維生素D受體基因 rs2222570位點多態性與結核發病相關性的meta分析*

石 潔，朱巖昆，鄭丹薇，馬曉光，王少華，李 輝，邢 進，吳彩霞

河南省疾病預防控制中心 鄭州 450016

?

維生素D受體基因 rs2222570位點多態性與結核發病相關性的meta分析*

石 潔，朱巖昆，鄭丹薇，馬曉光，王少華，李 輝，邢 進#，吳彩霞

河南省疾病預防控制中心 鄭州 450016

#通信作者，女，1966年6月生，碩士，主任醫師，研究方向：結核病的防控，E-mail：hncdcxj@163.com

結核病；維生素D受體基因；rs2222570；meta分析

目的：判斷維生素D受體(VDR)基因rs2222570位點多態性與結核發病風險的關聯性。方法：用關鍵詞“維生素D受體多態性”和“結核病”搜索數據庫中相關研究，根據各研究間的異質性，使用隨機或固定效應模型進行meta分析。最終有20篇文獻納入研究。對基因型以及合并后產生的遺傳模型和等位基因多態性與結核發病的相關性進行分析。結果：F 等位基因攜帶者結核發病風險降低(OR=0.84，95%CI=0.73～0.95)； 顯性模型遺傳模式降低結核發病風險(OR=0.74，95%CI=0.60～0.92)。結論：VDR基因rs2222570位點多態性與結核發病風險有關。

中國作為結核病高負擔國家，每年有100萬人發病。結核桿菌攜帶者中只有十分之一發病[1]，這表明結核病的發病情況受到環境和遺傳因素交互作用的影響。目前已有很多學者[2-7]對結核病候選基因的多態性進行了研究，尤其是維生素D受體(vitamin D receptor，VDR)基因。人體內維生素D3缺乏會增加結核病易感性[8-9]，因為維生素D3的活性代謝物二羥維生素D可幫助單核吞噬細胞抑制胞內結核桿菌的生長[10-11]。而VDR基因遺傳因子的改變會對二羥維生素D的細胞學功能產生影響。近年來國內外學者針對VDR基因rs2222570位點與結核病的關系展開了系列研究，但結果存在分歧。因此作者對該位點多態性與結核發病進行了系統綜述，以期對VDR基因rs2222570位點多態性與結核易感性之間的關系得出更系統和針對性的結論。

1 材料與方法

1.1 文獻檢索 英文文獻來源為Pubmed數據庫、谷歌學術、Springer、Wiley、Elsevier S全文數據庫;檢索詞為tuberculosis、vitamin D、polymorphism、vitamin D receptor，或者 tuberculosis、vitamin D、vitamin D receptor、SNP。中文文獻來源為CNKI、萬方醫學網、維普數據庫；檢索詞為結核病、維生素D、維生素D受體、多態性，或者為結核病、維生素D、維生素D受體、SNP。

1.2 文獻納入和排除標準 納入標準：①國內外公開發表的關于結核病和VDR基因rs2222570位點多態性的文獻。②所有病例均符合WTO結核病診斷標準。③研究設計為病例對照研究。④研究中有等位基因、基因型頻率的具體數據。⑤研究對象對照組的基因型頻率符合Hardy-Weinberg平衡。排除標準：①綜述和評論。②重復發表的文獻。③研究類型不屬于病例對照研究。④未設立對照組，只針對結核病發病情況的研究。⑤其他位點的研究。⑥資料不完整、數據描述不清楚的文獻。⑦對照組基因型不符合Hardy-Weinberg平衡。⑧文獻所在雜志級別較低。

1.3 統計學處理 用Revman 5.3軟件對數據進行統計處理和分析。效應變量選擇OR值。用基于χ2的Q檢驗統計量和I2進行異質性檢驗；若存在異質性，使用隨機效應模型；若存在較小的異質性，用固定效應模型。繪制漏斗圖進行發表偏倚評估，同時對所納入的數據用Stata 12.0進行Begg's和Egger's線性回歸檢驗。

2 結果

2.1 文獻檢索結果 根據檢索策略，初步檢索到英文文獻521篇，中文文獻258篇。通過閱讀中文題目和摘要，排除720篇，篩選出59篇文獻。認真閱讀全文按照納入和排除標準進行審核，排除33篇文獻。對納入的26篇文獻的對照組進行Hardy-Weinberg平衡檢驗，排除6篇，最終納入20篇文獻進行meta分析(表1)。共計包括結核病患者4 896例和健康對照6 057例。

