼吸道傳染病病原的篩查分析

2017-04-18 03:33:52楊國松
醫(yī)學(xué)信息 2017年4期
關(guān)鍵詞:應(yīng)用

楊國松

摘要:目的 對于實時熒光定量PCR法在急性呼吸道傳染病病源篩查中的應(yīng)用情況進行分析研究。方法 選取2015年6月~2016年6月在我院進行治療的發(fā)熱伴呼吸道癥狀患者130例作為本次研究對象,對130份發(fā)熱伴呼吸道癥狀病例咽拭子標(biāo)本,采用實時熒光定量PCR法實施五類常見呼吸道病毒和其亞型的檢測以及鑒定,并分析在急性呼吸道傳染病病原篩查中應(yīng)用實時熒光定量PCR法的意義。結(jié)果 在對130份咽拭子標(biāo)本實施實時熒光定量PCR法進行分析實驗以后,共篩查出甲型流感病毒陽性標(biāo)本66份(50.77%),乙型流感病毒陽性標(biāo)本8份(6.15%),腺病毒陽性標(biāo)本4份(3.08%),并未檢出呼吸道合胞病毒、副流感病毒以及冠狀病毒。結(jié)論 應(yīng)用實時熒光定量PCR法在急性呼吸道傳染病病原的篩查中,可以發(fā)揮出快速準(zhǔn)確以及較強特異性的優(yōu)勢,對急性呼吸道傳染病的預(yù)防和控制具有重要的預(yù)測作用。因此,值得將此種方式在臨床急性呼吸道傳染病病源篩查中廣泛的應(yīng)用實踐。

關(guān)鍵詞:實時熒光定量PCR法;急性呼吸道傳染病;病源篩查;應(yīng)用

呼吸道傳染病的流行具有隱蔽性以及突發(fā)性,其傳播的途徑較多,可以在人-人、人-動物、動物-動物之間進行傳播。生活中,呼吸道傳染病的活動性較大,同時較為集中,一旦產(chǎn)生呼吸道傳染病,就會對人們的正常生活以及工作造成嚴(yán)重的影響,降低生活質(zhì)量,嚴(yán)重者可對生命安全造成直接威脅。根據(jù)相關(guān)的研究資料結(jié)果顯示,急性呼吸道感染具有超過百分之九十的比例是因為病毒所導(dǎo)致,并且最常見的就是呼吸道病毒,所以采取科學(xué)有效的管理以及防控舉措尤為重要。本研究將實時熒光定量PCR法應(yīng)用于急性呼吸道傳染病病源篩查中,觀察及分析了應(yīng)用的效果,報告如下。

1 資料與方法

1.1一般資料 對2015年6月~2016年6月的130例發(fā)熱伴呼吸道癥狀患者采集的咽拭子標(biāo)本進行篩查分析。標(biāo)本源均排除其他流行病學(xué)接觸史,年齡在20~65歲,平均年齡(42.6±1.2)歲,其中78個標(biāo)本源自男性患者,52個標(biāo)本源自女性患者。

1.2方法 本研究應(yīng)用的儀器實時熒光定量PCR擴增儀為美國ABI公司 7500,試劑為賽默飛世爾公司 PureLinkTMViral RNA/DNA Mini Kit 病毒核酸提取試劑盒。TaKaRa 公司的One Step PrimeScript TM RT - PCR Kit擴增試劑盒,其擴增用的引物、探針序列得到WHO的推薦,并且為引物合成公司合成[1]。

首先,對嚴(yán)格遵循無菌技術(shù)從發(fā)熱病例采集的咽拭子標(biāo)本做好標(biāo)識并詳細記錄;其次,實施核酸提取。應(yīng)用核酸提取試劑盒于潔凈區(qū)內(nèi)二級生物安全柜內(nèi)實施標(biāo)本RNA的提取;最后展開呼吸道病毒的篩查和鑒定,具體如下:①反應(yīng)體系和處理:嚴(yán)格遵循試劑盒的說明書要求進行試劑準(zhǔn)備,并且待測的標(biāo)本均分別檢測甲型流感病毒、乙型流感病毒、腺病毒以及呼吸道合胞病毒、副流感病毒、冠狀病毒。將處理好的待測樣本RNA 4 μl加入到事先準(zhǔn)備好的反應(yīng)液內(nèi),各反應(yīng)板做好質(zhì)控對照,并每批次設(shè)置一組陽性對照,以及各份樣品都實施內(nèi)參對照的設(shè)置[2]。制定檢測管終體積在20 μl,于蓋緊管蓋以后進行混勻和瞬時低速離心;②基因擴增:于擴增儀上,展開實時熒光定量PCR反應(yīng),設(shè)定擴增循環(huán)參數(shù)為:以42 ℃、5 min,95 ℃、10 s,1個循環(huán)作為第一階段,并實施逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng);以95 ℃、5 s,60 ℃、20 s,40個循環(huán)作為第二階段,并展開PCR擴增反應(yīng)。于60 ℃期間,對熒光進行采集,羧基熒光素通道為檢測通道,在進行加樣以后再上機實施PCR擴增反應(yīng)[3];③分析結(jié)果:在反應(yīng)結(jié)束后,實時熒光定量PCR擴增儀會顯示各個樣品0~40個循環(huán)數(shù)內(nèi)的相對熒光強度曲線圖,針對圖像調(diào)節(jié)擴增基線的起始值以及終止值和閾值(Ct)進行分析,如果Ct值在37.0或者以下,則反應(yīng)呈現(xiàn)出陽性結(jié)果,如果不具有Ct值、Ct值等于0,則反應(yīng)呈陰性,灰區(qū)的標(biāo)準(zhǔn)為Ct值在37.0~40.0。在點擊Analysis后,儀器進行結(jié)果分析并顯示分析結(jié)果的報告頁面。

