張國(guó)斌
(沈陽市疾病預(yù)防控制中心,遼寧 沈陽 110031)
瘧疾的實(shí)時(shí)熒光PCR快速檢測(cè)方法探討
張國(guó)斌
(沈陽市疾病預(yù)防控制中心,遼寧 沈陽 110031)
目的 探討瘧疾的實(shí)時(shí)熒光PCR快速檢測(cè)方法。方法 選擇本市國(guó)際旅行衛(wèi)生保健中心提供的瘧疾鏡檢陽性血樣20份,另選擇健康者(瘧疾鏡檢陰性)血樣20份作為待測(cè)血樣。本研究設(shè)計(jì)了瘧疾病原體實(shí)時(shí)熒光PCR快速檢測(cè)的引物和探針,總結(jié)了快速檢測(cè)方法,瘧疾鏡檢陽性/陰性血樣均各分為4次檢測(cè)完畢,統(tǒng)計(jì)各份血樣檢測(cè)結(jié)果和每次檢測(cè)時(shí)間,計(jì)算平均用時(shí)和瘧疾鏡檢與實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)符合率。結(jié)果 瘧疾鏡檢陽性血樣20份,檢測(cè)4次,平均用時(shí)(19.15±1.34)min,瘧疾鏡檢陰性血樣平均用時(shí)為(19.52±1.49)min,40份血樣熒光PCR檢測(cè)平均用時(shí)(19.34±1.65)min。在熒光PCR檢測(cè)與瘧疾鏡檢符合率方面,陽性血樣(100%)和陰性血樣(90.00%)比較,無顯著差異P>0.05,認(rèn)為無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。40份待測(cè)血樣熒光PCR檢測(cè)和瘧疾鏡檢符合率為95.00%(38/40)。結(jié)論 本研究瘧疾病原體實(shí)時(shí)熒光PCR快速檢測(cè)準(zhǔn)確性高,陽性檢出高,檢測(cè)時(shí)間段,用于瘧疾快速檢驗(yàn)可行性較強(qiáng),不易發(fā)生漏檢情況。
瘧疾;實(shí)時(shí)熒光;PCR;快速檢測(cè);巢式PCR
瘧疾是我國(guó)流行病防治的重點(diǎn),檢測(cè)診斷多依靠瘧原蟲形態(tài)檢查、抗體血清學(xué)檢查以及瘧原蟲體抗原檢測(cè)等方法,鏡檢是較為可靠的瘧原蟲檢測(cè)方法,但存在各種限制因素,假陰性率較高,較容易出現(xiàn)漏診情況,故需要探索一套更為靈敏、快捷的檢測(cè)方法[1]。為此,為此,本研究設(shè)計(jì)了瘧疾病原體實(shí)時(shí)熒光 PCR快速檢測(cè)的引物和探針,總結(jié)了一套快速檢測(cè)方法,選擇本市國(guó)際旅行衛(wèi)生保健中心提供的瘧疾鏡檢陽性血樣20份,另選擇健康者(瘧疾鏡檢陰性)血樣20份作為待測(cè)血樣,統(tǒng)計(jì)各份血樣檢測(cè)結(jié)果,對(duì)比分析了瘧疾鏡檢與實(shí)時(shí)熒光 PCR 檢測(cè)符合率,報(bào)道如下。
1.1 一般資料:選擇本市國(guó)際旅行衛(wèi)生保健中心提供的瘧疾鏡檢陽性血樣20份,另選擇健康者(瘧疾鏡檢陰性)血樣20份作為待測(cè)血樣。40份血樣均為靜脈血,采用真空采血管(2%EDTA-Na2抗疑)采血,在本實(shí)驗(yàn)室按要求(20 ℃)保存。
1.2 試劑及DNA提取:本單位采用Qiagen公司全血DNA提取試劑盒和熒光PCR試劑。按QIAamp DNA Blood Extraction Minikit提取瘧原蟲DNA并低溫保存。
1.3 引物設(shè)計(jì)合成:惡性瘧、間日瘧、三日瘧和卵形瘧的SSU rRNA基因的引物和探針,由上海生工生物工程公司合成,包括實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)的引物、探針。各引物擴(kuò)增參數(shù)為:Plas-FP 、Plas-RP和Plas-Pro擴(kuò)增長(zhǎng)度73 bp;rPLUout-FP和rPLUout-RP擴(kuò)增長(zhǎng)度1815 bp;rPLUin-FP和rPLUin-RP擴(kuò)增長(zhǎng)度240 bp。使用TaqMan體系配置行熒光PCR檢測(cè),58 ℃收集熒光,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳,隨后進(jìn)行擴(kuò)增產(chǎn)物電泳分析,凝膠成像系統(tǒng)結(jié)果拍照并分析。
1.4 研究方法:瘧疾鏡檢陽性血樣20份,每次檢測(cè)5份,共分為4次檢測(cè)完畢,統(tǒng)計(jì)各份血樣檢測(cè)結(jié)果和每次檢測(cè)時(shí)間,計(jì)算平均用時(shí)。瘧疾鏡檢陰性血樣處理方法同上。統(tǒng)計(jì)瘧疾鏡檢與實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)符合率。
