劉敏,杜航,宋傲臣,高帥,唐麗杰,蔣燁,李一經
(1.東北農業大學動物科學與技術學院,哈爾濱 150030;2.東北農業大學動物醫學學院,哈爾濱 150030)
鮭魚甲病毒陽性核酸物質制備及RT-PCR檢測方法的建立
劉敏1,杜航1,宋傲臣1,高帥1,唐麗杰2,蔣燁1,李一經2
(1.東北農業大學動物科學與技術學院,哈爾濱150030;2.東北農業大學動物醫學學院,哈爾濱150030)
為建立快速檢測鮭魚甲病毒(Salmonid alphavirus,SAV)RT-PCR方法,根據GenBank公布的E2基因序列(1 375 bp)設計引物,擴增SAV E2全長基因,利用假病毒制備技術獲得包裹E2核酸物質(RNA)的SAV假病毒溶液。以SAV假病毒作為陽性核酸物質質控品,以E2F:5'CCG-TTG-CGG-CCA-CAC-TGG-ATG 3',E2R:5'CCTCAT-AGG-TGA-TCG-ACG-GCA-G 3'為引物,優化反應條件,建立SAV的RT-PCR檢測方法。結果表明,該方法可擴增SAV E2特異性516 bp的DNA片段,引物最適反應濃度為1.0 μmol·L-1,最佳退火溫度為57.5℃,對SAV的三種亞型SAV1(V4640)、SAV2(V4619)、SAV5(V4638)檢測結果均為陽性,對SVCV、IHNV和IPNV的PCR擴增結果均為陰性;并確定對SAV的核酸最低檢出量達1.59 pg;以RT-PCR方法在不同時間對每份樣品作3次重復檢測,檢測結果一致。表明此方法特異性強,敏感性高,穩定性和重復性較好,可用于SAV臨床診斷和檢測。
鮭魚甲病毒;SAV E2;核酸物質;RT-PCR;檢測方法
網絡出版時間2016-7-21 14:09:34[URL]http://www.cnki.net/kcms/detail/23.1391.S.20160721.1409.004.html
劉敏,杜航,宋傲臣,等.鮭魚甲病毒陽性核酸物質制備及RT-PCR檢測方法的建立[J].東北農業大學學報,2016,47(7):56-62.
Liu Min,Du Hang,Song Aochen,et al.Positive nucleic acid material preparation and establishment of a RT-PCR for salmonid alphavirus[J].Journal of Northeast Agricultural University,2016,47(7):56-62.(in Chinese with English abstract)
鮭魚甲病毒(Salmonid alphavirus,SAV)隸屬于披膜病毒科(Togaviridae),甲病毒屬(Alphavirus)[1],主要感染大西洋鮭(Salmo salar)和虹鱒(Oncorhynchus mykiss)等鮭科魚類,引起胰腺、心肌炎癥和昏睡等癥狀,致死率達1%~48%,在魚類養殖各生長階段均有爆發[2-3]。目前該病廣泛流行于蘇格蘭、挪威、愛爾蘭、法國等歐洲國家[4-6],2013年鮭魚甲病毒感染被列入OIE水生動物疫病名錄中?!?br>