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一株聚乳酸降解菌的鑒定

2015-04-20 01:28:30時東方陳麗娜
長春師范大學學報 2015年10期

崔 婧 ,時東方,王 強,陳麗娜,陳 珊

(1.長春師范大學中心實驗室,吉林長春 130032;2.東北師范大學生命科學學院,吉林長春 130024)

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一株聚乳酸降解菌的鑒定

崔 婧1,2,時東方1,王 強1,陳麗娜1,陳 珊2

(1.長春師范大學中心實驗室,吉林長春 130032;2.東北師范大學生命科學學院,吉林長春 130024)

本文從活性污泥中篩選到一株可以降解PLA的細菌DS04—W,通過形態學、生理生化性質以及16SrDNA序列分析進行菌種鑒定,初步鑒定該菌為Bacillus megaterium(巨大芽孢桿菌),并且具有降解PLA的能力,這為進一步研究酶解PLA的機理奠定了基礎。

聚乳酸 ;巨大芽孢桿菌;鑒定

全球經濟高速發展的今天,對塑料制品的需求在不斷增加,但是一般塑料制品在自然界中很難被降解,所以造成現在“白色污染”越來越嚴重,破壞了生態平衡,嚴重威脅人類的健康[1]。近年來人們開始關注可降解塑料,目前已開發的生物可降解塑料主要是聚酯類材料,其中聚乳酸(PLA)以良好的物理化學性能、機械性能及生物相容性受到廣泛關注[2]。雖然PLA在很多物理性能和機械性能上優于其他聚酯類材料,但是自然界中發現的能夠降解PLA的微生物數量很少,不到0.04%[3-5]。目前為止,人們分離得到能夠降解PLA的菌株只有幾十種,絕大部分都屬于放線菌,包括Amycolatopsis屬[6-8]、Saccharothrixwaywayandensis屬[9]和Kibdelosporangiumaridum屬[10]等,只有少量細菌和真菌可以降解PLA。本實驗是從自然界中篩選出一株可以降解PLA的細菌,通過形態學、生理生化性質以及16SrDNA序列分析進行菌種鑒定,并研究其降解PLA的能力,這為進一步研究細菌降解PLA的機理奠定了基礎。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 聚乳酸(PLA)材料

PLA膜和PLA粉末由中國科學院長春應用化學研究所提供,相對分子量2.074 105。

1.1.2 培養基

(1)基本培養基 NaCl 0.1g·L-1,CaCl2·2H2O 0.02g·L-1,FeSO4·7H2O 0.01g·L-1,酵母提取物 0.25g·L-1,(NH4)2SO41g·L-1, MgSO4·7H2O 0.2g·L-1,MnSO40.5mg·L-1, Na2WO40.5mg·L-1, Na2MoO4·2H2O 0.5mg·L-1, pH=8.0。

(2)PLA培養基 10ml氯仿中加入0.1gPLA粉末,溶解后,加入0.01g Plysurf A210G和 100ml基本培養基?;靹蚝笥贸暡毎扑閮x處理,工作時間7s,間隔時間6s,處理50次。處理后,將乳化液放在磁力攪拌器上,60℃加熱90分鐘,蒸去氯仿,最后用基本培養基定容到100ml,得到PLA培養基[12]。

1.2 方法

1.2.1 菌種的分離純化

取10g活性污泥,接入到以PLA為唯一C源的100ml富集培養基中,在37℃下搖床培養,取1ml的培養液稀釋涂布于PLA固體培養基平板上進行分離純化。

1.2.2 降解PLA膜實驗

將PLA膜(1.0cm×1.0cm)滅菌,再放入滅菌的100ml基本培養基中;接入一定量的菌液,在37℃,150r·min-1條件下培養3d。

1.2.3 菌種鑒定

根據《常見細菌鑒定手冊》進行形態學和生理生化特性的鑒定[11]。

菌株16S rDNA鑒定及系統發育分析:將細菌的基因組DNA提取,進行PCR擴增,純化,測序工作由上海生物工程有限公司完成。將菌株的16S rDNA序列在NCBI數據庫中進行Blast比對,使用MEGA 3.1軟件來構建系統發育樹。

1.2.4 PLA降解酶活力的測定

取0.1g·ml-1的PLA乳化液1m,與等體積粗酶液混合,37℃保溫24h,然后用L—乳酸試劑盒(南京建成)測定上清中乳酸含量。PLA降解生成乳酸,所以通過計算乳酸生成量來說明PLA降解酶的活力。同時與滅活的酶液做對照[12]。

2 結果與分析

2.1 菌種分離純化與PLA膜降解能力的測定

從活性污泥中篩選到一株能降解PLA的菌株,命名為DS04—W。該菌對PLA膜具有降解作用,通過掃描電鏡觀察PLA膜,發現在降解前后PLA膜有顯著不同,降解后PLA膜表面凹凸不平,膜上有裂紋出現,透明度下降,并且可以觀察到膜的表面有菌生長。

A.PLA膜降解前1000× B.PLA膜降解后2000×

2.2 PLA降解菌的鑒定

2.2.1 形態學鑒定

顯微鏡下觀察菌體成短桿狀、有芽孢、革蘭氏染色為陰性,菌落成透明、圓形、表面光滑隆起狀(圖2)。

圖2 DS04-W菌株的形態觀察

2.2.2 生理生化特征

參照《常見細菌鑒定手冊》結果,如表1所示。

表1 DS04-W的生理生化性質

注:“-”表示結果為陰性;“+”表示結果為陽性。

2.2.3 16S rDNA 基因序列分析

對菌株的16S rDNA序列進行擴增和測定,得到1514bp核苷酸序列。進行Blast比對,發現與Bacillus sp. 19497和BacillusmegateriumTS IW36 的16S rDNA的同源性為99%。對其進行系統發育分析,構建以16S rDNA序列為基礎的系統發育樹,如圖3所示。

圖3 DS04-W 的系統發育樹

3 結論

從活性污泥中篩選到一株可以降解PLA的菌株DS04-W,用掃描電鏡觀察其降解PLA膜的能力,發現降解前后PLA膜有顯著變化,證實菌株確實對PLA具有降解能力。

根據《常見細菌系統鑒定手冊》,從形態學和生理生化性質上進行鑒定,發現菌株屬于芽孢桿菌屬,結合16S rDNA序列分析,發現與Bacillus sp. 19497和Bacillus megaterium TS IW36的同源性為99%,因此鑒定菌株DS04-W是Bacillus megaterium(巨大芽孢桿菌)。

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Identification of Poly (L-lactic acid) Degrading Microorganism

CUI Jing1,2, SHI Dong-fang1, WANG Qiang1, CHEN Li-na1,CHEN Shan2

(1.Changchun Normal University, Changchun Jilin 130032,China;2.Life Sciences of Northeast University, Changchun Jilin 130024, China)

A strain possessing activity to degrade poly-L-lactic acid (PLA) DS04-W was screened from sludge.It was identified by the analyses of morphological, physiological and biochemical properties, 16SrDNA comparison. It was identified as Bacillus megaterium.Strains DS04′ - W has the ability of degradation PLA. It established the foundation for the further research on enzymic hydrolysis PLA.

Poly (L-lactic acid); Bacillus megaterium;identification

2015-06-27

崔 婧(1986- ),女,吉林長春人,長春師范大學中心實驗室助理實驗師,碩士,從事生物化學與分子生物學研究。

Q93-331

A

2095-7602(2015)10-0062-04

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