表1 納入文獻基本信息

2.2 基因型分析 結果見表2。VDR基因 rs2222570位點基因型與結核病發病無統計學關聯(表2)。Begg's 檢驗和Egger's檢驗結果表明不存在明顯的發表偏倚。

表2 VDR基因 rs2222570位點基因型與結核病發病相關性的meta分析結果

2.3 遺傳模型分析 見圖1～3、表3。結果表明，顯性模型與結核發病有關，Begg's 檢驗和Egger's檢驗結果表明不存在明顯的發表偏倚。

圖1 VDR基因 rs2222570位點顯性模型與結核發病關聯的森林圖

圖2 VDR基因 rs2222570位點隱性模型與結核發病關聯的森林圖

圖3 VDR基因 rs2222570位點超顯性模型與結核發病關聯的森林圖表3 VDR基因 rs2222570位點多態性與結核發病相關性的meta分析結果

異質性來源異質性檢驗PI2統計模型OR(95%CI)Begg's檢驗ZPEgger's檢驗tP顯性模型<0.00182%隨機效應模型0.74(0.60～0.92)0.450.65-1.950.07隱性模型<0.00165%隨機效應模型1.28(0.98～1.69)0.060.94-0.850.08超顯性模型0.850%固定效應模型0.95(0.88～1.02)0.520.60-0.940.06

2.4 等位基因分析 因存在明顯異質性(I2=73%，P<0.001)，故采用隨機效應模型，森林圖見圖4。VDR基因 rs2222570位點等位基因F與結核發病有關(OR=0.84，95%CI=0.73～0.95，P=0.007)。結合顯性模型的結果說明，F為結核發病的保護因素。Begg's 檢驗(Z=0.32，P=0.75)和Egger's檢驗(t=1.90，P=0.07)結果表明不存在明顯的發表偏倚。

圖4 VDR基因 rs2222570位點等位基因F與結核發病關聯的森林圖

2.5 敏感性分析 每次去除一個研究，然后計算剩余研究的合并OR值，進行敏感性分析。結果表明去除任一研究均不改變meta分析最終結局，只是對合并OR值大小略有影響,說明表明meta分析結果可靠和穩定。

3 討論

據WTO統計，目前結核桿菌感染者約占全球總人口的1/3，每天約有8 000人死于結核病，每年約有300萬人死于結核病。

作者對VDR受體基因rs2222570位點多態性與結核發病的關系進行了meta分析，結果表明兩者存在相關性，該位點的F等位基因為結核發病的保護因素。Selvaraj等[6]2004年的研究也表明該位點FF通過調節維生素D的免疫協調機制增加了VDR受體的表達。在我國，蘇倩等[29]對重慶地區人群的研究結果表明Fok I -ff基因型、吸煙及結核病患者接觸史在結核發病中存在明顯的交互作用。Liu等[13]進行的研究結果表明結核病患者較健康對照存在更高的ff基因型頻率。 Wilkinson等[12]研究認為該位點突變為T不會增加結核病的發病風險。Bornman等[20]認為VDR受體FokI RFLP 與結核的發病沒有相關性。馮福民等[30]對唐山人群的研究亦未發現VDR基因型與肺結核發病有關。楊本付等[31]對6篇國外文獻進行meta分析，結果亦表明尚不能認為VDR基因多態性是肺結核易感性的影響因素。

Meta分析中異質性產生的原因主要有臨床異質性、方法學異質性和統計學異質性。此次Meta分析顯示個別研究存在較大異質性。入選文獻涉及的地域、 種族差異較大，性別和年齡分布不同，這些因素均能解釋異質性較大的問題。今后可對地域和種族進行分層， 對性別和年齡進行校正后進一步分析。

發表偏倚是影響meta分析質量的一個很重要的因素。雖然VDR受體基因rs2222570位點的FF和ff、Ff和ff以及隱性基因模型存在發表偏倚，但在顯性模型和等位基因與結核病的相關性方面發表偏倚并不明顯。

此外，該研究仍存在以下局限性：①篩選的文章均為中英文發表的原始文獻，未納入其他語種，存在語言上的局限性。②納入文獻的基因檢測方法不完全一致，可能導致實驗結果存在偏倚。③納入的原始文獻數量有限，樣本量偏小。

