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CCR2和CCR5基因多態性與結核性膿胸的關系

2015-03-07 01:17:07徐偉樂李輝秦學博侯宏偉齊海亮
疑難病雜志 2015年2期

徐偉樂,李輝,秦學博,侯宏偉,齊海亮

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CCR2和CCR5基因多態性與結核性膿胸的關系

徐偉樂,李輝,秦學博,侯宏偉,齊海亮

目的 探討CCR2基因-190 G/A和CCR5基因-59029 G/A單核苷酸多態性(SNP)與結核性膿胸的關系。方法 采用聚合酶鏈反應—限制性片段長度多態性(PCR-RFLP)方法對結核性膿胸患者300例和健康對照組300例進行CCR2基因-190 G/A和CCR5基因-59029 G/A SNPs檢測。結果 與CCR2基因-190 GG基因型相比,攜帶AG和AA基因型均可增加結核性膿胸發病風險(OR=2.254,95%CI 1.043~4.868;OR=8.728,95%CI 4.224~18.033)。進行分層分析發現,無卡介苗(BCG)接種史、體質量指數(BMI)<18.5 kg/m2均增加結核性膿胸發病風險(OR=3.309,95%CI 2.108~4.382;OR=2.767,95%CI 1.918~3.993)。CCR5基因-59029 G/A 各基因型未入選回歸方程,無統計學意義(P>0.05)。結論CCR2基因-190G/ASNP可能與結核性膿胸的發病風險有關;CCR5基因-59029G/ASNP可能與結核性膿胸無關。

結核性膿胸;CCR2基因;CCR5基因;單核苷酸多態性

【DOI】 10.3969 /j.issn.1671-6450.2015.02.009

結核性膿胸為胸膜腔結核桿菌嚴重感染,并產生膿性滲出液積聚所致,發病率近年來呈明顯上升趨勢。結核桿菌侵犯胸膜組織的過程,是由多種細胞因子參與的細胞免疫過程。CCR2和CCR5作為重要的CC趨化因子受體,具有調控T細胞和單核細胞/巨噬細胞系遷移、增殖與免疫的功能,在炎性反應部位募集和活化免疫細胞中扮演了重要角色。現采用PCR-RFLP方法對結核性膿胸患者進行CCR2基因-190 G/A和CCR5基因-59029 G/A 單核苷酸多態性(SNPs)的研究,報道如下。

1 資料與方法

1.1 臨床資料 2011年1月—2014年1月于河北省胸科醫院微創外科行手術治療結核性膿胸患者300例,術后標本均經病理學證實,同時排除HIV感染者、糖尿病、高血壓、冠心病及有家族遺傳史患者。病程9~12個月,中位數10個月。其中男165例,女135例,年齡23~60歲,中位年齡41.5歲。同期在河北省胸科醫院體檢中心健康體檢者300例為健康對照組,其中男159例,女141例,年齡28~59歲,中位年齡43.5歲。2組性別、年齡比較差異無統計學意義(P>0.05),具有可比性。2組對象性別、年齡、卡介苗(BCG)接種史、體質量指數(BMI)狀況在經當事人知情同意前提下由專門的登記員詢問調查。

1.2 觀測方法

1.2.1DNA提取: 采集每位對象靜脈血5ml,經枸櫞酸鈉抗凝,置4℃冰箱保存,并于采血后1周內提取外周血白細胞DNA。采用蛋白酶K消化—飽和氯化鈉鹽析法。具體操作程序如下:外周血5ml加冷蒸餾水至50ml,2 500r/min室溫離心10min,棄上清。重復2~3次至紅細胞完全裂解。加入預冷的0.1%Triton-X100 45ml同上離心去上清,洗滌1~2次。沉淀加3mlDNA提取液,充分混勻,懸浮白細胞,加10%SDS150μl(終濃度0.5%)劇烈振蕩至無凝塊。加入蛋白酶K至終濃度為100μg/ml(1mg/ml約400μl),混勻,37℃消化過夜。然后,加入5mol/L的NaCl1.2ml,劇烈振蕩15s,2 500r/min室溫離心15min。將上清倒入另一離心管中,棄沉淀。上清中加入100%乙醇8ml,反復顛倒混勻,置DNA至高壓滅菌的Eppendorf管中,以70%乙醇洗滌1~2次,倒置Eppendorf管并使乙醇揮發干凈。以200μlTE溶解DNA,4℃至少放置24h,徹底溶解后經電泳或測OD值定量。

