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上皮性卵巢癌患者SET8基因3′非翻譯區(qū)rs16917496位點單核苷酸多態(tài)性觀察

2017-04-05 16:01:19李騰華史淑紅梁文娟李艷芳
山東醫(yī)藥 2017年39期

李騰華,史淑紅,梁文娟,李艷芳

(河北醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院,石家莊050000)

上皮性卵巢癌患者SET8基因3′非翻譯區(qū)rs16917496位點單核苷酸多態(tài)性觀察

李騰華,史淑紅,梁文娟,李艷芳

(河北醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院,石家莊050000)

目的觀察上皮性卵巢癌患者SET8基因3′非翻譯區(qū)rs16917496位點單核苷酸多態(tài)性變化,并探討其與患者預(yù)后的關(guān)系。方法選取100例上皮性卵巢癌患者為病例組,100例健康體檢者為對照組,檢測并比較兩組受檢者SET8基因3′非翻譯區(qū)rs16917496位點單核苷酸多態(tài)性。將病例組患者按基因型分組,對各亞組進行生存分析,比較各組3年生存率。結(jié)果病例組基因型CC型5例、CT型52例、TT型43例,等位基因C頻率31%、T頻率69%。對照組基因型CC型13例、CT型38例、TT型49例,等位基因C頻率32%、T頻率68%。兩組CC、CT基因型構(gòu)成比相比,P均<0.05;TT基因型構(gòu)成比相比,P>0.05;兩組中 T、C等位基因頻率無統(tǒng)計學(xué)差異(χ2=0.046,P=0.830)。病例組SET8基因3′非翻譯區(qū)rs16917496位點基因型為CC、CT、TT患者3年生存率分別為 80%(4/5)、74.1%(40/54)、58.5% (24/41),三種基因型患者3年生存率相比,P>0.05。結(jié)論上皮性卵巢癌患者SET8基因3′非翻譯區(qū)rs16917496位點基因型CC構(gòu)成比低于正常女性。SET8基因3′非翻譯區(qū)rs16917496位點基因型為CC、CT、TT的上皮性卵巢癌患者3年生存率相近。

SET8基因;單核苷酸多態(tài)性;卵巢腫瘤;上皮性卵巢癌

SET8基因又稱為SETD8、PR-SET7或KMT5a,編碼組蛋白 H4賴氨酸 20 單甲基轉(zhuǎn)移酶,這種酶通過甲基化組蛋白進而調(diào)節(jié)基因的轉(zhuǎn)錄、細胞的生長周期及腫瘤的發(fā)生發(fā)展[1,2]。SET8 基因3′非翻譯區(qū)(3′UTR)的 miR-502 結(jié)合區(qū)域內(nèi)存在rs16917496 位點單核苷酸多態(tài)性(SNP),以往研究發(fā)現(xiàn)該位點單核苷酸多態(tài)性與肺癌[3]、白血病[4,5]、肝癌[6]、乳腺癌[7]等多種腫瘤的發(fā)生、發(fā)展相關(guān),但是其與上皮性卵巢癌發(fā)生及預(yù)后的關(guān)系尚不明確。本研究觀察了上皮性卵巢癌患者SET8基因3′非翻譯區(qū)rs16917496位點SNP,并探討其與預(yù)后的關(guān)系?,F(xiàn)報告如下。

1 資料與方法

1.1 臨床資料 選取2008年1月~2012年12月收治的100例上皮性卵巢癌患者為病例組,患者年齡12~76歲。均經(jīng)術(shù)后病理檢查證實為上皮性卵巢癌,臨床分期Ⅰ期18例、Ⅱ期24例、Ⅲ期50例、Ⅳ期8例?;颊咝g(shù)前均未接受任何治療。另選同期體檢且年齡匹配的健康女性100例為對照組。本研究已獲我院醫(yī)學(xué)倫理委員會批準(zhǔn),患者均已簽署知情同意書。

1.2 SET8 基因3′UTR rs16917496位點SNP觀察 病例組患者術(shù)前、對照組患者體檢時抽取外周血3 mL,按照DNA提取試劑盒說明書操作提取基因組DNA,用分光光度計測算DNA的濃度及純度,取A260 nm/A280 nm為1.8~2.0的樣品用于后續(xù)實驗。登陸NCBI 數(shù)據(jù)庫(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/)查找SET8 基因 3′UTR rs16917496 位點的核苷酸序列,設(shè)計 PCR 擴增引物。上 游 引 物 為 :5′-CCTGGTCAGTGGTCAGCAAAT-3′,下 游 引 物 為 : 5′-CTGGGAAACACGCTCAAAATC-3′。根據(jù)預(yù)實驗確定PCR最佳反應(yīng)條件及反應(yīng)體系,反應(yīng)體系:Dream Taq Green Master Mix 12.5 μL,上游引物( 10 μmol/L) 1 μL, 下游引物( 10 μmol/L) 1 μL, DNA模板 2 μL, 無核酸水8.5 μL。反應(yīng)條件: 94 ℃、3 min, 94 ℃、30 s , 60 ℃、30 s , 72 ℃、40 s, 72 ℃、3 min。共38個循環(huán)。取5 μL PCR 產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,觀察有無清晰條帶,如有清晰條帶則可說明樣品成功擴增,若無清晰條帶則更改PCR條件重新擴增。將擴增成功的 PCR 產(chǎn)物及上下游引物一起送往上海生工生物工程技術(shù)有限公司進行測序,得到每例受檢者的基因型。

