DNA數(shù)據(jù)庫(kù)親緣關(guān)系比對(duì)2例分析

劉亞舉，張 博

DNA數(shù)據(jù)庫(kù)親緣關(guān)系比對(duì)2例分析

Analysis of Two Kinship Testing Cases of DNA Database

劉亞舉1，張 博2

法醫(yī)遺傳學(xué)；DNA數(shù)據(jù)庫(kù)；親緣關(guān)系

DNA數(shù)據(jù)庫(kù)經(jīng)過數(shù)年的建設(shè)發(fā)展，庫(kù)容規(guī)模數(shù)量日益增加。由于建設(shè)初期受一些因素制約，致使入庫(kù)STR基因座及其數(shù)量種類繁多，尤其是STR基因座數(shù)量一般維持在16個(gè)以下，隨著DNA數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)容的不斷遞增，就會(huì)給隨機(jī)親緣關(guān)系的匹配帶來一定的風(fēng)險(xiǎn)。作者在兩起失蹤人員認(rèn)定案例中遇到此類問題，報(bào)道如下。

1 案例資料

1.1 簡(jiǎn)要案情 案例1：1995年2月6日，邵某(男)與人發(fā)生口角械斗，殺人后潛逃。案例2：1997年12月15日，李某(男)在本村殺人、砍人后逃跑。啟動(dòng)案件偵破新機(jī)制后，遂即采集其“配偶—子女”樣本，用Identifiler?Plus PCR擴(kuò)增試劑盒(美國(guó)AB公司)檢驗(yàn)后錄入全國(guó)DNA數(shù)據(jù)庫(kù)。1周后，該系統(tǒng)的15個(gè)基因座無容差比中數(shù)條數(shù)據(jù)，其中案例1分別比中外省庫(kù)的1個(gè)陌生男和1個(gè)陌生女，案例2比中本省庫(kù)的1個(gè)陌生男和外省庫(kù)的1個(gè)陌生男(見表1)。

1.2 復(fù)核檢驗(yàn)及結(jié)果 收集上述樣本，使用sbeadex?法醫(yī)試劑盒(英國(guó)LGC公司)提取基因組DNA，采用STRtyper-21G試劑盒(寧波海爾施基因科技有限公司)進(jìn)行STR檢驗(yàn)，發(fā)現(xiàn)兩個(gè)案例所比中的親緣關(guān)系分別在Penta E、Penta D、D12S391、D6S1043、D1S1656等5個(gè)基因座不符合遺傳規(guī)律(見表2)。同時(shí)增加Yfiler?Plus試劑盒(美國(guó)AB公司)進(jìn)行Y染色體檢驗(yàn)，其中案例1陌生女未檢出STR分型，其余均與孩子不符合遺傳規(guī)律。

表1 Identifiler? Plus試劑盒STR分型結(jié)果

注：左側(cè)為案例1，右側(cè)為案例2。

表2 STRtyper-21G試劑盒5個(gè)基因座的STR分型結(jié)果

注：左側(cè)為案例1，右側(cè)為案例2。

2 討論

本文案例所涉及的親緣關(guān)系，根據(jù)Identifiler?Plus系統(tǒng)15個(gè)基因座得到的累計(jì)親權(quán)指數(shù)遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于10 000，按《法庭科學(xué)DNA親子鑒定規(guī)范》(GA/T965-2011)中有關(guān)規(guī)定，是支持親權(quán)關(guān)系的存在，但STRtyper-21G和Yfiler?Plus系統(tǒng)檢驗(yàn)結(jié)果卻否定了上述結(jié)論。案例1中，符合遺傳關(guān)系的比對(duì)對(duì)象顯示為女性，懷疑是男性系Y片段缺失[1]，但后續(xù)的檢驗(yàn)證明應(yīng)為錯(cuò)判，由于Amelogenin基因座的Y片段位于Y染色體短臂區(qū)，為避免此類現(xiàn)象的出現(xiàn)，建議PCR擴(kuò)增系統(tǒng)增加長(zhǎng)臂區(qū)的DYS391(最小單倍型)或Y-indel(缺失/插入)。