綜上所述，該研究結果表明，VDR基因rs2222570位點F等位基因是結核發病的保護因素。

[1]WHO.Global Tuberculosis Control Report 2010:summary[J].Cent Eur J Public Health,2010,18(4):237

[2]FERNANDO SL,SAUNDERS BM,SLUYTER RA,et al.A polymorphism in the P2X(7) gene increases susceptibility to extrapulmonary tuberculosis[J].Am J Respir Crit Care Med,2007,175(4):360

[3]BELLAMY R,RUWENDE C,CORRAH T,et al.Tuberculosis and chronic hepatitis B virus infection in Africans and variation in the vitamin D receptor gene[J].J Infect Dis,1999,179(3):721

[4]LEWIS S,BAKER I,DAVEY SMITH G,et al.Meta-analysis of vitamin D receptor polymorphisms and pulmonary tuberculosis risk[J].Int J Tuberc Lung Dis,2005,9(10):1174

[5]ROTH DE,SOTO G,ARENAS F,et al.Association between vitamin D receptor gene polymorphisms and response to treatment of pulmonary tuberculosis[J].J Infect Dis,2004,190(5):920

[6]SELVARAJ P,CHANDRA G,JAWAHAR MS,et al.Regulatory role of vitamin D receptor gene variants of Bsm I, Apa I, Taq I, and Fok I polymorphisms on macrophage phagocytosis and lymphoproliferative response to mycobacterium tuberculosis antigen in pulmonary tuberculosis[J].J Clin Immunol,2004,24(5):523

[7]WILBUR AK,KUBATKO LS,HURTADO AM,et al.Vitamin D receptor gene polymorphisms and susceptibility M.tuberculosis in native Paraguayans[J].Tuberculosis (Edinb),2007,87(4):329

[8]DAVIES PD.Tuberculosis and migration. The Mitchell Lecture 1994[J].J R Coll Physicians Lond,1995,29(2):113

[9]WILKINSON RJ,PASVOL G.Tuberculosis, HIV, hormones and children[J].J R Coll Physicians Lond,1995,29(2):86

[10]ROCKETT KA,BROOKES R,UDALOVA I,et al.1,25-Dihydroxyvitamin D3 induces nitric oxide synthase and suppresses growth of mycobacterium tuberculosis in a human macrophage-like cell line[J].Infect Immun,1998,66(11):5314

[11]ROOK GA,STEELE J,FRAHER L,et al.Vitamin D3,gamma interferon,and control of proliferation of Mycobacterium tuberculosis by human monocytes[J].Immunology,1986,57(1):159

[12]WILKINSON RJ,LLEWELYN M,TOOSSI Z,et al.Influence of vitamin D deficiency and vitamin D receptor polymorphisms on tuberculosis among Gujarati Asians in West London:a case-control study[J].Lancet,2000,355(924):618

[13]LIU W,CAO WC,ZHANG CY,et al.VDR and NRAMP1 gene polymorphisms in susceptibility to pulmonary tuberculosis among the Chinese Han population: a case-control study[J].Int J Tuberc Lung Dis,2004,8(4):428

[14]SELVARAJ P,CHANDRA G,KURIAN SM,et al.Association of vitamin D receptor gene variants of BsmI, ApaI and FokI polymorphisms with susceptibility or resistance to pulmonary tuberculosis[J].Curr Sci,2003,84(12):1564

[15]FITNESS J,FLOYD S,WARNDORFF DK,et al.Large-scale candidate gene study of tuberculosis susceptibility in the Karonga district of northern Malawi[J].Am J Trop Med Hyg,2004,71(3):341

[16]SELVARAJ P,PRABHU ANAND S,HARISHANKAR M,et al.Plasma 1,25 dihydroxy vitamin D3 level and expression of vitamin d receptor and cathelicidin in pulmonary tuberculosis[J].J Clin Immunol,2009,29(4):470

[17]OLESEN R,WEJSE C,VELEZ DR,et al.DC-SIGN (CD209), pentraxin 3 and vitamin D receptor gene variants associate with pulmonary tuberculosis risk in West Africans[J].Genes Immun,2007,8(6):456