1.3 隨訪方法 病例組患者術(shù)后均采用電話隨訪3年,無失訪者。

1.4 統(tǒng)計學(xué)方法 采用 SPSS 21.0 統(tǒng)計軟件。病例組和對照組基因型和等位基因頻率比較采用χ2檢驗和 Fisher 確切概率法。將病例組患者按基因型分為CC、CT、TT組,采用Kaplan-Meier法進行生存分析,并計算SET8基因3′非翻譯區(qū)rs16917496位點不同基因型患者3年生存率。P<0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

2 結(jié)果

病例組基因型CC型5例、CT型52例、TT型43例,等位基因C頻率31%、T頻率69%。對照組基因型CC型13例、CT型38例、TT型49例,等位基因C頻率32%、T頻率68%。兩組CC、CT基因型構(gòu)成比相比,P均<0.05;TT基因型構(gòu)成比相比,P>0.05;兩組 T、C等位基因頻率相比,P>0.05。

隨訪3年,病例組32例患者死亡。病例組CC、CT、TT基因型患者3年生存率分別為80%(4/5)、74.1%(40/54)、58.5%(24/41),各基因型的患者3年生存率相比,P>0.05。

3 討論

卵巢癌是惡性程度最高的女性生殖系統(tǒng)腫瘤,根據(jù)2016年美國癌癥統(tǒng)計報告,卵巢癌仍位居婦科腫瘤死因首位[8],由于早期診斷困難、高復(fù)發(fā)率以及復(fù)發(fā)性卵巢癌難以治療等原因,卵巢癌患者的預(yù)后很差,70%的晚期卵巢癌患者5年生存率不足30%[9]。而上皮性卵巢癌占卵巢癌的80%以上。目前,對于復(fù)發(fā)性卵巢癌患者仍缺乏有效的治療手段,治療目的主要在于盡量延長無進展生存期(PFS),主要的治療方法仍是腫瘤細胞減滅術(shù)和化療。隨著腫瘤發(fā)病機制研究的逐步深入,分子靶向治療也不斷取得新的進展。

miRNA是一類高度保守的小分子非編碼RNA,可作為癌基因或抑癌基因調(diào)節(jié)多種基因的表達[10]。最近的研究表明,SNP或突變的miRNA結(jié)合位點可能通過改變miRNAs的表達而影響腫瘤的發(fā)病風(fēng)險和結(jié)局[11]。Yu等[12]通過病例對照研究發(fā)現(xiàn)了12個在人類多種腫瘤中等位基因頻率異常的miRNA 結(jié)合位點SNP,SET8基因 miR-502 結(jié)合位點就是其中之一。Yang等[13]通過研究發(fā)現(xiàn),SET8基因3′UTR多態(tài)性位點rs16917496 T/T基因型提高了中國人群非小細胞性肺癌的發(fā)病率。Ding等[14]研究表明rs16917496多態(tài)性與小細胞型肺癌的發(fā)病風(fēng)險無相關(guān)性,但是,C/C+C/T基因型是小細胞型肺癌患者預(yù)后的獨立危險因素。Song等[15 ]發(fā)現(xiàn),SET8 C/C基因型能夠降低絕經(jīng)前婦女患乳腺癌的風(fēng)險,而C/C基因型和T/T基因型與絕經(jīng)后婦女患乳腺癌的風(fēng)險無明顯關(guān)聯(lián),同時還發(fā)現(xiàn),該多態(tài)位點通過調(diào)節(jié)SET8基因的表達從而導(dǎo)致乳腺癌的發(fā)病。

本研究結(jié)果顯示兩組CC、CT基因型構(gòu)成比有統(tǒng)計學(xué)差異,表明rs16917496位點基因型與上皮性卵巢癌患者的發(fā)病風(fēng)險相關(guān)。影響卵巢癌患者預(yù)后的因素非常復(fù)雜,臨床分期、組織學(xué)分級等均有可能影響患者的預(yù)后情況。本研究并未證實SET8基因3′端rs16917496位點SNP與卵巢癌患者的預(yù)后有關(guān),可能的原因包括:①由于不同原因引起的癌癥和腫瘤發(fā)展過程的多樣性導(dǎo)致該SNP可能對不同類型的腫瘤具有不同的影響;②我們的研究也有一定的局限性,比如相對較小的樣本量和部分病例缺乏完整的家族史。要想更充分地評估基因變異與腫瘤預(yù)后之間的關(guān)系,需要更大規(guī)模和更深入的研究,以獲得更確鑿的數(shù)據(jù)。

雖然我們的研究尚不能證明SET8基因3 ′非翻譯區(qū)rs16917496位點SNP可作為卵巢癌預(yù)后的參考指標(biāo),但是研究表明SNP與卵巢癌的發(fā)病風(fēng)險有一定關(guān)聯(lián),如果我們能夠更深入的研究以明確其發(fā)病機制,將會對高危人群的早期篩查及制定治療方案起著十分重要的作用。

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10.3969/j.issn.1002-266X.2017.39.015

R711.75

B

1002-266X(2017)39-0051-03

河北醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院科學(xué)研究基金(2h2201616)。

史淑紅(E-mail:sshh3095@162.com)

2017-04-20)

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