1.2.2PCR擴增:CCR2基因-190G/A和CCR5基因-59029G/A引物均參考文獻[1,2]設計,由上海伯昊生化科技有限公司合成。-190G/A上游引物序列:5'-CATTGCAATCCCAAAGACCCACTC-3',下游引物序列:5'-TTGGTTTTGTGGGCAACATGATGG-3'。-59029G/A上游引物序列:5'-CCCGTGAGCCCATAGTTAAAACTC-3',下游引物序列:5'-TCACAGGGCTTTTCAACAGTAAGG-3'。反應條件:預變性94℃ 5min、94℃變性30s、退火溫度(-190G/A為56℃、-59029G/A為62℃) 30s、72℃ 延伸30s35個循環后,最后72℃延伸 5min。1.2.3 擴增產物的限制性酶切: 分別應用BsaBI酶對-190G/A擴增產物,Bspl2861酶對-59029G/A擴增產物進行酶切,分別取酶切產物在3%(-190G/A)和2%(-59029G/A)瓊脂糖凝膠上進行電泳,以100bpMarker為參照,紫外燈下觀察、拍照并分析其結果。

1.3 統計學方法 采用SPSS19.0版軟件對數據進行統計分析處理。比較各位點基因型頻率的觀察值與預期值并進行卡方檢驗及Hardy-Weinberg平衡分析。以二元Logistic回歸法計算相對風險度的比值比(oddsratio,OR)及95%可信區間(confidenceinterval,CI)。P<0.05為差異有統計學意義。

2 結 果

2.1 基因型分析 (1)健康對照組-190G/A和-59029G/A位點的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),表明樣本來自于同一人群,具有群體代表性。(2)結核性膿胸患者CCR2基因-190G/A位點的PCR擴增片段長度為173bp,酶切產物進行電泳,AA基因型僅見1條173bp電泳帶,AG基因型顯示為173bp、149bp和24bp(24bp不顯示) 3條帶,GG基因型表現為149bp和24bp(24bp不顯示) 2條帶(圖1)。CCR5基因-59029G/A位點的PCR擴增片段長度為268bp,酶切產物進行電泳,AA基因型僅見1條268bp電泳帶,AG基因型可見3條帶分別為268bp、137bp和131bp,GG基因型表現為137bp和131bp2條帶(圖2)。

注:M.Marker;1,3,7.AA;4,6,11.AG;2,5,8,9,10.GG

注:M.Marker;1,2,4.AA;3,6.AG;5,7.GG

2.2Logistic回歸分析 將BCG接種史、BMI、CCR2基因-190G/A各基因型和CCR5基因-59029G/A各基因型作為自變量,結核性膿胸組和健康對照組作為因變量代入二分類Logistic回歸方程,計算OR值和95%可信區間。分析發現,對于-190G/A位點,與GG基因型相比,攜帶AG和AA基因型均可明顯增加結核性膿胸發病風險(OR=2.254, 95%CI1.043~4.868和OR=8.728, 95%CI4.224~18.033)。進一步分層分析發現,無BCG接種史、BMI<18.5kg/m2均可增加結核性膿胸發病風險(OR=3.309, 95%CI2.108~4.382和OR=2.767, 95%CI1.918~3.993),見表1。對于-59029G/A位點,各基因型未選入回歸方程,無統計學意義(P>0.05),表明-59029G/ASNP與結核性膿胸的發病風險無明顯相關性。見表2。