隨著歐洲標(biāo)準(zhǔn)(ESS)的推廣，美國(guó)FBI對(duì)CODIS基因座重新進(jìn)行了評(píng)估升級(jí)，并最終確立了含20個(gè)STR基因座的擴(kuò)展核心基因座。而國(guó)內(nèi)DNA數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)容也迅猛增加，原有的15個(gè)基因座已不能滿足親緣關(guān)系比對(duì)需要[2]，如案例1、2，為了防范此類案件的風(fēng)險(xiǎn)，既要與國(guó)際接軌，又要適合中國(guó)人群的STR檢測(cè)體系，同時(shí)節(jié)約檢驗(yàn)成本，可以通過以下措施來進(jìn)行：①檢驗(yàn)體系應(yīng)包含20個(gè)以上的常染色體基因座，在傳承原CODIS基因座的基礎(chǔ)上，增加非父排除率較高的基因座[3]，最好有Penta D和Penta E[4]，以此提高系統(tǒng)效能，且基因座的等位基因分布符合中國(guó)人群特點(diǎn)。②可以采用6色熒光標(biāo)記技術(shù)，根據(jù)SNP和InDel二等位基因標(biāo)記具有分布廣泛、遺傳穩(wěn)定、突變率低、易于分析等優(yōu)點(diǎn)，再增加5～7個(gè)SNP或InDel基因座到上述系統(tǒng)作為補(bǔ)充檢驗(yàn)，以此來滿足突變的結(jié)果解釋[5]，同時(shí)SNP或InDel最小等位基因頻率要接近于0.5。③增加線粒體、X-STR、Y-STR輔助檢驗(yàn)[6-7]，解決復(fù)雜親緣關(guān)系鑒定。

總之，隨著DNA檢驗(yàn)技術(shù)的精確化，為使疑難生物檢材達(dá)到高效、全方位檢驗(yàn)和分析，避免后續(xù)復(fù)核工作無法延續(xù)，以利于親緣關(guān)系比對(duì)等拓展功能的應(yīng)用，因此DNA實(shí)驗(yàn)室PCR擴(kuò)增試劑要多樣化，且快速方便各種檢驗(yàn)數(shù)據(jù)的入庫(kù)查詢，最終大量的DNA檢驗(yàn)信息使生物物證的作用最大化，滿足各種DNA信息的傳承和利用。

[1] 劉亞舉，張俊濤，徐超，等.男性個(gè)體Amelogenin基因座變異1例[J].中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志，2012，27(6)：508-509.

[2] 張慶霞，劉雅誠(chéng).DNA數(shù)據(jù)庫(kù)中失蹤人員親屬“錯(cuò)中”信息的分析研究[A].DNA數(shù)據(jù)庫(kù)建設(shè)應(yīng)用成果與展望Ⅱ[C].北京:中國(guó)人民公安大學(xué)出版社，2011：169-171.

[3] 伍新堯，楊慶恩，劉雅誠(chéng)，等.親權(quán)鑒定判斷標(biāo)準(zhǔn)和結(jié)論表述的建立[J].中山大學(xué)學(xué)報(bào):醫(yī)學(xué)科學(xué)版，2010，31(1)：20-22.

[4] 伍新堯.高級(jí)法醫(yī)學(xué)[M].2版.鄭州：鄭州大學(xué)出版社,2011：426-427.

[5] 任賀，郭劍章，陳星，等.3個(gè)STR基因座變異親子鑒定1例[J].法醫(yī)學(xué)雜志，2010，26(6)：479-480.

[6] 劉亞舉，張俊濤，李瑾，等.X-STR聯(lián)合常染色體STR用于親緣關(guān)系鑒定1例[J].中國(guó)司法鑒定，2014，76：123-124.

[7] 劉亞舉，張俊濤.Y-STR家系排查2例[J].法醫(yī)學(xué)雜志，2014，30(6)：476-477.

2014-12-12

1.許昌市公安局刑事科學(xué)技術(shù)研究所，河南許昌 461000 2.禹州市公安局刑偵大隊(duì)，河南禹州 461670

劉亞舉(1978-)，男，河南襄城人，副主任法醫(yī)師，從事DNA檢驗(yàn)及法醫(yī)遺傳學(xué)統(tǒng)計(jì)工作。

DF795.2

B

1672-688X(2015)01-0070-03