1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法:采用SPSS20.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件分析研究數(shù)據(jù),計(jì)量資料采用t檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料采用χ2檢驗(yàn),P<0.05認(rèn)為差異顯著,有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 瘧疾實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)時(shí)間:瘧疾鏡檢陽性血樣20份,檢測(cè)4次,用時(shí)為18~20 min,平均 (19.15±1.34)min。瘧疾鏡檢陰性血樣20份,檢測(cè)4次,用時(shí)為18~21 min,平均 (19.52±1.49)min。瘧疾鏡檢陰性血樣和瘧疾鏡檢陽性血樣熒光 PCR檢測(cè)時(shí)間無明顯差異P>0.05,40份血樣熒光PCR檢測(cè)平均用時(shí)(19.34±1.65)min,約為20 min。
2.2 瘧疾實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)結(jié)果與鏡檢比較:瘧疾鏡檢陽性血樣20份中,熒光PCR檢測(cè)陽性20份,熒光PCR檢測(cè)和瘧疾鏡檢符合率為100%(20/20)。瘧疾鏡檢陰性血樣20份中,熒光PCR檢測(cè)陰性為18份,檢出陽性2份,熒光PCR檢測(cè)和瘧疾鏡檢符合率為90.00%(18/20)。在熒光PCR檢測(cè)與瘧疾鏡檢符合率方面,陽性血樣(100%)和陰性血樣(90.00%)比較,無顯著差異P>0.05,認(rèn)為無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。40份待測(cè)血樣熒光PCR檢測(cè)和瘧疾鏡檢符合率為95.00%(38/40)。
我國(guó)并非瘧疾疫區(qū)國(guó)家,但是近年來我國(guó)勞動(dòng)力輸出增多,較多瘧疾疫區(qū)生活人員往來于我國(guó)境內(nèi),因而必須有效控制瘧疾的傳入。國(guó)境口岸等單位是負(fù)責(zé)瘧疾檢測(cè)工作的主要部門,需要應(yīng)對(duì)各類瘧疾檢測(cè),但傳統(tǒng)瘧原蟲形態(tài)檢查、抗體血清學(xué)檢查以及瘧原蟲體抗原檢測(cè)等方法,存在耗時(shí)長(zhǎng)或一次檢測(cè)數(shù)量有限等問題,影響了瘧疾病原體檢測(cè)效率。為此,應(yīng)更為快捷、準(zhǔn)確的瘧疾檢測(cè)系統(tǒng)[2]。
近年來,基因擴(kuò)增技術(shù)趨于成熟,因而應(yīng)探索該方法在瘧原蟲基因檢測(cè)方面的優(yōu)勢(shì)性。為此,本次研究基于各類瘧疾病原體的SSU rRNA基因序列,設(shè)計(jì)了熒光PCR快速檢測(cè)的引物和探針,形成了一套通用型實(shí)時(shí)熒光PCR快速檢測(cè)方法。實(shí)時(shí)熒光PCR快速檢測(cè)時(shí)間較短,本次研究40份血樣熒光PCR檢測(cè)平均用時(shí)(19.34±1.65)min,約為20 min,可知其檢測(cè)速度較快,檢測(cè)效率明顯提升。當(dāng)前,國(guó)內(nèi)對(duì)實(shí)時(shí)熒光PCR快速檢測(cè)逐漸增多,但是對(duì)于快速檢測(cè)的準(zhǔn)確性仍存在一定的爭(zhēng)議,尚無可靠論據(jù)[3]。本次研究對(duì)比分析了瘧疾鏡檢陽性血樣與陰性血樣的熒光PCR快速檢測(cè)結(jié)果,發(fā)現(xiàn)鏡檢陽性血樣熒光PCR檢測(cè)和瘧疾鏡檢符合率達(dá)到了100%(20/20),而瘧疾鏡檢陰性血樣20份中,熒光PCR檢測(cè)陰性為18份,熒光PCR檢測(cè)和瘧疾鏡檢符合率為90.00%,瘧疾鏡檢陽性血樣與陰性血樣的熒光PCR快速檢測(cè)結(jié)果無顯著差異,40份待測(cè)血樣熒光PCR檢測(cè)和瘧疾鏡檢符合率高達(dá)95.00%(38/40),可知熒光PCR快速檢測(cè)結(jié)果較為準(zhǔn)確、可靠,提示該快速檢測(cè)方法實(shí)驗(yàn)室應(yīng)用價(jià)值較高。但是本次研究在對(duì)比陰/陽血樣熒光PCR快速檢測(cè)結(jié)果中也發(fā)現(xiàn),雖然鏡檢陽性血樣熒光PCR檢測(cè)和瘧疾鏡檢符合率較高,但是瘧疾鏡檢陰性血樣20份中,檢出陽性2份,存在一定的假陽性概率,而無假陰性血樣,提示在熒光PCR快速檢測(cè)中應(yīng)對(duì)陽性病例,再次實(shí)施瘧疾鏡檢,以排除假陽性病例,保證檢測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確性。當(dāng)前,熒光PCR快速檢測(cè)技術(shù)快速發(fā)展,多數(shù)通用熒光PCR快速檢測(cè)設(shè)備已經(jīng)可以完成1次90份以上的檢測(cè)量,基本可以滿足國(guó)境口岸等單位大規(guī)模檢測(cè)的需求,對(duì)于我國(guó)瘧疾防控工作具有重要意義。
綜上所述,本研究瘧疾病原體實(shí)時(shí)熒光PCR快速檢測(cè)準(zhǔn)確性高,陽性檢出高,檢測(cè)時(shí)間段,用于瘧疾快速檢驗(yàn)可行性較強(qiáng),不易發(fā)生漏檢情況。
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