[18]SHARMA PR,SINGH S,JENA M,et al.Coding and non-coding polymorphisms in VDR gene and susceptibility to pulmonary tuberculosis in tribes, castes and Muslims of Central India[J].Infect Genet Evol,2011,11(6):1456

[19]BABB C,VAN DER MERWE L,BEYERS N,et al.Vitamin D receptor gene polymorphisms and sputum conversion time in pulmonary tuberculosis patients[J].Tuberculosis (Edinb),2007,87(4):295

[20]BORNMAN L,CAMPBELL SJ,FIELDING K,et al.Vitamin D receptor polymorphisms and susceptibility to tuberculosis in West Africa: a case-control and family study[J].J Infect Dis,2004,190(9):1631

[21]黃莉芳,姜偉,王群剛,等.維生素D 及其受體基因遺傳多態與結核病發病風險的關聯研究[J].中華疾病控制雜志,2013,17(10):895

[22]李春柱,彭杰,韓翠英,等.維生素D受體基因多態性與新疆哈薩克族結核病的關聯研究[J].石河子大學學報(自然科學版),2010,28(3):330

[23]劉瑋,張翠英,田磊,等.中國漢族人群肺結核易感基因的病例對照研究[J].軍事醫學科學院院刊,2003,27(6):409

[24]陳雪融,馮玉麟,馬玙,等.維生素D受體基因多態性與中國藏族結核病的關聯研究[J].四川大學學報(醫學版),2006,37(6):847

[25]WU F,ZHANG W,ZHANG L,et al.NRAMP1, VDR, HLA-DRB1, and HLA-DQB1 gene polymorphisms in susceptibility to tuberculosis among the Chinese Kazakh population: a case-control study[J].Biomed Res Int,2013:484535

[26]PARK S,KIM EJ,LEE SH,et al.Vitamin D-receptor polymorphisms and non-tuberculous mycobacterial lung disease in Korean patients[J].Int J Tuberc Lung Dis,2008,12(6):698

[27]SINAGA YB,AMIN M,SIREGAR Y,et al.Correlation between Vitamin D receptor gene FOKI and BSMI polymorphisms and the susceptibility to pulmonary tuberculosis in an Indonesian Batak-ethnic population[J].Acta Med Indones,2014,46(4):275

[28]ATES O,DOLEK B,DALYAN L,et al.The association between BsmI variant of vitamin D receptor gene and susceptibility to tuberculosis[J].Mol Biol Rep,2011,38(4):2633

[29]蘇倩，向潁，胡代玉，等.VDR基因多態性、環境因素與重慶地區肺結核病的聯系及交互作用研究[J].局解手術學雜志,2012,21(4):361

[30]馮福民,郭梅,郝金奇,等.維生素D受體基因多態性與漢族人肺結核發病的關系[J].山東醫藥,2009,49(45):4

[31]楊本付,韓長磊.維生素D受體基因多態性與肺結核關系的Meta分析[J].中國熱帶醫學,2006,6(8):1347

(2015-12-09收稿 責任編輯王 曼)

Meta analysis on association between vitamin D receptor gene rs2222570 polymorphisms and tuberculosis risk

SHIJie,ZHUYankun,ZHENGDanwei,MAXiaoguang,WANGShaohua,LIHui,XINGJin,WUCaixia

HenanProvinceCenterforDiseaseControlandPrevention,Zhengzhou450016

tuberculosis;vitamin D receptor gene;rs2222570;meta analysis

Aim: To determine the association of the vitamin D receptor(VDR) gene rs2222570 polymorphisms with the risk of tuberculosis(TB). Methods: We searched for association studies correlating the VDR polymorphisms and TB using pre-established keywords in Database system. Meta analysis was conducted with random effects model or fixed effects model to account for heterogeneity between studies. Twenty studies were included in the VDR gene rs2222570 meta analysis. Data were analyzed in respect to associations between genotypes, alleles, genetic model and TB. Results: The results of meta analysis showed that the risk of TB was decreased in the F allele carriers(OR=0.84，95%CI=0.73～0.95); among Henan population with dominant models, the risk of TB was lower(OR=0.74，95%CI=0.60～0.92).Conclusion: VDR gene rs2222570 polymorphisms may be associated with the risk of TB.

10.13705/j.issn.1671-6825.2016.06.021

*“十二五”科技重大專項課題 2014ZX10003002；河南省科技廳課題

R520.2