版納微型豬近交系PPARD基因克隆及95G/A突變檢測*

陳園園，王 配△，霍金龍*，王淑燕，潘偉榮，施 晨，程 霞，曾養志，2

(1. 云南農業大學 云南省版納微型豬近交系重點實驗室，云南 昆明 650201；2. 云南農業大學 動物科學技術學院，云南 昆明 650201)

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科學研究

版納微型豬近交系PPARD基因克隆及95G/A突變檢測*

陳園園1,2，王 配1,2△，霍金龍1,2*，王淑燕1,2，潘偉榮1,2，施 晨1，程 霞1，曾養志1，2

(1. 云南農業大學 云南省版納微型豬近交系重點實驗室，云南 昆明 650201；2. 云南農業大學 動物科學技術學院，云南 昆明 650201)

為深入研究PPARD在豬體內的調節和功能，以版納微型豬近交系(BMI)為試驗動物，通過RT-PCR方法擴增得到PPARD基因全長編碼區序列，在編碼區第95位檢測到A/G兩種核苷酸(GenBank登錄號:KP757025、KP757026)。結果表明，該基因編碼462個氨基酸，蛋白分子量為49.74 kD，等電點為7.53。蛋白質結構分析PPARD存在2個保守域，無跨膜結構，不存在信號肽，存在1個亮氨酸富集的核輸出信號，其N端、C端均親水；亞細胞定位顯示該蛋白分泌到細胞周質的概率為69.6%。系統進化分析表明豬與牛、犬的親緣關系較近。利用qPCR檢測了PPARD基因mRNA在BMI 14個組織中的表達量，發現在肝臟、耳朵、脾臟、小腸中表達量較高。

PPARD；基因克隆；熒光定量PCR；生物信息學分析

耳朵是動物聽覺系統的重要部分，起著收集聲音的重要作用。然而不同的豬種耳朵大小不同，比如產于美國的杜洛克豬具有一副小且豎直的耳朵，而產于我國太湖地區的二花臉豬具有一副大且松軟的耳朵。Ren等[1]研究表明，PPARD(peroxisome proliferator activator receptor delta，過氧化物酶體增殖物激活受體δ)編碼區c. G95A是杜洛克豬和二花臉豬耳朵大小差異的主要QTL位點，PPARD基因第95位核苷酸G突變為A，導致PPARD編碼蛋白的第32位氨基酸由甘氨酸(G，Gly)突變為谷氨酸(E, Glu)，杜洛克豬為c.95G對應p.32Gly，而二花臉豬為c.95A對應p.32Glu。……