表1 回歸方程中的變量

表2 不在回歸方程中的變量

3 討 論

CCR2是單核細胞趨化蛋白-1(MCP-1)的特異受體,編碼355個氨基酸殘基蛋白,在各種細胞類型上都有發現。MCP-1與CCR2結合后可趨化多種炎性細胞,除單核/巨噬細胞外,還包括記憶和殺傷T淋巴細胞、NK細胞、嗜酸性粒細胞、嗜堿性粒細胞、樹突狀細胞等至炎性病灶而發揮免疫作用。CCR2基因存在多個研究SNP位點,其中位于啟動子區的-190G/ASNP可引起不同程度的轉錄活性改變,從而影響其蛋白表達水平及功能,進一步影響個體間對疾病遺傳易感性的差異。Sezgin等[1]發現-190G/A位點各基因型在慢性腎衰竭患者和正常人群中分布有顯著性差異,增加慢性腎衰竭發病風險。Miyagishi等[3]發現在日本人群中-190位點G→A突變與多發性硬化的發生呈負相關。關于此位點與結核病關系的研究,國內外已有報道,結論不盡一致,韓銳等[4]采用病例對照研究,應用MassARRAY技術對-190G/A位點進行基因研究,發現CCR2基因-190G/ASNP與中國漢族兒童結核病易感不存在相關性。而在對印度中北部Sahariya部落人群的研究中顯示[5],對照組的AA基因型和A等位基因的頻率明顯高于結核病組,AA基因型對于結核病具有保護作用。本研究通過對中國河北地區結核性膿胸患者與健康對照組的病例—對照研究發現,CCR2基因-190G/ASNP與結核性膿胸發病風險相關,即攜帶A等位基因會增加結核性膿胸的發病風險,進一步通過分層分析發現,無卡介苗接種史、BMI<18.5kg/m2增加人群患結核性膿胸的風險。造成各研究結果的差異可能原因如下:(1)CCR2基因-190G/ASNP本身是一種功能性還是無意義性突變仍未成定論;(2)樣本量的大小不同;(3)不同人群、種族基因型分布頻率的多樣性。

總之,結核性膿胸的發病是一個多因素參與的錯綜復雜的過程,其中易感基因多態性影響人類對結核性膿胸易感性。限于樣本量、遺傳背景差異等因素,報道結果存在差異。因此,大樣本量、不同種族人群的進一步研究對闡明SNP在結核性膿胸發生機制中的作用具有重要的意義。

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3MiyagishiR,NiinoM,FukazawaT,etal.C-Cchemokinereceptor2genepolymorphisminJapanesepatientswithmultiplesclerosis[J].Neuroimmunol,2003,145(1/2):135-138.

4 韓銳,綦輝,孫琳,等.CCR2、CCL5、CCR5和CCL1基因多態性與中國漢族兒童結核病易感性的關聯研究[J].標記免疫分析與臨床,2014,21(2):171-175.

5MishraG,PoojarySS,RajP,etal.GeneticpolymorphismsofCCL2,CCL5,CCR2andCCR5genesinSahariyatribeofNorthCentralIndia:anassociationstudywithpulmonarytuberculosis[J].InfectGenetEvol,2012,12(5):1120-1127.

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Association of CCR2 gene and CCR5 gene polymorphisms with the risk of tuberculous empyema

XUWeile,LIHui,QINXuebo,HOUHongwei,QIHailiang.

DepartmentofMinimallyInvasiveSurgery,HebeiThoracicHospital,Shijiazhuang050041,ChinaCorrespondingauthor:QIHailiang,E-mail:kk20140612@126.com

Objective To investigate the relationship of CCR2 gene-190 G/A, CCR5 gene-59029 G/A single nucleotide polymorphism (SNP) and tuberculous empyema.Methods Using polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method, 300 cases of tuberculous empyema patients and 300 healthy control were received 190 G/A and 59029 G/A SNPs detection.Results Compared to CCR2 gene-190 GG genotype, carrying AG and AA genotype can increase the risk of tuberculous empyema (OR=2.254, 95%CI 1.043-4.868; OR=8.728, 95%CI 4.224-18.033). Stratified analysis revealed that, without Bacillus Calmette Guerin (BCG) vaccination history, body mass index (BMI) <18.5 kg/m2were all increased the risk of tuberculous empyema (OR=3.309, 95%CI 2.108-4.382; OR=2.767, 95%CI 1.918-3.993). CCR5 gene-59029 G/A genotypes were not selected in the regression equation, no statistical significance was found (P>0.05). Conclusion CCR2 gene-190 G/A SNP might be related to the tuberculous empyema. CCR5 gene-59029 G/A SNP may have no association with tuberculous empyema.

Tuberculous empyema; CCR2 gene; CCR5 gene; Single nucleotide polymorphism

050041 石家莊,河北省胸科醫院微創外科

齊海亮,E-mail:kk20140612@126.com

2014-11-08)

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