2 結(jié)果

在實施檢測以后,在130份發(fā)熱伴呼吸道癥狀的咽拭子標(biāo)本中,共檢測到了共篩查出甲型流感病毒陽性標(biāo)本66份(50.77%),乙型流感病毒陽性標(biāo)本8份(6.15%),腺病毒陽性標(biāo)本4份(3.08%),并未檢出呼吸道合胞病毒、副流感病毒以及冠狀病毒。

3 討論

由病毒所導(dǎo)致的急性呼吸道感染,病毒感染的臨床癥狀具有相似的表現(xiàn),并且有些病毒常常容易導(dǎo)致世界范圍內(nèi)的大流行,其中呼吸道病毒感染更是容易引發(fā)較高死亡率[4]。所以,做到及時準(zhǔn)確的識別呼吸道傳染病病原體,做到有效防控疾病傳播,對于患者的診療以及提升生存質(zhì)量具有重要意義。

熒光定量PCR技術(shù)具有獨特的優(yōu)勢,包含DNA探針雜交技術(shù)以及PCR兩種技術(shù),能夠經(jīng)PCR熒光信號變化情況、PCR反應(yīng)酶動力學(xué)特點,針對DNA模版獲得精準(zhǔn)的定量測定。熒光定量PCR運轉(zhuǎn)具有較為封閉的環(huán)境,能夠精簡PCR后處理以及電泳檢測環(huán)節(jié),所以此種情況也有效避免了產(chǎn)物擴增導(dǎo)致污染以及PCR不能夠定量測定和復(fù)雜的操作程序等問題[5-6]。

熒光定量PCR技術(shù)具有較高的特異性、操作便捷、能夠應(yīng)用特定低純度標(biāo)本,同時靈敏度較高,將現(xiàn)有技術(shù)不能夠解決的缺陷有效克服,所以應(yīng)用的意義巨大。在本研究中,對130份發(fā)熱伴呼吸道癥狀的病例標(biāo)本應(yīng)用實時熒光定量PCR法進行呼吸道病毒的篩查和鑒定,結(jié)果顯示在所有研究對象的咽拭子標(biāo)本中,共檢測到了共篩查出甲型流感病毒陽性標(biāo)本66份(50.77%),乙型流感病毒陽性標(biāo)本8份(6.15%),腺病毒陽性標(biāo)本4份(3.08%),并未檢出呼吸道合胞病毒、副流感病毒以及冠狀病毒。結(jié)果充分表明,實時熒光定量PCR法對于急性呼吸道傳染病病原活動水平可獲得有效掌握,也因此為患者得早期防控提供了堅實的依據(jù),推廣應(yīng)用價值較大。

綜上所述,應(yīng)用實時熒光定量PCR法篩查急性呼吸道傳染病病原具有重要的作用,篩查期間可發(fā)揮優(yōu)勢具有速度快、準(zhǔn)確度高、特異性強等,所以能夠于實踐防控急性呼吸道傳染病中起到重要的應(yīng)用價值,值得大量推廣使用。

參考文獻:

[1]龐中強.實時熒光定量 PCR 法在急性呼吸道傳染病病原篩查中的應(yīng)用[J].醫(yī)藥衛(wèi)生:文摘版:00246-00246.

[2]王建華,趙祥平,董志珍,等.尼帕病毒與豬流感病毒雙重?zé)晒舛縍T-PCR方法的建立[J].動物醫(yī)學(xué)進展,2016,37(1):11-16.

[3]鄭小龍,王群,鄧明俊,等.西方馬腦炎病毒TaqMan MGB熒光定量RT-PCR檢測方法的建立[J].動物醫(yī)學(xué)進展,2016,37(1):6-10.

[4]姚秀林.實時熒光RT-PCR與細胞培養(yǎng)法在流感病毒檢測中的應(yīng)用效果觀察[J].中國醫(yī)藥指南,2016(4):47-48.

[5]隋竑弢,王大燕,舒躍龍.呼吸道病毒多病原檢測技術(shù)研究進展[J].病毒學(xué)報,2013(02).

[6]方巧云,琚雄飛,曾健君.熒光定量PCR檢測急性呼吸道感染患者常見呼吸道病毒的研究[C] 廣東省預(yù)防醫(yī)學(xué)會優(yōu)秀論文集.2014.

編輯/安樺

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